Protein–RNA interactions for Protein: H3BUS1

SYS1-DBNDD2, SYS1-DBNDD2 readthrough (NMD candidate), humanhuman

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Length 97 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DCAF8-201ENST00000326837 3972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC007388.1-204ENST00000449569 2517 ntTSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CCDC13-201ENST00000310232 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CARHSP1-218ENST00000614449 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TUBGCP5-208ENST00000620435 3342 ntTSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CPPED1-201ENST00000261660 1898 ntTSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FAM83A-201ENST00000276699 1858 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TMX4-201ENST00000246024 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SLC29A4-201ENST00000297195 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LINC01301-202ENST00000506428 2444 ntTSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FAM86C1-201ENST00000346333 2010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
SYS1-DBNDD2H3BUS1 USP17L7-201ENST00000530447 2022 ntAPPRIS P1 BASIC10.8□□□□□ -0.68
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TMEM57-201ENST00000374343 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SMPDL3B-206ENST00000549094 1611 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AMER1-202ENST00000374869 3688 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ALKBH5-201ENST00000399138 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RPL31-207ENST00000409711 2328 ntTSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GP1BA-202ENST00000611961 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
SYS1-DBNDD2H3BUS1 EPN2-202ENST00000347697 4664 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
SYS1-DBNDD2H3BUS1 IFT81-202ENST00000361948 3048 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
SYS1-DBNDD2H3BUS1 IL11RA-208ENST00000555003 3008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NCSTN-201ENST00000294785 2936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
SYS1-DBNDD2H3BUS1 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
SYS1-DBNDD2H3BUS1 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SOGA1-201ENST00000237536 14371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AP2M1-207ENST00000439647 1950 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PHF21B-201ENST00000313237 3671 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
SYS1-DBNDD2H3BUS1 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
SYS1-DBNDD2H3BUS1 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC10.8□□□□□ -0.68
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC136604.1-202ENST00000425471 771 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SLC6A12-207ENST00000536824 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.8□□□□□ -0.68
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC10.8□□□□□ -0.68
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC10.8□□□□□ -0.68
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC10.8□□□□□ -0.68
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC10.8□□□□□ -0.68
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LIX1L-201ENST00000604000 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GNAL-203ENST00000423027 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CCDC142-202ENST00000393965 3406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PUF60-209ENST00000527197 1559 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ACSL4-202ENST00000348502 5032 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PIK3CG-205ENST00000496166 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RAPGEF1-201ENST00000372189 6085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TRPM5-201ENST00000155858 3929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TRIM4-201ENST00000349062 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HERC5-201ENST00000264350 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC239798.2-201ENST00000415338 3540 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PPT2-245ENST00000361568 1759 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MYCBP-201ENST00000397572 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
SYS1-DBNDD2H3BUS1 BAHCC1-201ENST00000307745 10342 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GPC6-201ENST00000377047 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TRAK1-201ENST00000327628 5293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MSTO1-201ENST00000245564 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TRMT10B-207ENST00000537911 2108 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
SYS1-DBNDD2H3BUS1 BCAR3-210ENST00000539242 2114 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SIX1-203ENST00000554986 1959 ntTSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
SYS1-DBNDD2H3BUS1 Z98257.2-202ENST00000641138 1548 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
SYS1-DBNDD2H3BUS1 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RBL1-202ENST00000373664 5684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SUGP2-203ENST00000452918 6176 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PRKAB1-201ENST00000229328 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MADD-203ENST00000349238 5873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PLIN3-207ENST00000592528 2154 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CPN1-201ENST00000370418 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
SYS1-DBNDD2H3BUS1 VILL-201ENST00000283713 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PPFIA4-203ENST00000367240 6434 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RPGRIP1-202ENST00000400017 3940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
SYS1-DBNDD2H3BUS1 USP9X-202ENST00000378308 8371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SCAF4-202ENST00000399804 4127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LINC01019-201ENST00000505443 3199 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
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