Protein–RNA interactions for Protein: P15056

BRAF, Serine/threonine-protein kinase B-raf, humanhuman

Predictions only

Length 766 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRAFP15056 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
BRAFP15056 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
BRAFP15056 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
BRAFP15056 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
BRAFP15056 PAPOLA-201ENST00000216277 4519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
BRAFP15056 TFR2-201ENST00000223051 2888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
BRAFP15056 AP3M2-201ENST00000174653 3661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
BRAFP15056 OSBPL5-202ENST00000348039 2798 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
BRAFP15056 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
BRAFP15056 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
BRAFP15056 POU6F1-208ENST00000550824 2664 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
BRAFP15056 NDUFC2-201ENST00000281031 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
BRAFP15056 FOXD4L5-201ENST00000377420 3109 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
BRAFP15056 HNRNPH3-201ENST00000265866 2339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
BRAFP15056 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
BRAFP15056 AC005252.3-201ENST00000623855 2258 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
BRAFP15056 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
BRAFP15056 ADAM15-206ENST00000368412 2804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
BRAFP15056 VILL-202ENST00000383759 2787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
BRAFP15056 SNX2-201ENST00000379516 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
BRAFP15056 MINDY4-201ENST00000265299 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
BRAFP15056 WNT2B-202ENST00000369684 3818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
BRAFP15056 PLA2G16-201ENST00000323646 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
BRAFP15056 MAOB-201ENST00000378069 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
BRAFP15056 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
BRAFP15056 ADI1-201ENST00000327435 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
BRAFP15056 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
BRAFP15056 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
BRAFP15056 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
BRAFP15056 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
BRAFP15056 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
BRAFP15056 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
BRAFP15056 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
BRAFP15056 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
BRAFP15056 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
BRAFP15056 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
BRAFP15056 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
BRAFP15056 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
BRAFP15056 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
BRAFP15056 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
BRAFP15056 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
BRAFP15056 TNFAIP8L3-201ENST00000327536 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
BRAFP15056 FAM107A-206ENST00000474531 2271 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
BRAFP15056 CNN2-201ENST00000263097 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
BRAFP15056 CNN2-205ENST00000562958 2194 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
BRAFP15056 SNX14-203ENST00000369627 3111 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
BRAFP15056 ERLIN2-205ENST00000518586 2623 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
BRAFP15056 EXTL1-201ENST00000374280 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
BRAFP15056 IKBKB-217ENST00000520810 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
BRAFP15056 CLK4-201ENST00000316308 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
BRAFP15056 GFRA1-201ENST00000355422 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
BRAFP15056 ATP6V0A1-203ENST00000393829 3028 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
BRAFP15056 ASPG-206ENST00000551177 4851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
BRAFP15056 GABRA1-201ENST00000023897 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
BRAFP15056 NIN-202ENST00000324330 4364 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
BRAFP15056 ENO2-211ENST00000541477 2549 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
BRAFP15056 EIF5-202ENST00000392715 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
BRAFP15056 GRIN2C-201ENST00000293190 4261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
BRAFP15056 ZFP30-201ENST00000351218 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
BRAFP15056 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
BRAFP15056 HOGA1-203ENST00000370647 1999 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
BRAFP15056 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
BRAFP15056 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
BRAFP15056 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
BRAFP15056 TBC1D17-201ENST00000221543 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
BRAFP15056 TBC1D17-209ENST00000622860 2370 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
BRAFP15056 OSBPL8-203ENST00000393250 3157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
BRAFP15056 CBX3-202ENST00000396386 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
BRAFP15056 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
BRAFP15056 AC015802.1-201ENST00000588104 1449 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
BRAFP15056 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
BRAFP15056 LINC01138-206ENST00000622328 2212 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
BRAFP15056 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
BRAFP15056 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
BRAFP15056 ARHGEF7-201ENST00000218789 5233 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
BRAFP15056 REPS1-221ENST00000626459 3665 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
BRAFP15056 PHKG1-210ENST00000537360 2139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
BRAFP15056 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
BRAFP15056 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
BRAFP15056 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
BRAFP15056 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
BRAFP15056 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
BRAFP15056 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
BRAFP15056 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
BRAFP15056 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
BRAFP15056 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
BRAFP15056 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
BRAFP15056 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
BRAFP15056 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
BRAFP15056 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
BRAFP15056 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
BRAFP15056 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
BRAFP15056 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
BRAFP15056 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
BRAFP15056 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
BRAFP15056 GAS2L2-202ENST00000604641 3014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
BRAFP15056 SIGLEC6-202ENST00000346477 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
BRAFP15056 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
BRAFP15056 SEZ6-203ENST00000360295 4306 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
BRAFP15056 SUGP2-202ENST00000337018 3640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.2 ms