Protein–RNA interactions for Protein: P36542

ATP5C1, ATP synthase subunit gamma, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 298 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP5C1P36542 SUMO1-204ENST00000409181 784 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATP5C1P36542 SUMO1-207ENST00000409498 779 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATP5C1P36542 AL157902.1-202ENST00000425010 763 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATP5C1P36542 AL450469.2-201ENST00000427132 499 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATP5C1P36542 AC082651.1-201ENST00000478468 832 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATP5C1P36542 OARD1-212ENST00000482515 832 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATP5C1P36542 FBXL8-208ENST00000521920 574 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATP5C1P36542 TPD52L1-208ENST00000528193 789 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATP5C1P36542 ACYP1-206ENST00000555694 565 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATP5C1P36542 AC103810.3-201ENST00000583567 96 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
ATP5C1P36542 CLEC11A-202ENST00000599973 1026 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATP5C1P36542 AC008825.2-201ENST00000603374 718 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
ATP5C1P36542 BX088702.1-201ENST00000610784 235 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
ATP5C1P36542 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATP5C1P36542 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATP5C1P36542 FKBP6-201ENST00000252037 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATP5C1P36542 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATP5C1P36542 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATP5C1P36542 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATP5C1P36542 SLC25A19-202ENST00000375261 1486 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATP5C1P36542 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATP5C1P36542 ALG3-207ENST00000455059 1697 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATP5C1P36542 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATP5C1P36542 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATP5C1P36542 OSCP1-204ENST00000433045 1381 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATP5C1P36542 TAMM41-205ENST00000444133 1619 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATP5C1P36542 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATP5C1P36542 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATP5C1P36542 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATP5C1P36542 GCNT7-201ENST00000243913 2064 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATP5C1P36542 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATP5C1P36542 SMYD1-203ENST00000444564 1816 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATP5C1P36542 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATP5C1P36542 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATP5C1P36542 CD27-201ENST00000266557 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATP5C1P36542 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATP5C1P36542 MAPT-204ENST00000344290 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATP5C1P36542 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATP5C1P36542 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATP5C1P36542 ECSIT-201ENST00000252440 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATP5C1P36542 OSBP2-201ENST00000332585 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATP5C1P36542 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATP5C1P36542 SST-201ENST00000287641 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATP5C1P36542 GTSF1-201ENST00000305879 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATP5C1P36542 PRDX5-203ENST00000352435 596 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATP5C1P36542 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATP5C1P36542 FGF14-202ENST00000376143 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATP5C1P36542 NRSN2-201ENST00000382285 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATP5C1P36542 ERBB3-202ENST00000411731 1027 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATP5C1P36542 FGF13-204ENST00000436198 1165 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATP5C1P36542 AC021723.1-201ENST00000486306 515 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
ATP5C1P36542 ALG3P1-201ENST00000508806 1114 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
ATP5C1P36542 AC126915.1-201ENST00000522847 1038 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
ATP5C1P36542 CD63-214ENST00000552692 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATP5C1P36542 VPS18-202ENST00000558474 873 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATP5C1P36542 NRN1L-202ENST00000576147 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATP5C1P36542 MIR3615-201ENST00000581999 87 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
ATP5C1P36542 NAT9-222ENST00000583476 583 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATP5C1P36542 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATP5C1P36542 RNASEH2B-202ENST00000422660 4830 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATP5C1P36542 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATP5C1P36542 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATP5C1P36542 TMEM258-207ENST00000543510 1692 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATP5C1P36542 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATP5C1P36542 RSPO1-202ENST00000401068 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATP5C1P36542 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATP5C1P36542 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATP5C1P36542 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATP5C1P36542 NFATC4-204ENST00000424781 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATP5C1P36542 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATP5C1P36542 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATP5C1P36542 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATP5C1P36542 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATP5C1P36542 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATP5C1P36542 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATP5C1P36542 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATP5C1P36542 C9orf47-201ENST00000334490 4829 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATP5C1P36542 AC018735.1-201ENST00000437208 1502 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
ATP5C1P36542 PER2-201ENST00000254657 6385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATP5C1P36542 SF1-209ENST00000433274 2317 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATP5C1P36542 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATP5C1P36542 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATP5C1P36542 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATP5C1P36542 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATP5C1P36542 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATP5C1P36542 CTHRC1-201ENST00000330295 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATP5C1P36542 PAX4-201ENST00000338516 1085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATP5C1P36542 LMO4-201ENST00000370542 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATP5C1P36542 AGER-203ENST00000375065 665 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATP5C1P36542 AC010141.1-201ENST00000411585 623 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
ATP5C1P36542 TREML1-202ENST00000426005 981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATP5C1P36542 MRPS25-203ENST00000444840 1281 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATP5C1P36542 SELENOW-201ENST00000509570 881 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATP5C1P36542 GTF2H2-204ENST00000517900 659 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATP5C1P36542 DUX4L46-201ENST00000566845 751 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
ATP5C1P36542 AC145343.1-201ENST00000579629 650 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATP5C1P36542 AC092634.5-202ENST00000587736 928 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATP5C1P36542 TNNT1-209ENST00000587758 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATP5C1P36542 AL023803.2-201ENST00000620080 638 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
ATP5C1P36542 ARAP2-201ENST00000303965 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms