Protein–RNA interactions for Protein: P28358

HOXD10, Homeobox protein Hox-D10, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD10P28358 NOX5-209ENST00000530406 2289 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HOXD10P28358 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HOXD10P28358 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HOXD10P28358 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HOXD10P28358 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HOXD10P28358 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HOXD10P28358 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HOXD10P28358 FAS-202ENST00000352159 1722 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HOXD10P28358 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HOXD10P28358 USP4-203ENST00000415188 1454 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HOXD10P28358 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HOXD10P28358 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HOXD10P28358 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HOXD10P28358 LINC00665-203ENST00000438368 1863 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HOXD10P28358 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HOXD10P28358 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HOXD10P28358 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HOXD10P28358 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HOXD10P28358 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HOXD10P28358 ITSN1-205ENST00000381291 5437 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HOXD10P28358 C7orf61-201ENST00000332375 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HOXD10P28358 AC016757.1-202ENST00000409376 892 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HOXD10P28358 SAPCD1-208ENST00000415669 916 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HOXD10P28358 CSTF3-202ENST00000431742 715 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HOXD10P28358 AC114763.1-201ENST00000431985 928 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HOXD10P28358 RPL35P9-201ENST00000446059 350 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
HOXD10P28358 LAMA4-209ENST00000453937 645 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HOXD10P28358 FAM86B3P-203ENST00000523992 854 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
HOXD10P28358 PGPEP1-206ENST00000597431 545 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HOXD10P28358 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HOXD10P28358 PPP1R1B-202ENST00000394265 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HOXD10P28358 MTMR9-202ENST00000526292 1960 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HOXD10P28358 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HOXD10P28358 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HOXD10P28358 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HOXD10P28358 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HOXD10P28358 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HOXD10P28358 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HOXD10P28358 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HOXD10P28358 KIAA0513-207ENST00000567328 1873 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HOXD10P28358 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HOXD10P28358 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HOXD10P28358 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HOXD10P28358 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HOXD10P28358 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HOXD10P28358 RASGEF1B-202ENST00000335927 1756 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
HOXD10P28358 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
HOXD10P28358 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
HOXD10P28358 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
HOXD10P28358 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
HOXD10P28358 NDUFB6-203ENST00000379847 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
HOXD10P28358 TMBIM7P-202ENST00000641474 1516 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
HOXD10P28358 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
HOXD10P28358 THUMPD3-AS1-212ENST00000520447 1809 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
HOXD10P28358 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
HOXD10P28358 MRPL32-201ENST00000223324 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
HOXD10P28358 KRT17P5-201ENST00000332088 839 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
HOXD10P28358 HBB-201ENST00000335295 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
HOXD10P28358 KRTAP1-3-201ENST00000344363 972 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
HOXD10P28358 LINC00278-201ENST00000425031 528 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
HOXD10P28358 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
HOXD10P28358 SUMF2-210ENST00000437307 947 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
HOXD10P28358 Z99943.1-201ENST00000451545 718 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
HOXD10P28358 TXNRD2-206ENST00000462330 1129 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
HOXD10P28358 AL691482.3-201ENST00000504773 987 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
HOXD10P28358 AC131206.1-201ENST00000538078 1211 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
HOXD10P28358 TMIGD2-204ENST00000600349 333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
HOXD10P28358 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
HOXD10P28358 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
HOXD10P28358 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
HOXD10P28358 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
HOXD10P28358 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
HOXD10P28358 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
HOXD10P28358 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
HOXD10P28358 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
HOXD10P28358 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
HOXD10P28358 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
HOXD10P28358 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
HOXD10P28358 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
HOXD10P28358 GNAO1-205ENST00000563661 1351 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
HOXD10P28358 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
HOXD10P28358 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
HOXD10P28358 MEIKIN-205ENST00000616644 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
HOXD10P28358 XKR9-203ENST00000520030 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
HOXD10P28358 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
HOXD10P28358 TNNT2-203ENST00000367315 1083 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
HOXD10P28358 IGLC1-201ENST00000390321 460 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
HOXD10P28358 TRBV4-1-201ENST00000390357 373 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
HOXD10P28358 TRBV4-2-201ENST00000390392 455 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
HOXD10P28358 CXCL12-205ENST00000395794 1052 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
HOXD10P28358 ATP6V1E1-202ENST00000399796 1208 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
HOXD10P28358 OGFR-AS1-201ENST00000431361 668 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
HOXD10P28358 AL512306.1-201ENST00000432698 848 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
HOXD10P28358 DDX39AP1-201ENST00000445147 1181 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
HOXD10P28358 SHANK2-210ENST00000449116 939 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
HOXD10P28358 AL355803.1-201ENST00000455524 188 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
HOXD10P28358 OR2T27-202ENST00000460972 1136 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
HOXD10P28358 AC093627.2-201ENST00000497017 568 ntTSL 4 BASIC16.65■□□□□ 0.26
HOXD10P28358 AC097103.2-201ENST00000504670 602 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
HOXD10P28358 AC026410.1-201ENST00000507366 1101 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.6 ms