Protein–RNA interactions for Protein: P21127

CDK11B, Cyclin-dependent kinase 11B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 795 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK11BP21127 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CDK11BP21127 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CDK11BP21127 ARHGEF26-203ENST00000465817 2353 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CDK11BP21127 FLNA-204ENST00000369856 8241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CDK11BP21127 RBM6-201ENST00000266022 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CDK11BP21127 GREM1-202ENST00000560830 2648 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CDK11BP21127 TAB1-201ENST00000216160 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CDK11BP21127 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CDK11BP21127 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CDK11BP21127 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
CDK11BP21127 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CDK11BP21127 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
CDK11BP21127 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CDK11BP21127 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CDK11BP21127 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CDK11BP21127 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CDK11BP21127 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CDK11BP21127 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
CDK11BP21127 CHD3-203ENST00000380358 7356 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CDK11BP21127 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CDK11BP21127 PRSS8-201ENST00000317508 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CDK11BP21127 TNFAIP8L3-201ENST00000327536 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CDK11BP21127 PIK3R5-216ENST00000584803 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CDK11BP21127 BTRC-203ENST00000393441 6084 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CDK11BP21127 CACNA1G-209ENST00000502264 6921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CDK11BP21127 CACNA1G-221ENST00000510115 6912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CDK11BP21127 YIPF6-201ENST00000374622 6134 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CDK11BP21127 PROM2-201ENST00000317620 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CDK11BP21127 KCNH4-201ENST00000264661 3920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CDK11BP21127 ABCA3-202ENST00000382381 6446 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CDK11BP21127 GJD2-201ENST00000290374 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
CDK11BP21127 IMPDH1-201ENST00000338791 2881 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.34
CDK11BP21127 SLC1A7-206ENST00000620347 2873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
CDK11BP21127 IMPDH1-217ENST00000626419 2862 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
CDK11BP21127 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
CDK11BP21127 SYCP2L-201ENST00000283141 3130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
CDK11BP21127 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CDK11BP21127 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CDK11BP21127 NFATC2-203ENST00000414705 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CDK11BP21127 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CDK11BP21127 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CDK11BP21127 MYO1C-218ENST00000575158 4804 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CDK11BP21127 POLL-205ENST00000370169 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CDK11BP21127 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CDK11BP21127 ITPR3-202ENST00000605930 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CDK11BP21127 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CDK11BP21127 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CDK11BP21127 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CDK11BP21127 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CDK11BP21127 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CDK11BP21127 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CDK11BP21127 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CDK11BP21127 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
CDK11BP21127 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CDK11BP21127 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CDK11BP21127 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
CDK11BP21127 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CDK11BP21127 ADAMTS13-202ENST00000356589 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CDK11BP21127 DNAJC3-AS1-201ENST00000499499 2908 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CDK11BP21127 SMG9-201ENST00000270066 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CDK11BP21127 GGT5-202ENST00000327365 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CDK11BP21127 MAML3-203ENST00000509479 6844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CDK11BP21127 BAIAP2-220ENST00000575712 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CDK11BP21127 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CDK11BP21127 NEK11-205ENST00000507910 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CDK11BP21127 TMEM260-201ENST00000261556 4264 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CDK11BP21127 ECE1-201ENST00000264205 2381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CDK11BP21127 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CDK11BP21127 TATDN3-202ENST00000366974 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CDK11BP21127 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CDK11BP21127 COL9A2-202ENST00000372748 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CDK11BP21127 CYTH2-203ENST00000427476 4606 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CDK11BP21127 ADRB2-201ENST00000305988 3443 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CDK11BP21127 PLA2G3-201ENST00000215885 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CDK11BP21127 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CDK11BP21127 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CDK11BP21127 TOX3-201ENST00000219746 3233 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CDK11BP21127 CACNA1G-207ENST00000429973 7120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CDK11BP21127 CACNA1G-217ENST00000507336 7116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CDK11BP21127 FAM193A-201ENST00000324666 4846 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CDK11BP21127 ATP2A3-202ENST00000352011 3274 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CDK11BP21127 CAPN1-224ENST00000533129 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CDK11BP21127 TMCO3-202ENST00000434316 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CDK11BP21127 USP19-206ENST00000417901 4706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CDK11BP21127 AP000347.1-201ENST00000417194 5004 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CDK11BP21127 STK38L-201ENST00000389032 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CDK11BP21127 SERP1-201ENST00000239944 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CDK11BP21127 MYADM-203ENST00000391769 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CDK11BP21127 SEPT6-204ENST00000360156 2609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CDK11BP21127 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CDK11BP21127 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CDK11BP21127 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
CDK11BP21127 VAMP4-201ENST00000236192 5159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CDK11BP21127 BBS2-201ENST00000245157 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CDK11BP21127 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CDK11BP21127 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CDK11BP21127 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CDK11BP21127 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CDK11BP21127 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CDK11BP21127 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.3 ms