Protein–RNA interactions for Protein: P54829

PTPN5, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 5, humanhuman

Predictions only

Length 565 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN5P54829 KCTD7-206ENST00000639828 5951 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PTPN5P54829 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PTPN5P54829 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PTPN5P54829 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PTPN5P54829 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PTPN5P54829 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PTPN5P54829 MRPS7-201ENST00000245539 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PTPN5P54829 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PTPN5P54829 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PTPN5P54829 KRT8P29-201ENST00000420409 1371 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
PTPN5P54829 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PTPN5P54829 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PTPN5P54829 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PTPN5P54829 TPRKB-202ENST00000318190 819 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PTPN5P54829 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PTPN5P54829 ALG1L2-201ENST00000425059 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PTPN5P54829 VGLL4-214ENST00000451674 938 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PTPN5P54829 TTTY14-204ENST00000452584 860 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PTPN5P54829 AC245884.1-201ENST00000457113 529 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PTPN5P54829 NME2-204ENST00000503064 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PTPN5P54829 SIRT3-210ENST00000529382 1225 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PTPN5P54829 AP001160.1-201ENST00000535817 565 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PTPN5P54829 RTN3P1-201ENST00000536295 711 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
PTPN5P54829 DNM1P30-201ENST00000563586 452 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
PTPN5P54829 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PTPN5P54829 AC018761.2-201ENST00000585496 296 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PTPN5P54829 ELOF1-202ENST00000586120 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PTPN5P54829 SCN1B-204ENST00000596348 1176 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PTPN5P54829 SLC8A1-AS1-218ENST00000610721 956 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PTPN5P54829 AC138466.4-201ENST00000623965 852 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
PTPN5P54829 EDDM13-208ENST00000637802 854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PTPN5P54829 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PTPN5P54829 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PTPN5P54829 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PTPN5P54829 SMPDL3A-201ENST00000368440 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PTPN5P54829 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PTPN5P54829 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PTPN5P54829 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PTPN5P54829 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PTPN5P54829 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PTPN5P54829 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PTPN5P54829 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PTPN5P54829 AL157791.1-201ENST00000553667 1699 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
PTPN5P54829 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PTPN5P54829 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PTPN5P54829 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PTPN5P54829 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PTPN5P54829 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PTPN5P54829 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PTPN5P54829 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PTPN5P54829 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PTPN5P54829 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PTPN5P54829 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PTPN5P54829 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PTPN5P54829 FETUB-207ENST00000450521 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PTPN5P54829 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PTPN5P54829 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PTPN5P54829 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PTPN5P54829 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PTPN5P54829 CLRN1-203ENST00000328863 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PTPN5P54829 PSMB10-201ENST00000358514 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PTPN5P54829 MRPL19-201ENST00000358788 693 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PTPN5P54829 CRYAA-202ENST00000398132 826 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PTPN5P54829 AC009480.1-201ENST00000402410 412 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PTPN5P54829 HPGD-203ENST00000422112 805 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PTPN5P54829 CMC1-204ENST00000423894 549 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PTPN5P54829 AC061961.1-201ENST00000443901 432 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PTPN5P54829 PRPS2-205ENST00000489404 763 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PTPN5P54829 AC093627.5-203ENST00000497320 746 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PTPN5P54829 AC116345.2-201ENST00000512837 523 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
PTPN5P54829 KLRC1-204ENST00000536188 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PTPN5P54829 MAP1LC3B2-202ENST00000556529 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PTPN5P54829 AL031713.1-201ENST00000564813 661 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
PTPN5P54829 INCA1-203ENST00000575780 1221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PTPN5P54829 RN7SL596P-201ENST00000582123 288 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
PTPN5P54829 AC093330.1-206ENST00000582546 812 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PTPN5P54829 AC008687.1-201ENST00000591656 786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PTPN5P54829 PRMT5-AS1-206ENST00000599580 847 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PTPN5P54829 FP236240.1-204ENST00000624932 712 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PTPN5P54829 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PTPN5P54829 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PTPN5P54829 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PTPN5P54829 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PTPN5P54829 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PTPN5P54829 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PTPN5P54829 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PTPN5P54829 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PTPN5P54829 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PTPN5P54829 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PTPN5P54829 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PTPN5P54829 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PTPN5P54829 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PTPN5P54829 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PTPN5P54829 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PTPN5P54829 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PTPN5P54829 TCF7-218ENST00000520958 1408 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PTPN5P54829 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PTPN5P54829 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PTPN5P54829 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PTPN5P54829 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.5 ms