Protein–RNA interactions for Protein: Q01362

MS4A2, High affinity immunoglobulin epsilon receptor subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MS4A2Q01362 UBE3A-209ENST00000625778 3217 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
MS4A2Q01362 SSTR3-201ENST00000610913 4100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
MS4A2Q01362 DDC-213ENST00000617822 1809 ntTSL 3 BASIC14.22□□□□□ -0.13
MS4A2Q01362 DCAF8L2-203ENST00000545306 2013 ntAPPRIS P1 BASIC14.22□□□□□ -0.13
MS4A2Q01362 TC2N-206ENST00000556018 1770 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
MS4A2Q01362 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
MS4A2Q01362 TTC38-201ENST00000381031 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
MS4A2Q01362 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
MS4A2Q01362 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
MS4A2Q01362 LRRFIP2-202ENST00000354379 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
MS4A2Q01362 THBD-201ENST00000377103 4109 ntAPPRIS P1 BASIC14.22□□□□□ -0.13
MS4A2Q01362 CHD4-201ENST00000357008 6496 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
MS4A2Q01362 CASP8-202ENST00000264275 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
MS4A2Q01362 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
MS4A2Q01362 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
MS4A2Q01362 CCHCR1-203ENST00000396268 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
MS4A2Q01362 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC14.22□□□□□ -0.13
MS4A2Q01362 HLA-K-203ENST00000430151 1046 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
MS4A2Q01362 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
MS4A2Q01362 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
MS4A2Q01362 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
MS4A2Q01362 SLC52A1-203ENST00000512825 2989 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
MS4A2Q01362 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC14.22□□□□□ -0.13
MS4A2Q01362 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC14.22□□□□□ -0.13
MS4A2Q01362 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC14.22□□□□□ -0.13
MS4A2Q01362 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC14.22□□□□□ -0.13
MS4A2Q01362 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
MS4A2Q01362 WNT7A-201ENST00000285018 4041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
MS4A2Q01362 AL662899.1-201ENST00000461287 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
MS4A2Q01362 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
MS4A2Q01362 GLB1L3-201ENST00000389887 3566 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
MS4A2Q01362 RAVER1-206ENST00000611074 3586 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
MS4A2Q01362 STXBP1-201ENST00000373299 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
MS4A2Q01362 TMPRSS6-203ENST00000406725 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
MS4A2Q01362 FOXF1-201ENST00000262426 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
MS4A2Q01362 SMARCA4-214ENST00000589677 5181 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
MS4A2Q01362 PGBD2-202ENST00000355360 2879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
MS4A2Q01362 PITPNM2-202ENST00000320201 6736 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
MS4A2Q01362 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
MS4A2Q01362 SNAP91-215ENST00000521743 4263 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
MS4A2Q01362 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
MS4A2Q01362 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
MS4A2Q01362 DEK-202ENST00000397239 3427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
MS4A2Q01362 RNF145-202ENST00000424310 3613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
MS4A2Q01362 CBFA2T3-202ENST00000327483 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
MS4A2Q01362 MAPT-204ENST00000344290 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
MS4A2Q01362 TUNAR-201ENST00000503525 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
MS4A2Q01362 RPGRIP1-210ENST00000556336 2955 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
MS4A2Q01362 AC067750.1-201ENST00000608826 6545 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
MS4A2Q01362 ALDH3A1-201ENST00000225740 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
MS4A2Q01362 PLXDC1-201ENST00000315392 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
MS4A2Q01362 CPNE5-202ENST00000393189 2542 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
MS4A2Q01362 ATP2B2-210ENST00000638646 3465 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
MS4A2Q01362 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
MS4A2Q01362 IFNA6-202ENST00000380210 1544 ntAPPRIS P1 BASIC14.21□□□□□ -0.13
MS4A2Q01362 SEC14L3-204ENST00000403066 2474 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
MS4A2Q01362 MBP-204ENST00000382582 2281 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
MS4A2Q01362 ENG-204ENST00000480266 2804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
MS4A2Q01362 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
MS4A2Q01362 NICN1-201ENST00000273598 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
MS4A2Q01362 IL20RA-203ENST00000367748 3522 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
MS4A2Q01362 FBXO5-202ENST00000367241 2221 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
MS4A2Q01362 UCN2-201ENST00000273610 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
MS4A2Q01362 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
MS4A2Q01362 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
MS4A2Q01362 PCK2-216ENST00000561286 2012 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
MS4A2Q01362 AC090643.2-201ENST00000623442 2029 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
MS4A2Q01362 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
MS4A2Q01362 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC14.21□□□□□ -0.13
MS4A2Q01362 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC14.21□□□□□ -0.13
MS4A2Q01362 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
MS4A2Q01362 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.21□□□□□ -0.13
MS4A2Q01362 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
MS4A2Q01362 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
MS4A2Q01362 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
MS4A2Q01362 AC010336.6-201ENST00000595107 528 ntTSL 4 BASIC14.21□□□□□ -0.13
MS4A2Q01362 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
MS4A2Q01362 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
MS4A2Q01362 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC14.21□□□□□ -0.13
MS4A2Q01362 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
MS4A2Q01362 ZDHHC6-202ENST00000369405 2170 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
MS4A2Q01362 PRDM15-201ENST00000269844 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
MS4A2Q01362 PAK1-201ENST00000278568 2543 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
MS4A2Q01362 AL139193.2-201ENST00000553712 1954 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
MS4A2Q01362 ANO7-202ENST00000402430 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
MS4A2Q01362 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
MS4A2Q01362 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
MS4A2Q01362 GPR4-201ENST00000323040 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
MS4A2Q01362 ANGPTL2-202ENST00000373425 3707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
MS4A2Q01362 IL1RAPL2-202ENST00000372582 2985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
MS4A2Q01362 POLG-201ENST00000268124 4500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
MS4A2Q01362 ZDHHC8-203ENST00000405930 3112 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.14
MS4A2Q01362 DNAJC21-202ENST00000382021 6208 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.14
MS4A2Q01362 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
MS4A2Q01362 INSC-208ENST00000530161 1702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
MS4A2Q01362 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
MS4A2Q01362 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
MS4A2Q01362 PDZD7-206ENST00000619208 4135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.14
MS4A2Q01362 AFAP1-203ENST00000382543 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.14
MS4A2Q01362 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38 ms