Protein–RNA interactions for Protein: P10914

IRF1, Interferon regulatory factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 325 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF1P10914 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
IRF1P10914 ST7L-202ENST00000358039 4528 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
IRF1P10914 ACTN2-206ENST00000542672 4906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
IRF1P10914 NPHP4-201ENST00000378156 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
IRF1P10914 CBX3-203ENST00000409747 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
IRF1P10914 ADCYAP1R1-204ENST00000409489 1761 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
IRF1P10914 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
IRF1P10914 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
IRF1P10914 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
IRF1P10914 CSGALNACT1-211ENST00000522854 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
IRF1P10914 PYROXD2-201ENST00000370575 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
IRF1P10914 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
IRF1P10914 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
IRF1P10914 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
IRF1P10914 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
IRF1P10914 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
IRF1P10914 SNPH-202ENST00000381873 4995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
IRF1P10914 STK17B-201ENST00000263955 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
IRF1P10914 CUX1-214ENST00000550008 4350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
IRF1P10914 AFF3-203ENST00000409579 4342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
IRF1P10914 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
IRF1P10914 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
IRF1P10914 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
IRF1P10914 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
IRF1P10914 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
IRF1P10914 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
IRF1P10914 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
IRF1P10914 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
IRF1P10914 HNRNPR-212ENST00000606561 1837 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
IRF1P10914 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
IRF1P10914 UHMK1-202ENST00000489294 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
IRF1P10914 CCNY-201ENST00000265375 4768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
IRF1P10914 SUMO1-203ENST00000392246 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
IRF1P10914 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
IRF1P10914 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
IRF1P10914 CALCOCO2-211ENST00000508679 1396 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
IRF1P10914 SPIN2A-201ENST00000374906 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
IRF1P10914 C9orf24-201ENST00000297623 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
IRF1P10914 C9orf24-205ENST00000379133 712 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
IRF1P10914 AL136309.1-201ENST00000403917 691 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
IRF1P10914 RN7SKP175-201ENST00000408472 289 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
IRF1P10914 GPAA1P2-201ENST00000417923 928 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
IRF1P10914 CHMP1AP1-201ENST00000445563 662 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
IRF1P10914 USE1-202ENST00000445667 795 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
IRF1P10914 AC090502.1-202ENST00000515416 966 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
IRF1P10914 AP001258.2-201ENST00000529891 490 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
IRF1P10914 DBNDD1-206ENST00000568838 993 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
IRF1P10914 AC129510.1-201ENST00000579979 555 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
IRF1P10914 LINC00479-204ENST00000589300 718 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
IRF1P10914 SEPT9-233ENST00000590917 541 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
IRF1P10914 AC011495.3-201ENST00000596472 427 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
IRF1P10914 IRF3-223ENST00000599223 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
IRF1P10914 LINC00595-217ENST00000635545 549 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
IRF1P10914 AC002472.3-201ENST00000640124 621 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
IRF1P10914 CPSF7-205ENST00000439958 3524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
IRF1P10914 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
IRF1P10914 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
IRF1P10914 UBE4B-201ENST00000253251 4772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
IRF1P10914 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
IRF1P10914 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
IRF1P10914 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
IRF1P10914 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
IRF1P10914 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
IRF1P10914 NDC1-201ENST00000371429 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
IRF1P10914 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
IRF1P10914 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
IRF1P10914 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
IRF1P10914 EGFR-206ENST00000454757 5464 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
IRF1P10914 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
IRF1P10914 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
IRF1P10914 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
IRF1P10914 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
IRF1P10914 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
IRF1P10914 HMBOX1-210ENST00000523613 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
IRF1P10914 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
IRF1P10914 AC018735.1-201ENST00000437208 1502 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
IRF1P10914 TMEM184C-204ENST00000508208 1528 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
IRF1P10914 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
IRF1P10914 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
IRF1P10914 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
IRF1P10914 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
IRF1P10914 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
IRF1P10914 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
IRF1P10914 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
IRF1P10914 SLC35G5-201ENST00000382435 1321 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
IRF1P10914 MEIKIN-203ENST00000442687 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
IRF1P10914 WDR45-224ENST00000485908 1301 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
IRF1P10914 C8orf74-201ENST00000304519 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
IRF1P10914 C3orf22-201ENST00000318225 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
IRF1P10914 NCR3-201ENST00000340027 1042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
IRF1P10914 PRDX5-203ENST00000352435 596 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
IRF1P10914 C9orf24-203ENST00000379126 496 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
IRF1P10914 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
IRF1P10914 MIR663B-201ENST00000408361 115 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
IRF1P10914 NME6-203ENST00000415644 849 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
IRF1P10914 HNRNPA1P63-201ENST00000427917 963 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
IRF1P10914 LINC01762-204ENST00000434879 436 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
IRF1P10914 AL355994.3-201ENST00000437156 466 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
IRF1P10914 OARD1-212ENST00000482515 832 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
IRF1P10914 AC113192.2-201ENST00000525320 308 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.2 ms