Protein–RNA interactions for Protein: P12036

NEFH, Neurofilament heavy polypeptide, humanhuman

Predictions only

Length 1,026 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEFHP12036 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NEFHP12036 RNF216-202ENST00000389902 3293 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NEFHP12036 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NEFHP12036 RPS27L-201ENST00000330964 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NEFHP12036 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NEFHP12036 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NEFHP12036 GTPBP4-202ENST00000360803 5075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NEFHP12036 APBB1-201ENST00000299402 2636 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NEFHP12036 TMPRSS3-203ENST00000398405 2754 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NEFHP12036 MARVELD3-201ENST00000268485 2912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NEFHP12036 MAP2K7-203ENST00000397983 3396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NEFHP12036 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NEFHP12036 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NEFHP12036 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NEFHP12036 PAPD7-207ENST00000631941 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NEFHP12036 AL365205.1-204ENST00000359201 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NEFHP12036 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
NEFHP12036 GPRC5C-202ENST00000392627 2988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NEFHP12036 FARP2-201ENST00000264042 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NEFHP12036 MDM1-203ENST00000393543 2718 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NEFHP12036 NRP2-205ENST00000412873 2730 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NEFHP12036 PAX6-202ENST00000379107 2579 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NEFHP12036 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NEFHP12036 SHPK-201ENST00000225519 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NEFHP12036 ITGB2-203ENST00000355153 2913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NEFHP12036 RTL10-202ENST00000405640 6785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NEFHP12036 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NEFHP12036 FOXD4L5-201ENST00000377420 3109 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NEFHP12036 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NEFHP12036 LINC00475-202ENST00000416438 2506 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NEFHP12036 PABPC1-201ENST00000318607 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NEFHP12036 METTL13-202ENST00000362019 3022 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NEFHP12036 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NEFHP12036 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NEFHP12036 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NEFHP12036 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NEFHP12036 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NEFHP12036 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NEFHP12036 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
NEFHP12036 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NEFHP12036 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NEFHP12036 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
NEFHP12036 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
NEFHP12036 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
NEFHP12036 RNF44-201ENST00000274811 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NEFHP12036 ANKRD36-204ENST00000461153 6102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NEFHP12036 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NEFHP12036 EIF3A-201ENST00000369144 6646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NEFHP12036 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NEFHP12036 HIST1H2AG-201ENST00000359193 2250 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NEFHP12036 KCNH6-202ENST00000456941 2928 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NEFHP12036 SYMPK-214ENST00000599814 6537 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NEFHP12036 NOC2L-201ENST00000327044 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NEFHP12036 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NEFHP12036 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NEFHP12036 TMEM117-207ENST00000551577 2643 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NEFHP12036 AC113189.2-201ENST00000575310 1975 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NEFHP12036 AC011455.3-201ENST00000599996 1967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NEFHP12036 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NEFHP12036 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NEFHP12036 STK3-201ENST00000419617 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NEFHP12036 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NEFHP12036 PITRM1-206ENST00000451104 3183 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NEFHP12036 ZNF747-202ENST00000395094 3504 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NEFHP12036 OS9-201ENST00000257966 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NEFHP12036 HDAC2-206ENST00000519108 2000 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NEFHP12036 MLXIP-208ENST00000538698 5097 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NEFHP12036 SEMA3F-202ENST00000413852 3212 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NEFHP12036 STIP1-203ENST00000358794 2743 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NEFHP12036 KLHL8-201ENST00000273963 5621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NEFHP12036 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NEFHP12036 NTNG1-204ENST00000370067 4628 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NEFHP12036 GPC4-201ENST00000370828 4960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NEFHP12036 GRIA4-201ENST00000282499 5508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NEFHP12036 PTPRK-204ENST00000368210 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NEFHP12036 PDE7B-203ENST00000615259 5234 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NEFHP12036 TKT-201ENST00000296289 1931 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NEFHP12036 PPCDC-201ENST00000342932 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NEFHP12036 GNAO1-214ENST00000638705 3529 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NEFHP12036 ITPK1-207ENST00000555495 3035 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NEFHP12036 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NEFHP12036 AP1B1-201ENST00000317368 3903 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NEFHP12036 GABPB1-201ENST00000220429 2726 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NEFHP12036 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NEFHP12036 KDM1B-201ENST00000297792 3811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NEFHP12036 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NEFHP12036 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NEFHP12036 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NEFHP12036 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
NEFHP12036 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NEFHP12036 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NEFHP12036 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NEFHP12036 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
NEFHP12036 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NEFHP12036 DNAJA1-201ENST00000330899 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NEFHP12036 XRCC3-211ENST00000555055 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NEFHP12036 VILL-202ENST00000383759 2787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NEFHP12036 YIPF6-201ENST00000374622 6134 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NEFHP12036 RNF43-208ENST00000584437 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NEFHP12036 AC104129.1-202ENST00000480694 4481 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms