Protein–RNA interactions for Protein: P58512

LINC01547, Uncharacterized protein encoded by LINC01547, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 204 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC01547P58512 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC9.55□□□□□ -0.88
LINC01547P58512 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
LINC01547P58512 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
LINC01547P58512 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC9.55□□□□□ -0.88
LINC01547P58512 NUP153-203ENST00000613258 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
LINC01547P58512 SDC1-202ENST00000381150 3291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
LINC01547P58512 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
LINC01547P58512 FAM120C-202ENST00000375180 8057 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
LINC01547P58512 DSCAML1-203ENST00000527706 6099 ntTSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
LINC01547P58512 DSTN-201ENST00000246069 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
LINC01547P58512 ZNF641-201ENST00000301042 4544 ntTSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
LINC01547P58512 PLCD1-204ENST00000463876 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
LINC01547P58512 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
LINC01547P58512 PABPC1-208ENST00000519004 2401 ntTSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
LINC01547P58512 GOLGA7B-203ENST00000596005 6378 ntTSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
LINC01547P58512 ZFHX2-205ENST00000615307 1972 ntTSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
LINC01547P58512 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
LINC01547P58512 CACNA1G-233ENST00000515765 6981 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
LINC01547P58512 NAA15-202ENST00000398947 6072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
LINC01547P58512 AJAP1-202ENST00000378191 11666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
LINC01547P58512 GPR88-201ENST00000315033 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
LINC01547P58512 SLC22A2-202ENST00000366953 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
LINC01547P58512 TRIB1-201ENST00000311922 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
LINC01547P58512 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
LINC01547P58512 FCHSD2-204ENST00000409418 3154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
LINC01547P58512 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
LINC01547P58512 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
LINC01547P58512 ZNF536-201ENST00000355537 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
LINC01547P58512 GABPB1-201ENST00000220429 2726 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
LINC01547P58512 MYO15B-236ENST00000633867 6323 ntTSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
LINC01547P58512 CDCA3-207ENST00000538862 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
LINC01547P58512 AC026992.2-202ENST00000565312 1934 ntTSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
LINC01547P58512 STIM1-220ENST00000616714 4356 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
LINC01547P58512 PFKFB4-201ENST00000232375 3586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
LINC01547P58512 MFAP3-201ENST00000322602 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
LINC01547P58512 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC9.54□□□□□ -0.88
LINC01547P58512 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
LINC01547P58512 PRDM10-202ENST00000358825 6322 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
LINC01547P58512 PRDM10-203ENST00000360871 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
LINC01547P58512 EPHB1-201ENST00000398015 4672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
LINC01547P58512 TOM1L2-205ENST00000478943 2098 ntTSL 2 BASIC9.54□□□□□ -0.88
LINC01547P58512 AP001267.2-201ENST00000532619 2086 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
LINC01547P58512 GPRASP1-202ENST00000415986 5877 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC9.54□□□□□ -0.88
LINC01547P58512 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
LINC01547P58512 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
LINC01547P58512 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
LINC01547P58512 SSTR3-201ENST00000610913 4100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
LINC01547P58512 FAM189A1-201ENST00000261275 4705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
LINC01547P58512 AC011455.3-201ENST00000599996 1967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.54□□□□□ -0.88
LINC01547P58512 TMEM143-201ENST00000293261 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
LINC01547P58512 FAM98B-202ENST00000397609 4388 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
LINC01547P58512 OR52A1-202ENST00000380367 9783 ntAPPRIS P1 BASIC9.54□□□□□ -0.88
LINC01547P58512 SCN2B-201ENST00000278947 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
LINC01547P58512 UQCC1-204ENST00000374384 2201 ntTSL 2 BASIC9.54□□□□□ -0.88
LINC01547P58512 CACNA1G-230ENST00000514717 6699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
LINC01547P58512 CSF2RB-202ENST00000403662 4863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
LINC01547P58512 PCDHA2-202ENST00000520672 3056 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
LINC01547P58512 ARSH-201ENST00000381130 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
LINC01547P58512 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
LINC01547P58512 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
LINC01547P58512 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC9.54□□□□□ -0.88
LINC01547P58512 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
LINC01547P58512 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
LINC01547P58512 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.54□□□□□ -0.88
LINC01547P58512 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
LINC01547P58512 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
LINC01547P58512 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
LINC01547P58512 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
LINC01547P58512 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
LINC01547P58512 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC9.54□□□□□ -0.88
LINC01547P58512 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
LINC01547P58512 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
LINC01547P58512 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
LINC01547P58512 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
LINC01547P58512 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
LINC01547P58512 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC9.54□□□□□ -0.88
LINC01547P58512 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
LINC01547P58512 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC9.54□□□□□ -0.88
LINC01547P58512 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
LINC01547P58512 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
LINC01547P58512 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
LINC01547P58512 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
LINC01547P58512 GPC3-202ENST00000394299 2379 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
LINC01547P58512 ACVR1B-206ENST00000542485 2362 ntTSL 2 BASIC9.54□□□□□ -0.88
LINC01547P58512 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
LINC01547P58512 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
LINC01547P58512 CACNB4-210ENST00000539935 8378 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
LINC01547P58512 AP001627.1-201ENST00000437426 1754 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
LINC01547P58512 PLA2G4F-202ENST00000397272 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
LINC01547P58512 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
LINC01547P58512 B3GNT5-202ENST00000460419 3368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.54□□□□□ -0.88
LINC01547P58512 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
LINC01547P58512 SC5D-202ENST00000392789 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
LINC01547P58512 CAMK2B-217ENST00000457475 4142 ntTSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
LINC01547P58512 FZD6-206ENST00000523739 2774 ntTSL 2 BASIC9.54□□□□□ -0.88
LINC01547P58512 CNTNAP1-201ENST00000264638 5276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
LINC01547P58512 POU6F1-208ENST00000550824 2664 ntTSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
LINC01547P58512 PCDHGA3-203ENST00000619750 2695 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.54□□□□□ -0.88
LINC01547P58512 PDK2-203ENST00000503176 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
LINC01547P58512 GRIN1-206ENST00000371559 3577 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms