Protein–RNA interactions for Protein: B2RPK0

HMGB1P1, Putative high mobility group protein B1-like 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGB1P1B2RPK0 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HMGB1P1B2RPK0 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HMGB1P1B2RPK0 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HMGB1P1B2RPK0 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HMGB1P1B2RPK0 HDAC2-AS2-213ENST00000520891 603 ntTSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HMGB1P1B2RPK0 CYB5D1-202ENST00000570446 570 ntTSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HMGB1P1B2RPK0 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
HMGB1P1B2RPK0 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HMGB1P1B2RPK0 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HMGB1P1B2RPK0 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HMGB1P1B2RPK0 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HMGB1P1B2RPK0 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HMGB1P1B2RPK0 NOX5-201ENST00000260364 8592 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HMGB1P1B2RPK0 MOGAT3-201ENST00000223114 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HMGB1P1B2RPK0 NFE2L1-218ENST00000583378 2051 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HMGB1P1B2RPK0 MAP3K3-203ENST00000577395 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HMGB1P1B2RPK0 AL139193.2-201ENST00000553712 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HMGB1P1B2RPK0 ABCC6P1-201ENST00000546162 2943 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HMGB1P1B2RPK0 TMEM130-203ENST00000416379 2881 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HMGB1P1B2RPK0 KDM5B-202ENST00000367264 6449 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HMGB1P1B2RPK0 DDC-213ENST00000617822 1809 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HMGB1P1B2RPK0 KLHL21-201ENST00000377658 4487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HMGB1P1B2RPK0 AC093520.1-201ENST00000567545 1767 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HMGB1P1B2RPK0 ST7L-207ENST00000369669 1743 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HMGB1P1B2RPK0 AC007388.1-204ENST00000449569 2517 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HMGB1P1B2RPK0 CDK17-201ENST00000261211 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HMGB1P1B2RPK0 RPN2-202ENST00000373622 2348 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HMGB1P1B2RPK0 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HMGB1P1B2RPK0 ENDOU-203ENST00000545824 1513 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HMGB1P1B2RPK0 OS9-218ENST00000551035 2246 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HMGB1P1B2RPK0 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HMGB1P1B2RPK0 ITPR2-202ENST00000381340 11405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HMGB1P1B2RPK0 OPA1-205ENST00000361908 6439 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HMGB1P1B2RPK0 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HMGB1P1B2RPK0 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HMGB1P1B2RPK0 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HMGB1P1B2RPK0 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HMGB1P1B2RPK0 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HMGB1P1B2RPK0 AC134312.1-201ENST00000378417 3468 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HMGB1P1B2RPK0 CEP70-201ENST00000264982 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HMGB1P1B2RPK0 LMNA-213ENST00000473598 2015 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HMGB1P1B2RPK0 SEPT6-201ENST00000343984 2693 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HMGB1P1B2RPK0 PIP5K1B-208ENST00000541509 2664 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HMGB1P1B2RPK0 PATL2-207ENST00000560775 1913 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HMGB1P1B2RPK0 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HMGB1P1B2RPK0 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HMGB1P1B2RPK0 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
HMGB1P1B2RPK0 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
HMGB1P1B2RPK0 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HMGB1P1B2RPK0 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HMGB1P1B2RPK0 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HMGB1P1B2RPK0 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HMGB1P1B2RPK0 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HMGB1P1B2RPK0 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HMGB1P1B2RPK0 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
HMGB1P1B2RPK0 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HMGB1P1B2RPK0 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HMGB1P1B2RPK0 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HMGB1P1B2RPK0 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HMGB1P1B2RPK0 CBX6-201ENST00000216083 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HMGB1P1B2RPK0 TMEM63B-202ENST00000323267 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HMGB1P1B2RPK0 DIAPH2-201ENST00000324765 9333 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HMGB1P1B2RPK0 CCHCR1-203ENST00000396268 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HMGB1P1B2RPK0 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HMGB1P1B2RPK0 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HMGB1P1B2RPK0 GJB4-201ENST00000339480 2840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HMGB1P1B2RPK0 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HMGB1P1B2RPK0 CTTN-202ENST00000346329 3272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HMGB1P1B2RPK0 TMEM87A-201ENST00000307216 1598 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HMGB1P1B2RPK0 CREB3L4-204ENST00000368603 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HMGB1P1B2RPK0 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HMGB1P1B2RPK0 STX1A-201ENST00000222812 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HMGB1P1B2RPK0 STX1A-204ENST00000395156 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HMGB1P1B2RPK0 UGP2-207ENST00000467648 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HMGB1P1B2RPK0 POM121-202ENST00000395270 7011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
HMGB1P1B2RPK0 DPP3-209ENST00000531863 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
HMGB1P1B2RPK0 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
HMGB1P1B2RPK0 CHD5-201ENST00000262450 9646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
HMGB1P1B2RPK0 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
HMGB1P1B2RPK0 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
HMGB1P1B2RPK0 NLRP7-209ENST00000592784 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
HMGB1P1B2RPK0 DDX31-204ENST00000372159 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
HMGB1P1B2RPK0 PIK3R5-216ENST00000584803 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
HMGB1P1B2RPK0 PLD2-201ENST00000263088 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
HMGB1P1B2RPK0 PIK3R5-219ENST00000616147 4377 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
HMGB1P1B2RPK0 RET-205ENST00000615310 4337 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
HMGB1P1B2RPK0 PML-202ENST00000268059 3029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
HMGB1P1B2RPK0 DDX19A-202ENST00000417604 1703 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
HMGB1P1B2RPK0 CHMP7-202ENST00000397677 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
HMGB1P1B2RPK0 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
HMGB1P1B2RPK0 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
HMGB1P1B2RPK0 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
HMGB1P1B2RPK0 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
HMGB1P1B2RPK0 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
HMGB1P1B2RPK0 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
HMGB1P1B2RPK0 ATP6V1C1-202ENST00000518738 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
HMGB1P1B2RPK0 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
HMGB1P1B2RPK0 PLXNB3-209ENST00000538966 6377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
HMGB1P1B2RPK0 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC15.27■□□□□ 0.04
HMGB1P1B2RPK0 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms