Protein–RNA interactions for Protein: Q04656

ATP7A, Copper-transporting ATPase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP7AQ04656 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ATP7AQ04656 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ATP7AQ04656 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ATP7AQ04656 CD68-202ENST00000380498 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ATP7AQ04656 BFAR-203ENST00000562442 1414 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ATP7AQ04656 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ATP7AQ04656 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ATP7AQ04656 KRTAP2-2-201ENST00000398477 733 ntAPPRIS P2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ATP7AQ04656 AGPAT5P1-201ENST00000455855 1019 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
ATP7AQ04656 AC244197.1-201ENST00000456494 951 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
ATP7AQ04656 AC004889.1-205ENST00000493248 531 ntTSL 4 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ATP7AQ04656 OR2A1-AS1-210ENST00000496968 531 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
ATP7AQ04656 AC136624.2-201ENST00000574883 542 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ATP7AQ04656 AC055811.3-201ENST00000584952 686 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
ATP7AQ04656 AC023421.2-201ENST00000589510 313 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ATP7AQ04656 ADPRHL1-201ENST00000356501 1877 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ATP7AQ04656 AL591122.2-201ENST00000624125 1853 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
ATP7AQ04656 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ATP7AQ04656 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ATP7AQ04656 PAX7-202ENST00000400661 1700 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ATP7AQ04656 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ATP7AQ04656 EBP-205ENST00000495186 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ATP7AQ04656 FGD4-203ENST00000472289 1629 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ATP7AQ04656 MBD1-225ENST00000591535 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ATP7AQ04656 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
ATP7AQ04656 POLR1E-202ENST00000377798 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ATP7AQ04656 AC237221.1-201ENST00000561575 1881 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ATP7AQ04656 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ATP7AQ04656 ADI1-201ENST00000327435 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ATP7AQ04656 PDGFRL-201ENST00000251630 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ATP7AQ04656 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ATP7AQ04656 CRYBB3-201ENST00000215855 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
ATP7AQ04656 FOLR1-202ENST00000393676 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
ATP7AQ04656 TMEM216-202ENST00000398979 908 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
ATP7AQ04656 FTCDNL1-203ENST00000420922 772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
ATP7AQ04656 GNG10P1-201ENST00000452289 199 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
ATP7AQ04656 AC108462.1-201ENST00000457467 850 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.04
ATP7AQ04656 LINC02435-201ENST00000508291 584 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.04
ATP7AQ04656 AC010285.2-201ENST00000510240 569 ntTSL 4 BASIC21.58■■□□□ 1.04
ATP7AQ04656 ZNF268-210ENST00000541211 781 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
ATP7AQ04656 AC226150.1-201ENST00000544259 466 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
ATP7AQ04656 KRT8P2-201ENST00000556193 944 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
ATP7AQ04656 USB1-205ENST00000561743 1135 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.04
ATP7AQ04656 AC009041.1-201ENST00000565401 544 ntTSL 4 BASIC21.58■■□□□ 1.04
ATP7AQ04656 C17orf62-216ENST00000578919 841 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.04
ATP7AQ04656 MIA-206ENST00000597784 455 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.04
ATP7AQ04656 AL137793.2-201ENST00000632635 659 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.04
ATP7AQ04656 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
ATP7AQ04656 TXNDC5-204ENST00000473453 1301 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
ATP7AQ04656 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
ATP7AQ04656 FAM90A21P-201ENST00000510875 1396 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
ATP7AQ04656 FAM90A15P-201ENST00000514465 1395 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
ATP7AQ04656 FAM90A6P-201ENST00000515148 1394 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
ATP7AQ04656 FAM90A16P-201ENST00000526662 1395 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
ATP7AQ04656 FAM90A9P-201ENST00000527940 1395 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
ATP7AQ04656 FAM90A5P-201ENST00000528738 1395 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
ATP7AQ04656 FAM90A14P-201ENST00000530386 1395 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
ATP7AQ04656 FAM90A13P-201ENST00000534703 1395 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
ATP7AQ04656 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ATP7AQ04656 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ATP7AQ04656 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ATP7AQ04656 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ATP7AQ04656 LAP3P2-201ENST00000454686 1454 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
ATP7AQ04656 SUOX-202ENST00000356124 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ATP7AQ04656 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ATP7AQ04656 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ATP7AQ04656 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ATP7AQ04656 IL17B-201ENST00000261796 696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ATP7AQ04656 HBB-201ENST00000335295 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ATP7AQ04656 AC093673.1-201ENST00000429630 648 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ATP7AQ04656 KRT18P46-201ENST00000435568 1279 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
ATP7AQ04656 AC106047.2-201ENST00000511723 743 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
ATP7AQ04656 RAP1B-216ENST00000537460 1072 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ATP7AQ04656 ACTN1-AS1-202ENST00000553961 599 ntTSL 4 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ATP7AQ04656 PEBP1P2-201ENST00000603980 558 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
ATP7AQ04656 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ATP7AQ04656 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ATP7AQ04656 SCAF11-203ENST00000395453 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ATP7AQ04656 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ATP7AQ04656 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ATP7AQ04656 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ATP7AQ04656 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ATP7AQ04656 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ATP7AQ04656 IQCJ-201ENST00000397832 1460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ATP7AQ04656 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ATP7AQ04656 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ATP7AQ04656 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ATP7AQ04656 AC018814.1-201ENST00000418972 357 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ATP7AQ04656 ACTG1P19-201ENST00000418987 1116 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
ATP7AQ04656 AC073094.1-201ENST00000453798 433 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ATP7AQ04656 GSTZ1-210ENST00000554279 795 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ATP7AQ04656 TRMT112P3-201ENST00000580149 358 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
ATP7AQ04656 ZNF286A-212ENST00000580259 527 ntTSL 4 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ATP7AQ04656 AC003043.1-201ENST00000588260 337 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ATP7AQ04656 HELLS-212ENST00000630929 400 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ATP7AQ04656 AC067931.2-201ENST00000623655 2003 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
ATP7AQ04656 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ATP7AQ04656 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ATP7AQ04656 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ATP7AQ04656 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.4 ms