Protein–RNA interactions for Protein: P19387

POLR2C, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 275 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2CP19387 LINC02273-201ENST00000499452 1592 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
POLR2CP19387 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
POLR2CP19387 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
POLR2CP19387 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
POLR2CP19387 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
POLR2CP19387 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
POLR2CP19387 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
POLR2CP19387 SYNGAP1-203ENST00000428982 4339 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
POLR2CP19387 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
POLR2CP19387 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
POLR2CP19387 ZFP30-201ENST00000351218 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
POLR2CP19387 TOMM40L-201ENST00000367987 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
POLR2CP19387 SYBU-235ENST00000533895 3244 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
POLR2CP19387 DBNDD2-201ENST00000357275 1036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
POLR2CP19387 DBI-203ENST00000393103 599 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
POLR2CP19387 IFITM3-201ENST00000399808 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
POLR2CP19387 CD8B2-202ENST00000417670 633 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
POLR2CP19387 POM121L8P-201ENST00000417732 1281 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
POLR2CP19387 POM121L9P-203ENST00000441984 1285 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
POLR2CP19387 LRRC74B-201ENST00000442047 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
POLR2CP19387 RNA5SP412-201ENST00000516234 123 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
POLR2CP19387 AC012574.2-201ENST00000520375 443 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
POLR2CP19387 CCKBR-204ENST00000531712 463 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
POLR2CP19387 HNRNPA1P48-202ENST00000565308 961 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
POLR2CP19387 DMAC2-208ENST00000589970 979 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
POLR2CP19387 DMAC2-215ENST00000597457 492 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
POLR2CP19387 AC011510.1-201ENST00000598541 286 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
POLR2CP19387 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
POLR2CP19387 IGFBP5-201ENST00000233813 6215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
POLR2CP19387 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
POLR2CP19387 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
POLR2CP19387 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
POLR2CP19387 POU5F1-204ENST00000471529 1723 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
POLR2CP19387 REXO1L6P-201ENST00000603433 1515 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
POLR2CP19387 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
POLR2CP19387 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
POLR2CP19387 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
POLR2CP19387 PRG2-202ENST00000525955 1367 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
POLR2CP19387 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
POLR2CP19387 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
POLR2CP19387 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
POLR2CP19387 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
POLR2CP19387 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
POLR2CP19387 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
POLR2CP19387 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
POLR2CP19387 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
POLR2CP19387 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
POLR2CP19387 TACR2-201ENST00000373306 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
POLR2CP19387 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
POLR2CP19387 CCDC6-201ENST00000263102 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
POLR2CP19387 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
POLR2CP19387 HOXA3-201ENST00000317201 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
POLR2CP19387 KCNJ2-202ENST00000535240 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
POLR2CP19387 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
POLR2CP19387 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
POLR2CP19387 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
POLR2CP19387 PLEKHB2-207ENST00000438882 1460 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
POLR2CP19387 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
POLR2CP19387 APBB1-221ENST00000609360 2642 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
POLR2CP19387 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
POLR2CP19387 CUL3-202ENST00000344951 6592 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
POLR2CP19387 LINC01305-201ENST00000420866 3123 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
POLR2CP19387 LCE1E-202ENST00000368771 575 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
POLR2CP19387 C9orf16-201ENST00000372994 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
POLR2CP19387 PRTFDC1-203ENST00000376378 747 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
POLR2CP19387 IGHV3-53-201ENST00000390627 571 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
POLR2CP19387 AC017104.1-201ENST00000415129 720 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
POLR2CP19387 FAM8A4P-201ENST00000435433 1213 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
POLR2CP19387 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
POLR2CP19387 TMEM225B-203ENST00000453227 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
POLR2CP19387 CENPM-208ENST00000472374 541 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
POLR2CP19387 AC106772.2-201ENST00000515085 442 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
POLR2CP19387 MUTYH-237ENST00000531105 501 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
POLR2CP19387 TNNT1-212ENST00000588981 1163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
POLR2CP19387 AC009542.2-202ENST00000619004 1067 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
POLR2CP19387 SLC5A10-202ENST00000395643 1982 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
POLR2CP19387 AC010247.2-201ENST00000559786 1955 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
POLR2CP19387 ITSN1-212ENST00000399367 5722 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
POLR2CP19387 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
POLR2CP19387 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
POLR2CP19387 MAST1-201ENST00000251472 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
POLR2CP19387 COMP-201ENST00000222271 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
POLR2CP19387 COL5A1-208ENST00000618395 8437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
POLR2CP19387 SLC12A8-207ENST00000469902 2989 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
POLR2CP19387 ZNF84-202ENST00000392319 7020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
POLR2CP19387 KIF22-208ENST00000569382 2020 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
POLR2CP19387 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
POLR2CP19387 TP53INP1-201ENST00000342697 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
POLR2CP19387 CTXND1-201ENST00000560778 6890 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
POLR2CP19387 ELN-208ENST00000380575 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
POLR2CP19387 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
POLR2CP19387 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
POLR2CP19387 APBB1-219ENST00000608704 2095 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
POLR2CP19387 TBC1D8-202ENST00000409318 3803 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
POLR2CP19387 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
POLR2CP19387 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
POLR2CP19387 B9D1-209ENST00000477478 1353 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
POLR2CP19387 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
POLR2CP19387 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
POLR2CP19387 WDR97-201ENST00000323662 6916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
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