Protein–RNA interactions for Protein: Q08289

CACNB2, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNB2Q08289 AC234644.1-201ENST00000406065 370 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
CACNB2Q08289 MIR1227-201ENST00000408484 88 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
CACNB2Q08289 AL672291.1-201ENST00000417047 462 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CACNB2Q08289 LAMA4-208ENST00000431543 1080 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CACNB2Q08289 HLA-DQB2-232ENST00000437316 1214 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CACNB2Q08289 AC004869.1-201ENST00000440935 540 ntTSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CACNB2Q08289 MYLK-AS1-202ENST00000470449 760 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CACNB2Q08289 AC105362.1-201ENST00000511234 564 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CACNB2Q08289 ANXA5-210ENST00000515017 1190 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CACNB2Q08289 FANCA-205ENST00000543736 1000 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CACNB2Q08289 AC005357.2-202ENST00000590507 1060 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
CACNB2Q08289 AC008687.1-201ENST00000591656 786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CACNB2Q08289 BX088702.1-201ENST00000610784 235 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
CACNB2Q08289 AL132780.4-201ENST00000624870 1135 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
CACNB2Q08289 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CACNB2Q08289 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CACNB2Q08289 CHCHD7-202ENST00000355315 1535 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CACNB2Q08289 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CACNB2Q08289 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CACNB2Q08289 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CACNB2Q08289 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CACNB2Q08289 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CACNB2Q08289 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CACNB2Q08289 DLEU2-201ENST00000235290 1739 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CACNB2Q08289 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CACNB2Q08289 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CACNB2Q08289 CYP4B1-202ENST00000371919 1494 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CACNB2Q08289 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CACNB2Q08289 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CACNB2Q08289 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CACNB2Q08289 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CACNB2Q08289 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CACNB2Q08289 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CACNB2Q08289 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CACNB2Q08289 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CACNB2Q08289 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CACNB2Q08289 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CACNB2Q08289 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CACNB2Q08289 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CACNB2Q08289 PIGL-201ENST00000225609 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CACNB2Q08289 HIST1H1B-201ENST00000331442 681 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CACNB2Q08289 HFE-203ENST00000336625 804 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CACNB2Q08289 PPDPF-202ENST00000370179 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CACNB2Q08289 Z69890.1-201ENST00000382990 339 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
CACNB2Q08289 CD300A-204ENST00000392625 1163 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CACNB2Q08289 ZFAND2B-205ENST00000409319 771 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CACNB2Q08289 BANF1P3-201ENST00000412556 261 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
CACNB2Q08289 IGF1-205ENST00000424202 612 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CACNB2Q08289 CHCHD2P9-201ENST00000461726 456 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
CACNB2Q08289 LRRC75A-AS1-209ENST00000481027 1016 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CACNB2Q08289 AL157792.1-201ENST00000488281 530 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
CACNB2Q08289 NAPSB-201ENST00000525179 678 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CACNB2Q08289 FXYD2-205ENST00000528014 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CACNB2Q08289 AC093752.3-201ENST00000567343 901 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
CACNB2Q08289 LRRC75A-AS1-226ENST00000582911 879 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CACNB2Q08289 AC011472.1-201ENST00000588634 569 ntTSL 4 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CACNB2Q08289 AC133540.1-201ENST00000620845 1019 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
CACNB2Q08289 DDX5-235ENST00000630471 473 ntTSL 4 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CACNB2Q08289 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CACNB2Q08289 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CACNB2Q08289 PAK1IP1-201ENST00000379568 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CACNB2Q08289 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CACNB2Q08289 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CACNB2Q08289 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CACNB2Q08289 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CACNB2Q08289 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CACNB2Q08289 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CACNB2Q08289 SLC25A20-202ENST00000430379 1576 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CACNB2Q08289 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CACNB2Q08289 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CACNB2Q08289 GCKR-201ENST00000264717 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CACNB2Q08289 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CACNB2Q08289 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CACNB2Q08289 SPAG8-209ENST00000484764 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CACNB2Q08289 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CACNB2Q08289 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CACNB2Q08289 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
CACNB2Q08289 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CACNB2Q08289 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CACNB2Q08289 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CACNB2Q08289 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CACNB2Q08289 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CACNB2Q08289 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CACNB2Q08289 RMND1-202ENST00000367303 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CACNB2Q08289 SETD7-203ENST00000406354 1127 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CACNB2Q08289 MIR4435-2HG-204ENST00000419736 777 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CACNB2Q08289 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CACNB2Q08289 AL807761.2-201ENST00000422849 729 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
CACNB2Q08289 PPFIBP1-204ENST00000535047 875 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CACNB2Q08289 HSD17B6-207ENST00000555805 1722 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CACNB2Q08289 AL049833.2-202ENST00000556773 626 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CACNB2Q08289 CRTC3-AS1-202ENST00000559531 657 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CACNB2Q08289 TMEM220-AS1-207ENST00000584714 541 ntTSL 4 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CACNB2Q08289 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CACNB2Q08289 PRKAB1-210ENST00000630317 258 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CACNB2Q08289 SCP2-217ENST00000640998 1101 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CACNB2Q08289 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CACNB2Q08289 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CACNB2Q08289 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CACNB2Q08289 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 93.5 ms