Protein–RNA interactions for Protein: O75427

LRCH4, Leucine-rich repeat and calponin homology domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 683 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRCH4O75427 AC131206.1-201ENST00000538078 1211 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
LRCH4O75427 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LRCH4O75427 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LRCH4O75427 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LRCH4O75427 HIRIP3-204ENST00000564026 988 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LRCH4O75427 AP000439.4-201ENST00000567742 664 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LRCH4O75427 DHRS7C-202ENST00000571134 984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LRCH4O75427 RN7SL48P-201ENST00000579283 293 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
LRCH4O75427 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
LRCH4O75427 CCL5-202ENST00000605140 1244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LRCH4O75427 AC138696.2-201ENST00000607376 223 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
LRCH4O75427 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LRCH4O75427 ENPP7P14-201ENST00000621765 1040 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
LRCH4O75427 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LRCH4O75427 MICB-201ENST00000252229 2446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LRCH4O75427 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LRCH4O75427 PTPN5-204ENST00000396170 3871 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LRCH4O75427 HTR7-203ENST00000371719 3033 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LRCH4O75427 RNF122-201ENST00000256257 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LRCH4O75427 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LRCH4O75427 GAD2-201ENST00000259271 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LRCH4O75427 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LRCH4O75427 AC108134.1-201ENST00000382225 3061 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LRCH4O75427 TJP3-202ENST00000541714 3350 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LRCH4O75427 COMT-205ENST00000406520 1339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LRCH4O75427 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LRCH4O75427 SELPLG-202ENST00000388962 1613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LRCH4O75427 HLA-DQB1-205ENST00000434651 1642 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LRCH4O75427 SUCO-210ENST00000616058 5495 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LRCH4O75427 ATL3-203ENST00000538786 1920 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LRCH4O75427 RUBCNL-212ENST00000631139 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LRCH4O75427 MLF1-201ENST00000355893 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LRCH4O75427 POLR2E-213ENST00000615234 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LRCH4O75427 HTR7-202ENST00000336152 3126 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LRCH4O75427 FGFR3-203ENST00000352904 3733 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LRCH4O75427 FDFT1-202ENST00000443614 1393 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LRCH4O75427 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LRCH4O75427 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LRCH4O75427 ATP6AP2-211ENST00000636196 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LRCH4O75427 SYT17-201ENST00000355377 3081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LRCH4O75427 STAG3L2-201ENST00000426587 2130 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LRCH4O75427 PPP1R13L-202ENST00000418234 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LRCH4O75427 POLR2B-205ENST00000441246 3839 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LRCH4O75427 LINC00163-201ENST00000434081 2155 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LRCH4O75427 P2RX5-208ENST00000552050 1536 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LRCH4O75427 AC011840.2-201ENST00000563063 1520 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
LRCH4O75427 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LRCH4O75427 CTBP1-209ENST00000510568 4250 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LRCH4O75427 ALDOA-209ENST00000563060 1550 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LRCH4O75427 ARHGAP4-203ENST00000370028 3372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LRCH4O75427 PLAU-202ENST00000446342 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LRCH4O75427 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LRCH4O75427 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LRCH4O75427 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LRCH4O75427 KCTD10-208ENST00000540089 3096 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LRCH4O75427 FGF6-201ENST00000228837 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LRCH4O75427 UEVLD-201ENST00000300038 995 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LRCH4O75427 TSPO-202ENST00000337554 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LRCH4O75427 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LRCH4O75427 RHCE-205ENST00000349438 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LRCH4O75427 TNNI1-203ENST00000367312 1100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LRCH4O75427 EIF1AX-201ENST00000379593 765 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LRCH4O75427 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LRCH4O75427 SNHG11-212ENST00000449351 954 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LRCH4O75427 AC093904.1-201ENST00000474561 455 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LRCH4O75427 AC011495.1-201ENST00000498085 584 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
LRCH4O75427 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
LRCH4O75427 IL32-218ENST00000530890 774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LRCH4O75427 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LRCH4O75427 LINC01595-201ENST00000555406 639 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LRCH4O75427 GLIS2-AS1-201ENST00000576080 340 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LRCH4O75427 FXYD6-216ENST00000584230 566 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LRCH4O75427 TMEM205-208ENST00000587948 688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LRCH4O75427 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LRCH4O75427 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LRCH4O75427 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LRCH4O75427 PRMT9-201ENST00000322396 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LRCH4O75427 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LRCH4O75427 FAM189A2-201ENST00000257515 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LRCH4O75427 ALDOA-203ENST00000395248 2447 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LRCH4O75427 CLIC5-208ENST00000544153 2051 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LRCH4O75427 ICAM2-201ENST00000412356 1334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LRCH4O75427 EIF3J-AS1-201ENST00000313807 2863 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LRCH4O75427 TBP-206ENST00000540980 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LRCH4O75427 POLR2E-211ENST00000612655 1749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LRCH4O75427 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LRCH4O75427 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LRCH4O75427 TGM6-202ENST00000381423 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LRCH4O75427 CLK4-201ENST00000316308 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LRCH4O75427 XRCC3-211ENST00000555055 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LRCH4O75427 SAFB-201ENST00000292123 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LRCH4O75427 CDKN2AIP-201ENST00000302350 2646 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LRCH4O75427 PRKAG2-215ENST00000492843 2699 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LRCH4O75427 ATXN10-202ENST00000381061 3135 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LRCH4O75427 INE2-201ENST00000630399 1874 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
LRCH4O75427 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LRCH4O75427 TMEM51-204ENST00000428417 1942 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.09
LRCH4O75427 SLC5A10-202ENST00000395643 1982 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
LRCH4O75427 DNAJC14-201ENST00000317269 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
LRCH4O75427 ALDH8A1-204ENST00000367847 1587 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51 ms