Protein–RNA interactions for Protein: J3QRK9

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
J3QRK9 CCDC144NL-201ENST00000327925 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
J3QRK9 HOXA7-201ENST00000242159 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
J3QRK9 CEACAM20-204ENST00000617951 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
J3QRK9 CELF1-201ENST00000310513 4583 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
J3QRK9 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
J3QRK9 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
J3QRK9 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
J3QRK9 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
J3QRK9 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
J3QRK9 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
J3QRK9 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
J3QRK9 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
J3QRK9 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
J3QRK9 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
J3QRK9 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
J3QRK9 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
J3QRK9 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
J3QRK9 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
J3QRK9 RNF43-202ENST00000577625 2198 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
J3QRK9 PIP4K2A-201ENST00000323883 1319 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
J3QRK9 CTDP1-202ENST00000299543 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
J3QRK9 LINC01114-203ENST00000425879 2434 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
J3QRK9 NLRP2-204ENST00000391721 3420 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
J3QRK9 SECISBP2-202ENST00000375807 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
J3QRK9 SSBP2-220ENST00000615665 4465 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
J3QRK9 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
J3QRK9 CYTH2-203ENST00000427476 4606 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
J3QRK9 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
J3QRK9 PRDM10-204ENST00000423662 5998 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
J3QRK9 ACTL8-202ENST00000617065 1670 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
J3QRK9 NOX5-202ENST00000388866 2804 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
J3QRK9 RAB37-202ENST00000392610 2858 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
J3QRK9 TP53INP2-202ENST00000374810 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
J3QRK9 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
J3QRK9 CCDC86-201ENST00000227520 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
J3QRK9 ADK-205ENST00000539909 1866 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
J3QRK9 DUS2-201ENST00000358896 1933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
J3QRK9 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
J3QRK9 CCT2-201ENST00000299300 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
J3QRK9 TRIM4-201ENST00000349062 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
J3QRK9 KIAA1217-203ENST00000376452 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
J3QRK9 VSTM2A-201ENST00000302287 3401 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
J3QRK9 AC099548.2-204ENST00000481651 2106 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
J3QRK9 APC2-201ENST00000233607 10151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
J3QRK9 PTK2-202ENST00000395218 4415 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
J3QRK9 CCSER2-203ENST00000372088 7657 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
J3QRK9 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
J3QRK9 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
J3QRK9 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
J3QRK9 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
J3QRK9 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
J3QRK9 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC13.52□□□□□ -0.25
J3QRK9 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
J3QRK9 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
J3QRK9 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
J3QRK9 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
J3QRK9 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
J3QRK9 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
J3QRK9 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC13.52□□□□□ -0.25
J3QRK9 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC13.52□□□□□ -0.25
J3QRK9 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
J3QRK9 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
J3QRK9 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
J3QRK9 FAM103A1-201ENST00000304191 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
J3QRK9 CREB3L4-204ENST00000368603 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
J3QRK9 TM4SF19-203ENST00000446879 1582 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
J3QRK9 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
J3QRK9 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
J3QRK9 ANKEF1-201ENST00000378380 5303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
J3QRK9 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
J3QRK9 KAT5-216ENST00000534650 1875 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
J3QRK9 ATL3-203ENST00000538786 1920 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
J3QRK9 TSPEAR-AS1-202ENST00000451035 2108 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
J3QRK9 FTO-214ENST00000636218 2227 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
J3QRK9 CPT1A-202ENST00000376618 2635 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
J3QRK9 SLC38A4-201ENST00000266579 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
J3QRK9 HTR5A-201ENST00000287907 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
J3QRK9 TRIM46-205ENST00000392451 3195 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
J3QRK9 FAM118A-201ENST00000216214 3458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
J3QRK9 PTPRH-202ENST00000376350 3877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
J3QRK9 MTA3-202ENST00000405592 5832 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
J3QRK9 LRCH3-206ENST00000438796 7394 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
J3QRK9 OAS3-201ENST00000228928 6719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
J3QRK9 ENO2-205ENST00000535366 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
J3QRK9 BIRC5-201ENST00000301633 2711 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
J3QRK9 TRAPPC10-201ENST00000291574 6976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
J3QRK9 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
J3QRK9 DDC-207ENST00000444124 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
J3QRK9 AC022007.1-201ENST00000383808 1897 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
J3QRK9 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
J3QRK9 UMODL1-206ENST00000408989 5262 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
J3QRK9 ISY1-RAB43-201ENST00000418265 4868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
J3QRK9 BMF-201ENST00000354670 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
J3QRK9 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
J3QRK9 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
J3QRK9 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
J3QRK9 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
J3QRK9 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
J3QRK9 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
J3QRK9 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
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