Protein–RNA interactions for Protein: P11388

TOP2A, DNA topoisomerase 2-alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP2AP11388 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TOP2AP11388 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TOP2AP11388 MAGED4B-207ENST00000485287 2618 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TOP2AP11388 IL17B-201ENST00000261796 696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TOP2AP11388 SPATA8-201ENST00000328504 1083 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TOP2AP11388 KRTAP2-2-201ENST00000398477 733 ntAPPRIS P2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TOP2AP11388 DMKN-229ENST00000467637 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TOP2AP11388 AC004889.1-205ENST00000493248 531 ntTSL 4 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TOP2AP11388 OR2A1-AS1-210ENST00000496968 531 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
TOP2AP11388 ROPN1B-203ENST00000505382 713 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TOP2AP11388 MRPS10-201ENST00000053468 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TOP2AP11388 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TOP2AP11388 FXYD3-204ENST00000603181 758 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TOP2AP11388 AL118522.1-201ENST00000611368 560 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
TOP2AP11388 AL451007.2-201ENST00000632004 563 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
TOP2AP11388 AC027559.1-203ENST00000635726 517 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TOP2AP11388 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TOP2AP11388 AC237221.1-201ENST00000561575 1881 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TOP2AP11388 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TOP2AP11388 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TOP2AP11388 PRAMEF8-202ENST00000614831 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TOP2AP11388 PRAMEF7-202ENST00000616979 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TOP2AP11388 PSME2-201ENST00000216802 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TOP2AP11388 LAIR1-209ENST00000434277 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TOP2AP11388 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TOP2AP11388 VEGFA-201ENST00000230480 993 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TOP2AP11388 PPM1N-205ENST00000401705 771 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TOP2AP11388 CXorf40A-205ENST00000423540 1208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TOP2AP11388 C17orf58-202ENST00000449250 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TOP2AP11388 AC024293.1-201ENST00000467930 498 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
TOP2AP11388 AC009487.3-201ENST00000505579 560 ntTSL 4 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TOP2AP11388 KRT8P2-201ENST00000556193 944 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
TOP2AP11388 ADGRE3-204ENST00000595472 486 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TOP2AP11388 AC011247.3-201ENST00000603297 438 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
TOP2AP11388 DUSP22-213ENST00000605035 1231 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TOP2AP11388 AC021016.3-201ENST00000608367 477 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
TOP2AP11388 BTNL8-211ENST00000610640 1488 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TOP2AP11388 GMEB1-202ENST00000361872 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TOP2AP11388 AL591122.2-201ENST00000624125 1853 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
TOP2AP11388 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TOP2AP11388 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TOP2AP11388 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TOP2AP11388 YIPF3-213ENST00000506469 1444 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TOP2AP11388 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TOP2AP11388 CBX3-201ENST00000337620 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TOP2AP11388 TRIM3-215ENST00000639856 2137 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TOP2AP11388 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TOP2AP11388 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TOP2AP11388 COX20P1-201ENST00000366529 357 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
TOP2AP11388 AP001062.3-202ENST00000444409 619 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TOP2AP11388 MRPL49-209ENST00000534078 518 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TOP2AP11388 LINC02285-201ENST00000557121 943 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TOP2AP11388 RN7SL596P-201ENST00000582123 288 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
TOP2AP11388 AC114296.1-204ENST00000637197 1173 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TOP2AP11388 TTC39A-216ENST00000530004 1780 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TOP2AP11388 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TOP2AP11388 FXYD3-208ENST00000604404 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TOP2AP11388 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
TOP2AP11388 MYRF-203ENST00000389602 2052 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TOP2AP11388 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TOP2AP11388 MSI2-202ENST00000322684 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TOP2AP11388 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TOP2AP11388 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
TOP2AP11388 MBD1-225ENST00000591535 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TOP2AP11388 AC082651.3-201ENST00000474667 1947 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TOP2AP11388 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TOP2AP11388 MX1-218ENST00000619682 1980 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TOP2AP11388 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TOP2AP11388 C1orf228-218ENST00000458657 1818 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TOP2AP11388 GON7-201ENST00000306954 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TOP2AP11388 KRTAP1-3-201ENST00000344363 972 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TOP2AP11388 BAX-205ENST00000391871 687 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TOP2AP11388 RPL35P9-201ENST00000446059 350 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
TOP2AP11388 ZNF286A-212ENST00000580259 527 ntTSL 4 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TOP2AP11388 AL136040.2-201ENST00000618431 1130 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TOP2AP11388 DUOXA1-216ENST00000613425 1867 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TOP2AP11388 ING4-207ENST00000446105 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TOP2AP11388 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TOP2AP11388 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TOP2AP11388 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TOP2AP11388 MLF1-217ENST00000619577 2290 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TOP2AP11388 AL513315.1-201ENST00000640756 1370 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TOP2AP11388 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TOP2AP11388 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TOP2AP11388 NBPF3-205ENST00000454000 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TOP2AP11388 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TOP2AP11388 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TOP2AP11388 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TOP2AP11388 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TOP2AP11388 AL672207.1-201ENST00000328462 1570 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
TOP2AP11388 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TOP2AP11388 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TOP2AP11388 MMP7-201ENST00000260227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TOP2AP11388 AC018814.1-201ENST00000418972 357 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TOP2AP11388 RN7SL23P-201ENST00000484055 275 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
TOP2AP11388 AC140658.4-201ENST00000561990 352 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
TOP2AP11388 ZSCAN10-205ENST00000572548 618 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TOP2AP11388 HKR1-225ENST00000592168 566 ntTSL 4 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TOP2AP11388 GLUD1P2-203ENST00000631118 486 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TOP2AP11388 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 96.3 ms