Protein–RNA interactions for Protein: B4DU55

ZNF879, Zinc finger protein 879, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF879B4DU55 KIFC3-207ENST00000543930 3018 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
ZNF879B4DU55 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
ZNF879B4DU55 TAF6-205ENST00000437822 2318 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
ZNF879B4DU55 CACNA1G-208ENST00000442258 7226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
ZNF879B4DU55 ESS2-201ENST00000252137 5392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
ZNF879B4DU55 PPP2R1A-201ENST00000322088 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
ZNF879B4DU55 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
ZNF879B4DU55 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
ZNF879B4DU55 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
ZNF879B4DU55 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
ZNF879B4DU55 ZDHHC3-201ENST00000296127 3101 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
ZNF879B4DU55 ENO2-211ENST00000541477 2549 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
ZNF879B4DU55 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
ZNF879B4DU55 MKL1-202ENST00000396617 4505 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
ZNF879B4DU55 KIF19-202ENST00000389916 3643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
ZNF879B4DU55 SLC35D1-201ENST00000235345 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
ZNF879B4DU55 COL25A1-203ENST00000399132 2724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
ZNF879B4DU55 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
ZNF879B4DU55 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
ZNF879B4DU55 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
ZNF879B4DU55 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
ZNF879B4DU55 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
ZNF879B4DU55 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
ZNF879B4DU55 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
ZNF879B4DU55 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
ZNF879B4DU55 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
ZNF879B4DU55 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
ZNF879B4DU55 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
ZNF879B4DU55 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
ZNF879B4DU55 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
ZNF879B4DU55 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
ZNF879B4DU55 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
ZNF879B4DU55 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
ZNF879B4DU55 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
ZNF879B4DU55 CELSR1-201ENST00000262738 11389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
ZNF879B4DU55 TLL1-206ENST00000513213 1829 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
ZNF879B4DU55 ATP6V1H-201ENST00000355221 2365 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
ZNF879B4DU55 PREP-201ENST00000369110 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
ZNF879B4DU55 SDR42E2-201ENST00000602312 2630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
ZNF879B4DU55 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
ZNF879B4DU55 NRDC-201ENST00000352171 3691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
ZNF879B4DU55 EML5-207ENST00000554922 9570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
ZNF879B4DU55 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
ZNF879B4DU55 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
ZNF879B4DU55 TBC1D1-214ENST00000508802 4119 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
ZNF879B4DU55 XPNPEP1-218ENST00000502935 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
ZNF879B4DU55 COL6A3-202ENST00000347401 8625 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
ZNF879B4DU55 COL6A3-209ENST00000472056 8628 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
ZNF879B4DU55 HOXA3-201ENST00000317201 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
ZNF879B4DU55 CLCNKA-201ENST00000331433 2475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
ZNF879B4DU55 MTA3-202ENST00000405592 5832 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
ZNF879B4DU55 TOX3-201ENST00000219746 3233 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
ZNF879B4DU55 RUBCNL-204ENST00000378797 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
ZNF879B4DU55 ANKMY1-204ENST00000391987 3221 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
ZNF879B4DU55 AC079781.5-202ENST00000641784 3743 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
ZNF879B4DU55 CNN2-201ENST00000263097 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
ZNF879B4DU55 CNN2-205ENST00000562958 2194 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
ZNF879B4DU55 SEZ6-201ENST00000317338 4471 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
ZNF879B4DU55 AC009133.1-201ENST00000569981 2449 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
ZNF879B4DU55 ELK1-201ENST00000247161 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
ZNF879B4DU55 CDK17-201ENST00000261211 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
ZNF879B4DU55 VWCE-202ENST00000335613 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
ZNF879B4DU55 SEZ6L-202ENST00000343706 2898 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
ZNF879B4DU55 GABPB1-202ENST00000359031 1633 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
ZNF879B4DU55 CSRP1-202ENST00000367306 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
ZNF879B4DU55 CSF2RB-202ENST00000403662 4863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
ZNF879B4DU55 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
ZNF879B4DU55 PIGS-203ENST00000395346 2815 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
ZNF879B4DU55 MAP3K11-208ENST00000530153 2830 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
ZNF879B4DU55 RGS12-204ENST00000382788 5512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
ZNF879B4DU55 SMIM14-201ENST00000295958 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
ZNF879B4DU55 ARMC5-205ENST00000563544 3549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
ZNF879B4DU55 ZSCAN32-215ENST00000618425 2788 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
ZNF879B4DU55 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
ZNF879B4DU55 FUK-202ENST00000378912 3925 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
ZNF879B4DU55 ISY1-RAB43-201ENST00000418265 4868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
ZNF879B4DU55 FBXO21-202ENST00000427718 4138 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
ZNF879B4DU55 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
ZNF879B4DU55 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
ZNF879B4DU55 SIGLECL1-208ENST00000614422 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
ZNF879B4DU55 NDRG4-217ENST00000562999 2931 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
ZNF879B4DU55 PEX5-207ENST00000455147 2689 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
ZNF879B4DU55 SLC6A20-204ENST00000456124 2662 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
ZNF879B4DU55 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
ZNF879B4DU55 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
ZNF879B4DU55 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
ZNF879B4DU55 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
ZNF879B4DU55 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
ZNF879B4DU55 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
ZNF879B4DU55 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
ZNF879B4DU55 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
ZNF879B4DU55 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
ZNF879B4DU55 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
ZNF879B4DU55 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
ZNF879B4DU55 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
ZNF879B4DU55 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
ZNF879B4DU55 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
ZNF879B4DU55 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
ZNF879B4DU55 DKKL1-202ENST00000594268 524 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
ZNF879B4DU55 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.6 ms