Protein–RNA interactions for Protein: O95237

LRAT, Lecithin retinol acyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRATO95237 VPS36-207ENST00000611132 4607 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
LRATO95237 ZMYND15-201ENST00000269289 2448 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
LRATO95237 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
LRATO95237 UNC13A-202ENST00000519716 9838 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
LRATO95237 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
LRATO95237 HNRNPLL-205ENST00000409636 3980 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
LRATO95237 LRP8-201ENST00000306052 7648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
LRATO95237 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
LRATO95237 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
LRATO95237 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
LRATO95237 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
LRATO95237 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
LRATO95237 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
LRATO95237 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
LRATO95237 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
LRATO95237 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
LRATO95237 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
LRATO95237 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
LRATO95237 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.51□□□□□ -0.09
LRATO95237 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
LRATO95237 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
LRATO95237 NUP98-203ENST00000359171 7023 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
LRATO95237 TPO-201ENST00000329066 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
LRATO95237 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
LRATO95237 LRRC20-204ENST00000373224 3095 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
LRATO95237 AC108134.1-201ENST00000382225 3061 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
LRATO95237 TJP3-207ENST00000589378 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
LRATO95237 SLC27A3-201ENST00000271857 3351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
LRATO95237 AC090099.1-203ENST00000527059 2945 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
LRATO95237 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
LRATO95237 ADAM15-204ENST00000359280 2874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
LRATO95237 ALDH4A1-205ENST00000538309 1940 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
LRATO95237 TMEM170A-207ENST00000569540 2331 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
LRATO95237 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
LRATO95237 SMARCA4-214ENST00000589677 5181 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
LRATO95237 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
LRATO95237 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
LRATO95237 DFNA5-201ENST00000342947 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
LRATO95237 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
LRATO95237 TC2N-206ENST00000556018 1770 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
LRATO95237 RPS6KL1-210ENST00000555647 3309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
LRATO95237 AFDN-205ENST00000392108 6812 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
LRATO95237 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
LRATO95237 TRIM67-201ENST00000366653 3936 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
LRATO95237 MSTO1-201ENST00000245564 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
LRATO95237 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
LRATO95237 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
LRATO95237 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
LRATO95237 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
LRATO95237 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
LRATO95237 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
LRATO95237 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
LRATO95237 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
LRATO95237 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
LRATO95237 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
LRATO95237 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
LRATO95237 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
LRATO95237 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
LRATO95237 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
LRATO95237 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
LRATO95237 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
LRATO95237 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
LRATO95237 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
LRATO95237 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
LRATO95237 RIMS1-214ENST00000518273 4116 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
LRATO95237 RNF123-202ENST00000432042 2670 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
LRATO95237 SAFB-201ENST00000292123 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
LRATO95237 CDH23-201ENST00000224721 11139 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
LRATO95237 CDH23-214ENST00000622827 11122 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
LRATO95237 BCAT2-201ENST00000316273 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
LRATO95237 PNMA1-201ENST00000316836 2590 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
LRATO95237 AL137783.1-201ENST00000623494 1896 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
LRATO95237 PML-201ENST00000268058 4508 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
LRATO95237 XRCC1-201ENST00000262887 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
LRATO95237 AL391244.1-206ENST00000447725 1843 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
LRATO95237 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
LRATO95237 AC097374.1-201ENST00000568768 6624 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
LRATO95237 MKS1-202ENST00000393119 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
LRATO95237 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
LRATO95237 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
LRATO95237 TAF5-201ENST00000369839 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
LRATO95237 TAF4B-203ENST00000578121 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
LRATO95237 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
LRATO95237 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
LRATO95237 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
LRATO95237 TNRC18-203ENST00000399537 10572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
LRATO95237 TNRC18-205ENST00000430969 10562 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
LRATO95237 CEP131-208ENST00000575907 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
LRATO95237 MAP3K11-208ENST00000530153 2830 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
LRATO95237 MAGED4B-202ENST00000360134 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
LRATO95237 ABCB7-202ENST00000339447 2234 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
LRATO95237 SCFD2-201ENST00000388940 2221 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
LRATO95237 TBC1D24-205ENST00000567020 6673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
LRATO95237 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
LRATO95237 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
LRATO95237 CCNDBP1-201ENST00000300213 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
LRATO95237 WNT7B-201ENST00000339464 3919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
LRATO95237 CYB561-201ENST00000360793 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
LRATO95237 KHNYN-201ENST00000251343 6725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
LRATO95237 WHRN-202ENST00000362057 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89.6 ms