Protein–RNA interactions for Protein: Q0P6D6

CCDC15, Coiled-coil domain-containing protein 15, humanhuman

Predictions only

Length 951 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC15Q0P6D6 ZSCAN30-208ENST00000592278 731 ntTSL 4 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CCDC15Q0P6D6 METTL26-214ENST00000614890 801 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CCDC15Q0P6D6 TOMM40L-201ENST00000367987 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CCDC15Q0P6D6 NUDT4-201ENST00000337179 9753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CCDC15Q0P6D6 ABCB7-202ENST00000339447 2234 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CCDC15Q0P6D6 HIC2-202ENST00000407598 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CCDC15Q0P6D6 TBC1D24-205ENST00000567020 6673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CCDC15Q0P6D6 NADSYN1-216ENST00000530055 2416 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CCDC15Q0P6D6 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CCDC15Q0P6D6 USP28-214ENST00000545540 3431 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CCDC15Q0P6D6 JPH4-201ENST00000356300 4278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CCDC15Q0P6D6 FGFR3-203ENST00000352904 3733 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CCDC15Q0P6D6 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CCDC15Q0P6D6 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
CCDC15Q0P6D6 RUBCNL-204ENST00000378797 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCDC15Q0P6D6 SCFD2-201ENST00000388940 2221 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCDC15Q0P6D6 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCDC15Q0P6D6 KRAS-202ENST00000311936 5765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCDC15Q0P6D6 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCDC15Q0P6D6 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCDC15Q0P6D6 LBX2-201ENST00000341396 886 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCDC15Q0P6D6 ZCCHC17-202ENST00000373714 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCDC15Q0P6D6 APBB1IP-202ENST00000376236 2771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCDC15Q0P6D6 AC005229.1-201ENST00000392885 409 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
CCDC15Q0P6D6 DRC3-203ENST00000399187 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCDC15Q0P6D6 AC112492.5-201ENST00000421897 457 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
CCDC15Q0P6D6 PRSS42-202ENST00000447340 1280 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCDC15Q0P6D6 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCDC15Q0P6D6 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCDC15Q0P6D6 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCDC15Q0P6D6 HILS1-202ENST00000545329 423 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
CCDC15Q0P6D6 AC008969.1-205ENST00000553254 876 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCDC15Q0P6D6 GCHFR-206ENST00000561160 572 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCDC15Q0P6D6 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCDC15Q0P6D6 SNHG15-207ENST00000582727 1039 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCDC15Q0P6D6 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCDC15Q0P6D6 LMX1B-201ENST00000355497 5809 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCDC15Q0P6D6 SLC9A3P3-201ENST00000457608 2229 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
CCDC15Q0P6D6 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCDC15Q0P6D6 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCDC15Q0P6D6 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCDC15Q0P6D6 TARSL2-201ENST00000335968 3610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCDC15Q0P6D6 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCDC15Q0P6D6 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCDC15Q0P6D6 CTXND1-201ENST00000560778 6890 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCDC15Q0P6D6 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCDC15Q0P6D6 RSPH9-202ENST00000372165 2586 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCDC15Q0P6D6 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCDC15Q0P6D6 PPP1R12A-AS1-201ENST00000552885 3234 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCDC15Q0P6D6 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCDC15Q0P6D6 CYP20A1-203ENST00000429815 1812 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCDC15Q0P6D6 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC15Q0P6D6 PRDM15-201ENST00000269844 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC15Q0P6D6 WDR1-203ENST00000382452 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC15Q0P6D6 AFAP1L1-205ENST00000515000 2319 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC15Q0P6D6 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC15Q0P6D6 GOLGA2-212ENST00000609374 2973 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC15Q0P6D6 UBR5-201ENST00000220959 9418 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC15Q0P6D6 PIGS-203ENST00000395346 2815 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC15Q0P6D6 NHEG1-202ENST00000432330 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC15Q0P6D6 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC15Q0P6D6 HDAC2-206ENST00000519108 2000 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC15Q0P6D6 LRRN1-201ENST00000319331 3823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC15Q0P6D6 PRSS30P-201ENST00000390681 2881 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC15Q0P6D6 TJP3-202ENST00000541714 3350 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC15Q0P6D6 WDR33-201ENST00000322313 9471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC15Q0P6D6 HTR3A-206ENST00000506841 2221 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC15Q0P6D6 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC15Q0P6D6 PLXDC1-201ENST00000315392 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC15Q0P6D6 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC15Q0P6D6 C9orf47-201ENST00000334490 4829 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC15Q0P6D6 SDR42E2-201ENST00000602312 2630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC15Q0P6D6 MGST3-203ENST00000367885 680 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC15Q0P6D6 TEX30-203ENST00000376022 828 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC15Q0P6D6 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC15Q0P6D6 ARRB2-203ENST00000381488 1236 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC15Q0P6D6 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC15Q0P6D6 AC018467.1-201ENST00000421581 717 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC15Q0P6D6 GNB3-202ENST00000435982 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC15Q0P6D6 BRF2-202ENST00000520601 1192 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC15Q0P6D6 MIR5189-201ENST00000577370 114 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC15Q0P6D6 ANAPC11-216ENST00000579133 563 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC15Q0P6D6 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC15Q0P6D6 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC15Q0P6D6 TELO2-201ENST00000262319 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC15Q0P6D6 ITSN1-212ENST00000399367 5722 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC15Q0P6D6 GNAO1-202ENST00000262494 5767 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC15Q0P6D6 SLC27A4-201ENST00000300456 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC15Q0P6D6 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC15Q0P6D6 UNQ6494-202ENST00000617436 2163 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC15Q0P6D6 MCL1-202ENST00000369026 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC15Q0P6D6 CEP131-208ENST00000575907 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC15Q0P6D6 SIGLEC5-201ENST00000534261 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC15Q0P6D6 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC15Q0P6D6 ATG4B-206ENST00000405546 3294 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC15Q0P6D6 NDRG4-217ENST00000562999 2931 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC15Q0P6D6 HTR7-202ENST00000336152 3126 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC15Q0P6D6 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC15Q0P6D6 MPI-203ENST00000535694 1523 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC15Q0P6D6 RAB29-201ENST00000235932 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.7 ms