Protein–RNA interactions for Protein: P35452

HOXD12, Homeobox protein Hox-D12, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD12P35452 LINC00642-202ENST00000442515 670 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
HOXD12P35452 AL136982.2-201ENST00000451760 234 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
HOXD12P35452 PRSS30P-204ENST00000489864 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HOXD12P35452 SDHD-202ENST00000525291 790 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
HOXD12P35452 RDH5-204ENST00000548082 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HOXD12P35452 COMMD4-211ENST00000564815 639 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
HOXD12P35452 C15orf40-211ENST00000565712 559 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
HOXD12P35452 AC105105.3-201ENST00000585470 646 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
HOXD12P35452 CROCCP3-204ENST00000590118 574 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
HOXD12P35452 IGFLR1-211ENST00000592889 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HOXD12P35452 AC063977.3-201ENST00000597569 547 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
HOXD12P35452 SPCS2P2-201ENST00000603270 608 ntBASIC15.07■□□□□ 0
HOXD12P35452 AL021997.3-201ENST00000621053 557 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
HOXD12P35452 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
HOXD12P35452 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HOXD12P35452 VWA7-201ENST00000375688 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
HOXD12P35452 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HOXD12P35452 CHIA-206ENST00000430615 1320 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HOXD12P35452 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
HOXD12P35452 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC15.07■□□□□ 0
HOXD12P35452 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HOXD12P35452 RGS3-201ENST00000317613 2542 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
HOXD12P35452 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HOXD12P35452 FAM153A-220ENST00000513554 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
HOXD12P35452 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HOXD12P35452 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HOXD12P35452 SPEG-201ENST00000312358 10782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
HOXD12P35452 ADORA1-201ENST00000309502 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HOXD12P35452 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HOXD12P35452 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HOXD12P35452 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
HOXD12P35452 AC245123.1-202ENST00000612422 1719 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
HOXD12P35452 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HOXD12P35452 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HOXD12P35452 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HOXD12P35452 PCDHB8-201ENST00000239444 2740 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
HOXD12P35452 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HOXD12P35452 AP004608.1-203ENST00000528482 3679 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
HOXD12P35452 MRPL55-214ENST00000366741 603 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
HOXD12P35452 MRPL55-218ENST00000366747 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HOXD12P35452 DUSP13-202ENST00000372700 781 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
HOXD12P35452 AC079807.2-203ENST00000417692 656 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
HOXD12P35452 AL035588.1-201ENST00000438967 408 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
HOXD12P35452 MSRA-203ENST00000441698 788 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
HOXD12P35452 CHMP1AP1-201ENST00000445563 662 ntBASIC15.06■□□□□ 0
HOXD12P35452 RN7SL11P-201ENST00000471305 293 ntBASIC15.06■□□□□ 0
HOXD12P35452 RAMP3-202ENST00000481345 559 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
HOXD12P35452 NME2-204ENST00000503064 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HOXD12P35452 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
HOXD12P35452 MAX-211ENST00000555667 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HOXD12P35452 AC106738.2-201ENST00000559802 557 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
HOXD12P35452 AC126696.1-201ENST00000561567 756 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
HOXD12P35452 GEMIN7-204ENST00000591747 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
HOXD12P35452 AL645939.5-201ENST00000606834 243 ntBASIC15.06■□□□□ 0
HOXD12P35452 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
HOXD12P35452 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HOXD12P35452 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
HOXD12P35452 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
HOXD12P35452 SNRNP27-202ENST00000409116 1339 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
HOXD12P35452 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
HOXD12P35452 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HOXD12P35452 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HOXD12P35452 HCRTR1-202ENST00000373706 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HOXD12P35452 HLA-DQB1-205ENST00000434651 1642 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
HOXD12P35452 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC15.06■□□□□ 0
HOXD12P35452 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
HOXD12P35452 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HOXD12P35452 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
HOXD12P35452 ATP2A3-204ENST00000397035 4182 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
HOXD12P35452 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
HOXD12P35452 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
HOXD12P35452 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
HOXD12P35452 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
HOXD12P35452 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
HOXD12P35452 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HOXD12P35452 ANKMY1-204ENST00000391987 3221 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
HOXD12P35452 ZFP64-201ENST00000216923 3264 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HOXD12P35452 TMPRSS6-202ENST00000381792 3260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
HOXD12P35452 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HOXD12P35452 LIN9-201ENST00000328205 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HOXD12P35452 PTBP1-203ENST00000356948 3598 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HOXD12P35452 BEX2-201ENST00000372674 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
HOXD12P35452 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HOXD12P35452 AL645608.5-201ENST00000398216 443 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
HOXD12P35452 CRCP-204ENST00000398684 492 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
HOXD12P35452 NREP-204ENST00000419114 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
HOXD12P35452 LINC02158-201ENST00000432377 897 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HOXD12P35452 TUBB8P8-201ENST00000458717 1058 ntBASIC15.05■□□□□ -0
HOXD12P35452 TMBIM4-205ENST00000535812 766 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
HOXD12P35452 AC025154.1-201ENST00000552806 560 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
HOXD12P35452 TMBIM4-212ENST00000556010 610 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
HOXD12P35452 AL161670.2-201ENST00000557650 1227 ntBASIC15.05■□□□□ -0
HOXD12P35452 AC016044.1-201ENST00000560818 572 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
HOXD12P35452 AC013355.1-201ENST00000562625 723 ntBASIC15.05■□□□□ -0
HOXD12P35452 RN7SL774P-201ENST00000577467 290 ntBASIC15.05■□□□□ -0
HOXD12P35452 L34079.1-201ENST00000594374 393 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
HOXD12P35452 TUBB4A-212ENST00000601152 590 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
HOXD12P35452 AP001002.3-201ENST00000623482 206 ntBASIC15.05■□□□□ -0
HOXD12P35452 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
HOXD12P35452 CHAT-212ENST00000640822 1412 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.6 ms