Protein–RNA interactions for Protein: P78312

FAM193A, Protein FAM193A, humanhuman

Predictions only

Length 1,265 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM193AP78312 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
FAM193AP78312 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
FAM193AP78312 TRMT1-201ENST00000221504 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
FAM193AP78312 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
FAM193AP78312 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
FAM193AP78312 SLC16A1-207ENST00000538576 4374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
FAM193AP78312 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
FAM193AP78312 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
FAM193AP78312 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
FAM193AP78312 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
FAM193AP78312 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
FAM193AP78312 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
FAM193AP78312 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
FAM193AP78312 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
FAM193AP78312 COX5BP8-201ENST00000416911 349 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
FAM193AP78312 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
FAM193AP78312 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
FAM193AP78312 RN7SL692P-201ENST00000464677 288 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
FAM193AP78312 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
FAM193AP78312 AL132711.1-201ENST00000557546 722 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
FAM193AP78312 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
FAM193AP78312 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
FAM193AP78312 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
FAM193AP78312 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
FAM193AP78312 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
FAM193AP78312 AL358472.5-202ENST00000641448 1267 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
FAM193AP78312 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
FAM193AP78312 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
FAM193AP78312 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
FAM193AP78312 MST1P2-201ENST00000457982 2291 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
FAM193AP78312 MOCS3-201ENST00000244051 5106 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
FAM193AP78312 SOX21-AS1-201ENST00000438290 3287 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
FAM193AP78312 TPM3-208ENST00000341485 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
FAM193AP78312 PLCXD2-201ENST00000393934 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
FAM193AP78312 VPS26B-201ENST00000281187 3691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
FAM193AP78312 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
FAM193AP78312 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
FAM193AP78312 DLGAP1-204ENST00000400149 5203 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
FAM193AP78312 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
FAM193AP78312 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
FAM193AP78312 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
FAM193AP78312 ZNF362-201ENST00000373428 2936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
FAM193AP78312 SEPT8-206ENST00000378706 4168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
FAM193AP78312 B4GALT6-201ENST00000237019 2128 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
FAM193AP78312 PGAM1P5-202ENST00000552554 2148 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
FAM193AP78312 ZFP2-201ENST00000361362 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
FAM193AP78312 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
FAM193AP78312 EPHB3-201ENST00000330394 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
FAM193AP78312 CILP2-202ENST00000586018 4234 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
FAM193AP78312 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
FAM193AP78312 PCM1-202ENST00000327578 8287 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
FAM193AP78312 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
FAM193AP78312 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
FAM193AP78312 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
FAM193AP78312 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
FAM193AP78312 C21orf62-AS1-201ENST00000382375 2453 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
FAM193AP78312 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
FAM193AP78312 FBXO21-202ENST00000427718 4138 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
FAM193AP78312 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
FAM193AP78312 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
FAM193AP78312 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
FAM193AP78312 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
FAM193AP78312 NAA50-208ENST00000497255 789 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
FAM193AP78312 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
FAM193AP78312 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
FAM193AP78312 SPATA8-AS1-201ENST00000558722 465 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
FAM193AP78312 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
FAM193AP78312 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
FAM193AP78312 MIR6752-201ENST00000618442 71 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
FAM193AP78312 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
FAM193AP78312 PELP1-212ENST00000574876 3465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
FAM193AP78312 MLXIPL-205ENST00000429400 3173 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
FAM193AP78312 CD8A-203ENST00000409511 3048 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
FAM193AP78312 GDAP1L1-207ENST00000612599 2585 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
FAM193AP78312 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
FAM193AP78312 RERE-204ENST00000400908 5790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
FAM193AP78312 AC027288.3-202ENST00000550268 1820 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
FAM193AP78312 LINC01873-201ENST00000428647 1679 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
FAM193AP78312 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
FAM193AP78312 AC004890.2-205ENST00000416232 2804 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
FAM193AP78312 XPR1-201ENST00000367589 4126 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
FAM193AP78312 GP6-202ENST00000333884 2210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
FAM193AP78312 DNAH14-204ENST00000366849 2215 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
FAM193AP78312 CCDC88A-201ENST00000263630 9667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
FAM193AP78312 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
FAM193AP78312 NUTM2HP-201ENST00000442076 2498 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
FAM193AP78312 ADAM11-201ENST00000200557 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
FAM193AP78312 RIC8B-202ENST00000392837 5135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
FAM193AP78312 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
FAM193AP78312 MSH5-201ENST00000375703 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
FAM193AP78312 PTPN23-201ENST00000265562 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
FAM193AP78312 TRPM2-204ENST00000397932 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
FAM193AP78312 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
FAM193AP78312 RPS6KA4-202ENST00000528057 3121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
FAM193AP78312 PIDD1-201ENST00000347755 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
FAM193AP78312 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
FAM193AP78312 YME1L1-202ENST00000375972 2517 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
FAM193AP78312 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
FAM193AP78312 AC105206.1-202ENST00000314927 2368 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
FAM193AP78312 FGFR3-201ENST00000260795 4132 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.8 ms