Protein–RNA interactions for Protein: P20700

LMNB1, Lamin-B1, humanhuman

Predictions only

Length 586 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMNB1P20700 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
LMNB1P20700 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
LMNB1P20700 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
LMNB1P20700 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
LMNB1P20700 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
LMNB1P20700 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
LMNB1P20700 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
LMNB1P20700 TNNT2-203ENST00000367315 1083 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
LMNB1P20700 TRBJ2-6-201ENST00000390418 53 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
LMNB1P20700 DCAF7-201ENST00000415273 1220 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
LMNB1P20700 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
LMNB1P20700 RNA5SP417-201ENST00000516459 108 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
LMNB1P20700 NAPSB-201ENST00000525179 678 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
LMNB1P20700 NEU3-207ENST00000534628 746 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
LMNB1P20700 MIA-206ENST00000597784 455 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
LMNB1P20700 BX088702.1-201ENST00000610784 235 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
LMNB1P20700 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
LMNB1P20700 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
LMNB1P20700 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
LMNB1P20700 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
LMNB1P20700 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
LMNB1P20700 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
LMNB1P20700 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
LMNB1P20700 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
LMNB1P20700 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
LMNB1P20700 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
LMNB1P20700 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
LMNB1P20700 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
LMNB1P20700 RELL1-201ENST00000314117 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
LMNB1P20700 MRPL37P1-201ENST00000592451 1337 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
LMNB1P20700 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
LMNB1P20700 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
LMNB1P20700 ALAS2-202ENST00000335854 1795 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
LMNB1P20700 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
LMNB1P20700 CNBP-201ENST00000422453 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
LMNB1P20700 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
LMNB1P20700 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
LMNB1P20700 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
LMNB1P20700 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
LMNB1P20700 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
LMNB1P20700 ELP5-203ENST00000396627 1389 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
LMNB1P20700 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
LMNB1P20700 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
LMNB1P20700 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
LMNB1P20700 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
LMNB1P20700 FERD3L-201ENST00000275461 640 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
LMNB1P20700 GDPGP1-201ENST00000329600 1193 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
LMNB1P20700 CMTM5-202ENST00000342473 725 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
LMNB1P20700 KRTAP1-3-201ENST00000344363 972 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
LMNB1P20700 BGLAP-201ENST00000368272 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
LMNB1P20700 PRTFDC1-202ENST00000376376 741 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
LMNB1P20700 CMTM5-205ENST00000397227 818 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
LMNB1P20700 KRT18P36-201ENST00000411618 1276 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
LMNB1P20700 CTHRC1-202ENST00000415886 571 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
LMNB1P20700 AL137058.1-201ENST00000418237 673 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
LMNB1P20700 TMEM222-204ENST00000466759 368 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
LMNB1P20700 AC093627.2-201ENST00000497017 568 ntTSL 4 BASIC17.96■□□□□ 0.47
LMNB1P20700 AP003068.3-201ENST00000527789 175 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
LMNB1P20700 HTATIP2-205ENST00000530266 713 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
LMNB1P20700 AC138701.2-201ENST00000553634 226 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
LMNB1P20700 CMTM5-208ENST00000555731 831 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
LMNB1P20700 FMR1-215ENST00000616382 1648 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
LMNB1P20700 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
LMNB1P20700 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
LMNB1P20700 EMP1-211ENST00000544053 1436 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
LMNB1P20700 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
LMNB1P20700 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
LMNB1P20700 C2-205ENST00000418949 1658 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
LMNB1P20700 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
LMNB1P20700 GCNT7-201ENST00000243913 2064 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
LMNB1P20700 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
LMNB1P20700 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
LMNB1P20700 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
LMNB1P20700 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
LMNB1P20700 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
LMNB1P20700 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
LMNB1P20700 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
LMNB1P20700 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
LMNB1P20700 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
LMNB1P20700 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
LMNB1P20700 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
LMNB1P20700 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
LMNB1P20700 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
LMNB1P20700 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
LMNB1P20700 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
LMNB1P20700 MRPL32-201ENST00000223324 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
LMNB1P20700 C11orf49-203ENST00000378618 1166 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
LMNB1P20700 PHACTR2-204ENST00000397980 745 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
LMNB1P20700 GUSBP10-201ENST00000417412 665 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
LMNB1P20700 DUX4L50-201ENST00000455245 715 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
LMNB1P20700 RHEB-207ENST00000496004 744 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
LMNB1P20700 CHTF8-204ENST00000518041 567 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
LMNB1P20700 FXYD6-FXYD2-201ENST00000532984 670 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
LMNB1P20700 NAA40-206ENST00000542163 1035 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
LMNB1P20700 AC134312.2-201ENST00000563521 608 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
LMNB1P20700 NPLOC4-209ENST00000572760 946 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
LMNB1P20700 TXNDC17-208ENST00000574838 746 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
LMNB1P20700 PGPEP1-206ENST00000597431 545 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
LMNB1P20700 PEBP1P2-201ENST00000603980 558 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
LMNB1P20700 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.8 ms