Protein–RNA interactions for Protein: O15315

RAD51B, DNA repair protein RAD51 homolog 2, humanhuman

Predictions only

Length 384 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD51BO15315 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RAD51BO15315 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RAD51BO15315 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RAD51BO15315 PKIG-204ENST00000372889 1489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RAD51BO15315 COL11A2-202ENST00000361917 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RAD51BO15315 CCNY-201ENST00000265375 4768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RAD51BO15315 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RAD51BO15315 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RAD51BO15315 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RAD51BO15315 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RAD51BO15315 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RAD51BO15315 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RAD51BO15315 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAD51BO15315 PAPOLA-223ENST00000557320 3264 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAD51BO15315 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAD51BO15315 SH2D3C-206ENST00000429553 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAD51BO15315 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAD51BO15315 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAD51BO15315 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
RAD51BO15315 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAD51BO15315 PALLD-215ENST00000512127 2958 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAD51BO15315 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAD51BO15315 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAD51BO15315 UHRF1BP1-202ENST00000452449 4706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAD51BO15315 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAD51BO15315 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAD51BO15315 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAD51BO15315 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAD51BO15315 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAD51BO15315 MAP3K12-201ENST00000267079 4319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAD51BO15315 HLA-DQB1-205ENST00000434651 1642 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAD51BO15315 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAD51BO15315 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAD51BO15315 MIR1202-201ENST00000408529 83 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
RAD51BO15315 P3H2-AS1-201ENST00000412203 730 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAD51BO15315 AL355483.2-201ENST00000421637 675 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAD51BO15315 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
RAD51BO15315 DRGX-202ENST00000434016 955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAD51BO15315 AL049698.1-202ENST00000441716 757 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAD51BO15315 SIRPB2-203ENST00000444444 884 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAD51BO15315 AC080188.2-201ENST00000508985 552 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAD51BO15315 SLC45A2-204ENST00000509381 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAD51BO15315 SNHG9-201ENST00000531523 275 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAD51BO15315 AP000808.2-201ENST00000542410 569 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAD51BO15315 AL355102.5-201ENST00000554769 572 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAD51BO15315 HNRNPA1P48-202ENST00000565308 961 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
RAD51BO15315 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAD51BO15315 AC009134.1-201ENST00000571939 443 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAD51BO15315 AC123786.1-201ENST00000581626 661 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAD51BO15315 AC006453.2-202ENST00000635968 827 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAD51BO15315 AC099795.1-202ENST00000640492 759 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAD51BO15315 C9orf139-202ENST00000623196 4990 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAD51BO15315 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAD51BO15315 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAD51BO15315 RHPN1-201ENST00000289013 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAD51BO15315 KCNT1-211ENST00000491806 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAD51BO15315 NR3C1-203ENST00000394464 6795 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAD51BO15315 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAD51BO15315 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAD51BO15315 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAD51BO15315 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAD51BO15315 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAD51BO15315 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAD51BO15315 SLC38A10-202ENST00000374759 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAD51BO15315 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAD51BO15315 LINC01205-202ENST00000497996 1493 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAD51BO15315 FGD5-206ENST00000543601 5768 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAD51BO15315 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAD51BO15315 PHLDA1-201ENST00000266671 8069 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAD51BO15315 TBC1D2-201ENST00000342112 3046 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAD51BO15315 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAD51BO15315 STXBP6-201ENST00000323944 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAD51BO15315 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAD51BO15315 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAD51BO15315 DNM1P51-202ENST00000558801 8752 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAD51BO15315 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAD51BO15315 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAD51BO15315 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAD51BO15315 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAD51BO15315 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAD51BO15315 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAD51BO15315 SPEG-205ENST00000396698 3379 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAD51BO15315 IRF2BP2-201ENST00000366609 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAD51BO15315 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAD51BO15315 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAD51BO15315 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAD51BO15315 HOXC12-201ENST00000243103 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAD51BO15315 ABTB2-201ENST00000435224 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAD51BO15315 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAD51BO15315 RPS15-201ENST00000233609 534 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAD51BO15315 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAD51BO15315 PFDN5-202ENST00000334478 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAD51BO15315 DUSP23-202ENST00000368108 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAD51BO15315 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAD51BO15315 TNFAIP8L2-201ENST00000368910 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAD51BO15315 NDUFC1-201ENST00000394223 598 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAD51BO15315 BRWD1P1-201ENST00000401091 371 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
RAD51BO15315 DGCR5-204ENST00000440005 1299 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAD51BO15315 FAM25G-201ENST00000452267 345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAD51BO15315 AC082651.1-201ENST00000478468 832 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.7 ms