Protein–RNA interactions for Protein: Q02641

CACNB1, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 598 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNB1Q02641 AC010653.1-201ENST00000571108 881 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
CACNB1Q02641 TUBB6-203ENST00000586653 788 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CACNB1Q02641 AL445223.1-201ENST00000595998 1051 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
CACNB1Q02641 SMR3B-204ENST00000614072 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CACNB1Q02641 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
CACNB1Q02641 AC019080.5-201ENST00000624891 757 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
CACNB1Q02641 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CACNB1Q02641 AL078582.1-201ENST00000641922 511 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
CACNB1Q02641 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CACNB1Q02641 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CACNB1Q02641 RMND1-205ENST00000622845 1484 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CACNB1Q02641 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CACNB1Q02641 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CACNB1Q02641 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CACNB1Q02641 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CACNB1Q02641 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
CACNB1Q02641 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CACNB1Q02641 AC026904.3-201ENST00000636550 1530 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CACNB1Q02641 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CACNB1Q02641 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CACNB1Q02641 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CACNB1Q02641 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CACNB1Q02641 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CACNB1Q02641 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CACNB1Q02641 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CACNB1Q02641 KIF27-203ENST00000376347 1030 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CACNB1Q02641 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CACNB1Q02641 DHFRP5-201ENST00000406944 564 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
CACNB1Q02641 LINC00348-201ENST00000428761 948 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CACNB1Q02641 AC009495.1-201ENST00000428888 372 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CACNB1Q02641 GSTA7P-201ENST00000438425 448 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
CACNB1Q02641 SNORA26.10-201ENST00000516427 141 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
CACNB1Q02641 NAT2-202ENST00000520116 716 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CACNB1Q02641 RAP1B-216ENST00000537460 1072 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CACNB1Q02641 OSBPL9P5-201ENST00000542581 171 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
CACNB1Q02641 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CACNB1Q02641 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CACNB1Q02641 LINC02290-201ENST00000554187 608 ntTSL 4 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CACNB1Q02641 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CACNB1Q02641 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CACNB1Q02641 AC005972.1-201ENST00000581596 912 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CACNB1Q02641 AC092954.2-201ENST00000609103 430 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
CACNB1Q02641 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CACNB1Q02641 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
CACNB1Q02641 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CACNB1Q02641 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CACNB1Q02641 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CACNB1Q02641 LINC02211-202ENST00000641091 839 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
CACNB1Q02641 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CACNB1Q02641 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CACNB1Q02641 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CACNB1Q02641 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CACNB1Q02641 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CACNB1Q02641 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CACNB1Q02641 LINC01520-201ENST00000441457 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CACNB1Q02641 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CACNB1Q02641 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CACNB1Q02641 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CACNB1Q02641 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CACNB1Q02641 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CACNB1Q02641 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CACNB1Q02641 APOBEC3B-201ENST00000333467 1533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CACNB1Q02641 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CACNB1Q02641 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CACNB1Q02641 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CACNB1Q02641 CCT6P3-203ENST00000452026 1383 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
CACNB1Q02641 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CACNB1Q02641 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CACNB1Q02641 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CACNB1Q02641 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CACNB1Q02641 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CACNB1Q02641 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CACNB1Q02641 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CACNB1Q02641 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CACNB1Q02641 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CACNB1Q02641 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CACNB1Q02641 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CACNB1Q02641 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CACNB1Q02641 GKN2-202ENST00000481498 1498 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CACNB1Q02641 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CACNB1Q02641 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CACNB1Q02641 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CACNB1Q02641 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CACNB1Q02641 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CACNB1Q02641 PSMA3-202ENST00000412908 908 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CACNB1Q02641 AL591686.1-201ENST00000421878 766 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CACNB1Q02641 HNF4GP1-201ENST00000430567 1249 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
CACNB1Q02641 USP9YP31-201ENST00000431405 881 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
CACNB1Q02641 KRR1-202ENST00000438169 975 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CACNB1Q02641 AC005297.1-201ENST00000444765 862 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
CACNB1Q02641 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CACNB1Q02641 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CACNB1Q02641 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CACNB1Q02641 RPL37AP8-201ENST00000494116 276 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
CACNB1Q02641 PFN1P8-201ENST00000497012 543 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
CACNB1Q02641 AC094105.1-201ENST00000509745 560 ntTSL 4 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CACNB1Q02641 ZDHHC20P3-201ENST00000531576 336 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
CACNB1Q02641 OR4K16P-201ENST00000554603 969 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
CACNB1Q02641 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CACNB1Q02641 AP000942.4-201ENST00000604811 241 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.8 ms