Protein–RNA interactions for Protein: P42166

TMPO, Lamina-associated polypeptide 2, isoform alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 694 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMPOP42166 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TMPOP42166 RUFY2-202ENST00000342616 983 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TMPOP42166 AK6-201ENST00000380818 1183 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TMPOP42166 BRWD1P1-201ENST00000401091 371 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
TMPOP42166 AL139010.1-202ENST00000452528 1041 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TMPOP42166 CICP12-201ENST00000455801 843 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
TMPOP42166 AC104596.1-201ENST00000507826 579 ntTSL 4 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TMPOP42166 NME2-206ENST00000513177 692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TMPOP42166 NR2C2AP-207ENST00000544883 899 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TMPOP42166 AL163636.1-201ENST00000554286 915 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TMPOP42166 KLK11-210ENST00000600362 759 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TMPOP42166 AC091271.1-201ENST00000611877 1162 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
TMPOP42166 FP565260.5-201ENST00000623188 479 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TMPOP42166 ABBA01031663.1-201ENST00000635630 790 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
TMPOP42166 CYTH1-201ENST00000361101 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TMPOP42166 CYTH1-202ENST00000446868 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TMPOP42166 ARHGAP4-202ENST00000370016 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TMPOP42166 CCDC47-201ENST00000225726 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TMPOP42166 UBA6-202ENST00000420827 1664 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TMPOP42166 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TMPOP42166 AL590440.2-201ENST00000641973 1595 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
TMPOP42166 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TMPOP42166 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TMPOP42166 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TMPOP42166 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TMPOP42166 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TMPOP42166 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TMPOP42166 SLC13A5-208ENST00000573648 1723 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TMPOP42166 AC106881.1-201ENST00000605849 3329 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
TMPOP42166 BTBD11-204ENST00000420571 3478 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TMPOP42166 PIANP-202ENST00000534837 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TMPOP42166 RHOH-218ENST00000613272 1865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TMPOP42166 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TMPOP42166 CAPN3-207ENST00000397200 1643 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TMPOP42166 GLIDR-202ENST00000625350 2588 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TMPOP42166 LDLR-202ENST00000455727 2333 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
TMPOP42166 AC005264.1-201ENST00000587587 2319 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
TMPOP42166 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TMPOP42166 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TMPOP42166 PRMT7-203ENST00000449359 2091 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
TMPOP42166 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TMPOP42166 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
TMPOP42166 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TMPOP42166 COCH-203ENST00000460581 2688 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
TMPOP42166 SERPINA3-203ENST00000467132 2660 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
TMPOP42166 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TMPOP42166 AL021707.3-201ENST00000418803 527 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
TMPOP42166 USE1-202ENST00000445667 795 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
TMPOP42166 LINC01248-201ENST00000458264 468 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
TMPOP42166 AC020659.2-202ENST00000512295 513 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
TMPOP42166 GTF2H2C-215ENST00000514162 610 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
TMPOP42166 AC113192.2-201ENST00000525320 308 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
TMPOP42166 IFITM1-204ENST00000528780 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
TMPOP42166 AC103988.2-201ENST00000561804 725 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
TMPOP42166 AC007342.4-201ENST00000566383 584 ntTSL 4 BASIC19.47■□□□□ 0.71
TMPOP42166 DUX4L46-201ENST00000566845 751 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
TMPOP42166 TXNDC17-202ENST00000570330 459 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
TMPOP42166 AC092634.5-202ENST00000587736 928 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
TMPOP42166 AC011495.3-201ENST00000596472 427 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
TMPOP42166 MIR6869-201ENST00000619434 62 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
TMPOP42166 CYP4B1-215ENST00000640628 969 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
TMPOP42166 DLX4-202ENST00000411890 1404 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TMPOP42166 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TMPOP42166 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
TMPOP42166 LINC00327-203ENST00000576696 1308 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TMPOP42166 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TMPOP42166 AP001627.1-201ENST00000437426 1754 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TMPOP42166 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
TMPOP42166 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
TMPOP42166 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
TMPOP42166 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
TMPOP42166 METTL6-201ENST00000383789 1413 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
TMPOP42166 ABCB8-221ENST00000498578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
TMPOP42166 CALCA-201ENST00000331587 843 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
TMPOP42166 SMS-201ENST00000379404 1174 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
TMPOP42166 AF274855.1-203ENST00000424126 800 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
TMPOP42166 CD74-212ENST00000524315 584 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
TMPOP42166 CD63-214ENST00000552692 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
TMPOP42166 CRISPLD2-210ENST00000569090 808 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
TMPOP42166 NIP7-208ENST00000569637 1099 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
TMPOP42166 C1QTNF1-AS1-202ENST00000581579 865 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
TMPOP42166 AC104982.3-201ENST00000581995 514 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
TMPOP42166 AC132192.2-201ENST00000596206 1147 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
TMPOP42166 MIR6799-201ENST00000620297 69 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
TMPOP42166 AL162426.1-201ENST00000624141 743 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
TMPOP42166 TM9SF1-202ENST00000396854 2055 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
TMPOP42166 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
TMPOP42166 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
TMPOP42166 ABHD16A-202ENST00000440843 1906 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
TMPOP42166 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
TMPOP42166 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
TMPOP42166 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
TMPOP42166 STAG3L2-201ENST00000426587 2130 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
TMPOP42166 ZDHHC4-203ENST00000396707 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
TMPOP42166 F10-203ENST00000409306 1450 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
TMPOP42166 CRHR2-208ENST00000506074 3109 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
TMPOP42166 HOGA1-203ENST00000370647 1999 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
TMPOP42166 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
TMPOP42166 SPIN2A-201ENST00000374906 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
TMPOP42166 THOC6-207ENST00000574549 1300 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.6 ms