Protein–RNA interactions for Protein: P78337

PITX1, Pituitary homeobox 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITX1P78337 FMR1-203ENST00000370470 1774 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PITX1P78337 DCAKD-201ENST00000310604 2122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PITX1P78337 AC140479.7-201ENST00000636301 2332 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
PITX1P78337 RABL2B-202ENST00000395590 2380 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PITX1P78337 AC097359.2-201ENST00000604992 2389 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
PITX1P78337 RUFY1-204ENST00000437570 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PITX1P78337 DBR1-201ENST00000260803 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PITX1P78337 LYSMD4-204ENST00000409796 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PITX1P78337 GRK6-203ENST00000393576 2792 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PITX1P78337 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PITX1P78337 RASSF5-201ENST00000577571 3496 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PITX1P78337 SCAP-206ENST00000428413 3749 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PITX1P78337 PDE8B-203ENST00000340978 3426 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PITX1P78337 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PITX1P78337 CYB561-203ENST00000392976 3151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PITX1P78337 SLC52A3-202ENST00000381944 3060 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PITX1P78337 RASGRF2-206ENST00000638442 2842 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PITX1P78337 SPRY4-202ENST00000434127 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PITX1P78337 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PITX1P78337 SDHAF2-201ENST00000301761 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PITX1P78337 AL390755.1-201ENST00000623716 2027 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
PITX1P78337 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PITX1P78337 CDC37-201ENST00000222005 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PITX1P78337 CYP1A1-203ENST00000395049 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PITX1P78337 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PITX1P78337 LINC00593-202ENST00000560853 1483 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PITX1P78337 AC099850.1-201ENST00000451775 1338 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PITX1P78337 KCNAB2-212ENST00000458166 1336 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PITX1P78337 ANGPTL8-201ENST00000252453 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PITX1P78337 NCR3-201ENST00000340027 1042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PITX1P78337 CAVIN1-201ENST00000357037 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PITX1P78337 RBAK-RBAKDN-201ENST00000396904 766 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PITX1P78337 RBAK-RBAKDN-202ENST00000407184 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PITX1P78337 AC106772.2-201ENST00000515085 442 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PITX1P78337 RCN1-210ENST00000532942 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PITX1P78337 AP003385.5-201ENST00000533876 555 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PITX1P78337 RAB40B-202ENST00000538809 704 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PITX1P78337 NDUFC1-210ENST00000539387 725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PITX1P78337 XRCC3-210ENST00000554974 575 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PITX1P78337 PPY2P-201ENST00000582808 702 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
PITX1P78337 PPY2P-202ENST00000583761 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PITX1P78337 ANGPTL8-203ENST00000591200 504 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PITX1P78337 PAX4-207ENST00000611453 1235 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PITX1P78337 ANGPTL8-204ENST00000616433 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PITX1P78337 BRF1-211ENST00000547530 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PITX1P78337 FAM214B-202ENST00000378557 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PITX1P78337 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PITX1P78337 FER1L4-213ENST00000621044 2778 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PITX1P78337 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PITX1P78337 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PITX1P78337 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PITX1P78337 TNFAIP8L3-201ENST00000327536 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PITX1P78337 TRAF7-201ENST00000326181 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PITX1P78337 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PITX1P78337 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PITX1P78337 PVR-202ENST00000344956 3166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PITX1P78337 VCAN-211ENST00000513984 1825 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PITX1P78337 TPM3-205ENST00000328159 1771 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PITX1P78337 C21orf58-204ENST00000397682 2941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PITX1P78337 LDHAL6B-201ENST00000307144 1693 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PITX1P78337 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PITX1P78337 CCNE1-202ENST00000357943 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PITX1P78337 RUSC1-202ENST00000368347 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PITX1P78337 LDLR-202ENST00000455727 2333 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PITX1P78337 AL109910.1-201ENST00000452071 1330 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PITX1P78337 PPM1B-205ENST00000409432 3025 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PITX1P78337 CIDEC-201ENST00000336832 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PITX1P78337 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PITX1P78337 TLE1P1-201ENST00000422965 589 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
PITX1P78337 CIDEC-203ENST00000423850 1036 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PITX1P78337 CIDEC-206ENST00000455015 1123 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PITX1P78337 AC090502.1-202ENST00000515416 966 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PITX1P78337 AC110285.3-201ENST00000574472 665 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PITX1P78337 ACAP1-208ENST00000574499 412 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PITX1P78337 MIR4741-201ENST00000579822 90 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
PITX1P78337 Six3os1_5.1-201ENST00000611000 271 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
PITX1P78337 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PITX1P78337 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PITX1P78337 AP001267.2-201ENST00000532619 2086 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
PITX1P78337 TARS2-203ENST00000369054 1998 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PITX1P78337 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
PITX1P78337 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PITX1P78337 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PITX1P78337 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PITX1P78337 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PITX1P78337 CCDC116-201ENST00000292779 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PITX1P78337 TAMM41-205ENST00000444133 1619 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PITX1P78337 TMCO5B-204ENST00000529696 1568 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PITX1P78337 LINC00476-204ENST00000429781 2825 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PITX1P78337 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
PITX1P78337 PRKRIP1-201ENST00000397912 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PITX1P78337 SUMO1-203ENST00000392246 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PITX1P78337 AL162231.1-201ENST00000421828 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PITX1P78337 TMEM184C-204ENST00000508208 1528 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PITX1P78337 CCDC121-202ENST00000394775 1472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PITX1P78337 GPBAR1-203ENST00000521462 1465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PITX1P78337 SLC35G3-201ENST00000297307 2004 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PITX1P78337 STYXL1-201ENST00000248600 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PITX1P78337 HOGA1-203ENST00000370647 1999 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PITX1P78337 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.2 ms