Protein–RNA interactions for Protein: P59942

MCCD1, Mitochondrial coiled-coil domain protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 119 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCCD1P59942 GAS5-209ENST00000430245 723 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
MCCD1P59942 AL157407.1-201ENST00000435784 904 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
MCCD1P59942 IQCF3-203ENST00000444293 450 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MCCD1P59942 AC010973.2-201ENST00000485974 1230 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
MCCD1P59942 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
MCCD1P59942 AC104989.1-201ENST00000519711 778 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
MCCD1P59942 FLJ27354-203ENST00000526694 851 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
MCCD1P59942 AC018653.3-202ENST00000538062 735 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
MCCD1P59942 AC027237.1-201ENST00000560942 655 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
MCCD1P59942 AP005482.1-201ENST00000563722 1273 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
MCCD1P59942 MIR4259-201ENST00000584466 101 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
MCCD1P59942 CYP1B1-AS1-221ENST00000627172 995 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
MCCD1P59942 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
MCCD1P59942 E2F6-202ENST00000381525 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MCCD1P59942 GRK6P1-201ENST00000400595 1711 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
MCCD1P59942 AL023775.1-201ENST00000454907 1746 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
MCCD1P59942 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MCCD1P59942 AGPAT3-218ENST00000546158 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
MCCD1P59942 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MCCD1P59942 CTNND2-202ENST00000458100 1962 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
MCCD1P59942 AC064801.2-201ENST00000625052 1303 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
MCCD1P59942 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
MCCD1P59942 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
MCCD1P59942 IFRD1-205ENST00000429071 1938 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
MCCD1P59942 ALDH4A1-205ENST00000538309 1940 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
MCCD1P59942 STRADA-243ENST00000640086 1925 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
MCCD1P59942 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
MCCD1P59942 BAX-201ENST00000293288 1358 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
MCCD1P59942 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
MCCD1P59942 SLC22A12-203ENST00000377572 2887 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
MCCD1P59942 HPD-204ENST00000543163 1709 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
MCCD1P59942 ZFAND6-222ENST00000613266 1729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
MCCD1P59942 HEBP1-201ENST00000014930 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
MCCD1P59942 EIF3G-201ENST00000253108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
MCCD1P59942 NPPC-201ENST00000295440 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
MCCD1P59942 DUSP23-202ENST00000368108 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
MCCD1P59942 AL161932.2-201ENST00000435436 679 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
MCCD1P59942 AL807752.4-201ENST00000439076 580 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
MCCD1P59942 ANAPC13-205ENST00000511751 896 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
MCCD1P59942 RNA5SP412-201ENST00000516234 123 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
MCCD1P59942 AC007376.2-201ENST00000556271 540 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
MCCD1P59942 AC011447.3-204ENST00000585498 883 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
MCCD1P59942 TAGLN2-202ENST00000368096 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
MCCD1P59942 AL359915.2-205ENST00000418015 1529 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
MCCD1P59942 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
MCCD1P59942 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
MCCD1P59942 PCCB-215ENST00000482086 1436 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
MCCD1P59942 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
MCCD1P59942 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
MCCD1P59942 ZNF365-207ENST00000410046 3379 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
MCCD1P59942 CCNB1-201ENST00000256442 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
MCCD1P59942 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
MCCD1P59942 ALDOA-203ENST00000395248 2447 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
MCCD1P59942 C1QTNF9-201ENST00000332018 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
MCCD1P59942 SLCO2B1-217ENST00000532236 2593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
MCCD1P59942 NMNAT3-203ENST00000413939 1711 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
MCCD1P59942 HTR3A-206ENST00000506841 2221 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
MCCD1P59942 SYP-201ENST00000263233 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
MCCD1P59942 KANK2-207ENST00000589894 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
MCCD1P59942 AC025674.2-201ENST00000522622 2971 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
MCCD1P59942 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
MCCD1P59942 SLC26A11-202ENST00000411502 2872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
MCCD1P59942 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
MCCD1P59942 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
MCCD1P59942 VIPAS39-202ENST00000343765 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
MCCD1P59942 CYP1A1-210ENST00000617691 2521 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
MCCD1P59942 OXA1L-202ENST00000358043 1750 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
MCCD1P59942 SNRPN-202ENST00000390687 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
MCCD1P59942 TMEM141-201ENST00000290079 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
MCCD1P59942 STX1A-203ENST00000395155 783 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
MCCD1P59942 RBAK-RBAKDN-201ENST00000396904 766 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
MCCD1P59942 ATP6V1E1-202ENST00000399796 1208 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
MCCD1P59942 MASP2-202ENST00000400898 726 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
MCCD1P59942 RBAK-RBAKDN-202ENST00000407184 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
MCCD1P59942 FAM221A-203ENST00000409653 761 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
MCCD1P59942 FAM221A-204ENST00000409994 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
MCCD1P59942 LINC01840-201ENST00000421870 571 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
MCCD1P59942 AL645933.1-201ENST00000440087 609 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
MCCD1P59942 AC092944.1-202ENST00000487238 483 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
MCCD1P59942 AC084866.2-201ENST00000509956 449 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
MCCD1P59942 C11orf98-201ENST00000524958 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
MCCD1P59942 MUTYH-237ENST00000531105 501 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
MCCD1P59942 CX3CL1-203ENST00000564948 563 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
MCCD1P59942 NCR1-206ENST00000598576 996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
MCCD1P59942 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
MCCD1P59942 AC136759.1-202ENST00000530858 2194 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
MCCD1P59942 RHOH-220ENST00000615083 2156 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
MCCD1P59942 KCNJ2-202ENST00000535240 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
MCCD1P59942 MKRN3-201ENST00000314520 2337 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
MCCD1P59942 C17orf80-203ENST00000359042 3645 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
MCCD1P59942 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
MCCD1P59942 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
MCCD1P59942 AC016397.2-201ENST00000624848 1985 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
MCCD1P59942 MSH5-203ENST00000375750 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
MCCD1P59942 FRZB-201ENST00000295113 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
MCCD1P59942 PIP4K2A-201ENST00000323883 1319 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
MCCD1P59942 HLA-DPA1-242ENST00000419277 1704 ntAPPRIS P2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
MCCD1P59942 LINC00926-202ENST00000502027 2141 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
MCCD1P59942 RPL13-204ENST00000452368 1455 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
MCCD1P59942 ACP2-205ENST00000527256 1499 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
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