Protein–RNA interactions for Protein: P29973

CNGA1, cGMP-gated cation channel alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 690 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGA1P29973 VCX3B-201ENST00000381029 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CNGA1P29973 VCPKMT-201ENST00000395859 795 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CNGA1P29973 AC060234.1-201ENST00000422966 474 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CNGA1P29973 AL591684.1-201ENST00000434533 234 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CNGA1P29973 AL136982.2-201ENST00000451760 234 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CNGA1P29973 AC234782.1-201ENST00000451950 919 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
CNGA1P29973 PMP22-206ENST00000494511 872 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CNGA1P29973 IGLV3-15-201ENST00000518356 244 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
CNGA1P29973 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CNGA1P29973 AP001547.1-201ENST00000527440 374 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CNGA1P29973 CFL1-214ENST00000534769 758 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CNGA1P29973 ADIG-204ENST00000537425 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CNGA1P29973 SEC23A-204ENST00000548032 907 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CNGA1P29973 AC100827.2-201ENST00000563214 1194 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
CNGA1P29973 MIR3147-201ENST00000577811 66 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
CNGA1P29973 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CNGA1P29973 TMEM205-216ENST00000593256 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CNGA1P29973 HDDC2-204ENST00000608295 879 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CNGA1P29973 AP000346.4-201ENST00000614827 381 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
CNGA1P29973 AL136301.1-201ENST00000615830 422 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
CNGA1P29973 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CNGA1P29973 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CNGA1P29973 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CNGA1P29973 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CNGA1P29973 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CNGA1P29973 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CNGA1P29973 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CNGA1P29973 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CNGA1P29973 MEF2C-AS1-210ENST00000514011 1754 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CNGA1P29973 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
CNGA1P29973 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CNGA1P29973 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CNGA1P29973 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CNGA1P29973 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CNGA1P29973 ANKHD1-202ENST00000297183 7606 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CNGA1P29973 SEC13-208ENST00000397109 1467 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CNGA1P29973 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CNGA1P29973 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CNGA1P29973 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CNGA1P29973 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CNGA1P29973 SEPT8-206ENST00000378706 4168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CNGA1P29973 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CNGA1P29973 C11orf16-201ENST00000326053 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CNGA1P29973 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CNGA1P29973 OSCP1-204ENST00000433045 1381 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CNGA1P29973 FAM180B-201ENST00000538490 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CNGA1P29973 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CNGA1P29973 UBXN11-207ENST00000374223 1312 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CNGA1P29973 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CNGA1P29973 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CNGA1P29973 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CNGA1P29973 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CNGA1P29973 TCL1B-201ENST00000340722 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CNGA1P29973 APRT-201ENST00000378364 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CNGA1P29973 Z82214.1-201ENST00000419643 988 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CNGA1P29973 PPP2R1A-209ENST00000477989 444 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CNGA1P29973 IQSEC3P1-201ENST00000538799 536 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
CNGA1P29973 C1QTNF1-AS1-202ENST00000581579 865 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CNGA1P29973 SELENOW-204ENST00000595615 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CNGA1P29973 NEAT1-203ENST00000601801 487 ntTSL 4 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CNGA1P29973 AC006064.4-201ENST00000602946 422 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CNGA1P29973 SELENOW-216ENST00000612212 875 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CNGA1P29973 AF254983.2-201ENST00000612331 135 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
CNGA1P29973 AL136295.7-201ENST00000619226 1200 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
CNGA1P29973 AL603764.1-201ENST00000636452 321 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
CNGA1P29973 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CNGA1P29973 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CNGA1P29973 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CNGA1P29973 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CNGA1P29973 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CNGA1P29973 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CNGA1P29973 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CNGA1P29973 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
CNGA1P29973 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CNGA1P29973 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CNGA1P29973 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CNGA1P29973 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CNGA1P29973 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CNGA1P29973 WASH3P-204ENST00000558784 1644 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CNGA1P29973 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CNGA1P29973 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CNGA1P29973 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CNGA1P29973 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CNGA1P29973 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CNGA1P29973 PGA5-201ENST00000312403 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CNGA1P29973 AL359915.2-205ENST00000418015 1529 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CNGA1P29973 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CNGA1P29973 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CNGA1P29973 ACTA1-202ENST00000366684 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CNGA1P29973 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CNGA1P29973 PIGC-201ENST00000344529 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CNGA1P29973 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CNGA1P29973 CAMK1D-204ENST00000619168 8153 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CNGA1P29973 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CNGA1P29973 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CNGA1P29973 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CNGA1P29973 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CNGA1P29973 IGHA2-202ENST00000497872 1320 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CNGA1P29973 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
CNGA1P29973 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.7 ms