Protein–RNA interactions for Protein: A6NNM8

TTLL13P, Tubulin polyglutamylase TTLL13P, humanhuman

Predictions only

Length 815 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTLL13PA6NNM8 AKIP1-202ENST00000309357 1232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TTLL13PA6NNM8 FAM86MP-201ENST00000340703 885 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
TTLL13PA6NNM8 MTHFSD-202ENST00000381214 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TTLL13PA6NNM8 CD8B2-202ENST00000417670 633 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
TTLL13PA6NNM8 AC034187.1-201ENST00000437047 561 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TTLL13PA6NNM8 AL592161.1-201ENST00000456389 861 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TTLL13PA6NNM8 CENPM-208ENST00000472374 541 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TTLL13PA6NNM8 AC106786.2-201ENST00000506859 561 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TTLL13PA6NNM8 AC021546.1-201ENST00000518927 1031 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TTLL13PA6NNM8 AC079316.1-201ENST00000548397 411 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
TTLL13PA6NNM8 C2orf69P2-201ENST00000562032 1123 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
TTLL13PA6NNM8 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
TTLL13PA6NNM8 DUX4L45-201ENST00000566406 1057 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
TTLL13PA6NNM8 MIR4741-201ENST00000579822 90 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
TTLL13PA6NNM8 AP005433.1-202ENST00000580845 521 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TTLL13PA6NNM8 AC008750.3-201ENST00000601148 437 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TTLL13PA6NNM8 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TTLL13PA6NNM8 UGGT2-204ENST00000397618 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TTLL13PA6NNM8 CHRDL1-205ENST00000482160 1537 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TTLL13PA6NNM8 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TTLL13PA6NNM8 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TTLL13PA6NNM8 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TTLL13PA6NNM8 RPA3-201ENST00000223129 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TTLL13PA6NNM8 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
TTLL13PA6NNM8 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TTLL13PA6NNM8 CSGALNACT1-211ENST00000522854 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TTLL13PA6NNM8 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TTLL13PA6NNM8 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TTLL13PA6NNM8 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TTLL13PA6NNM8 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TTLL13PA6NNM8 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TTLL13PA6NNM8 HARS2-202ENST00000448069 1426 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TTLL13PA6NNM8 FAM153A-220ENST00000513554 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TTLL13PA6NNM8 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TTLL13PA6NNM8 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TTLL13PA6NNM8 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TTLL13PA6NNM8 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TTLL13PA6NNM8 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TTLL13PA6NNM8 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TTLL13PA6NNM8 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TTLL13PA6NNM8 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TTLL13PA6NNM8 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TTLL13PA6NNM8 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TTLL13PA6NNM8 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
TTLL13PA6NNM8 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TTLL13PA6NNM8 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TTLL13PA6NNM8 HNRNPR-212ENST00000606561 1837 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TTLL13PA6NNM8 PAQR6-214ENST00000613336 1599 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TTLL13PA6NNM8 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TTLL13PA6NNM8 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TTLL13PA6NNM8 MVB12B-206ENST00000489637 2666 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TTLL13PA6NNM8 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TTLL13PA6NNM8 EMC4-201ENST00000249209 852 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TTLL13PA6NNM8 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TTLL13PA6NNM8 UBE2T-201ENST00000367274 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TTLL13PA6NNM8 CSAG1-202ENST00000370287 875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TTLL13PA6NNM8 IGHV3-53-201ENST00000390627 571 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TTLL13PA6NNM8 RBAK-RBAKDN-201ENST00000396904 766 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TTLL13PA6NNM8 RBAK-RBAKDN-202ENST00000407184 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TTLL13PA6NNM8 PSG5-207ENST00000407568 1064 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TTLL13PA6NNM8 MS4A6A-201ENST00000412309 1284 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TTLL13PA6NNM8 AC019070.1-201ENST00000415008 1024 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
TTLL13PA6NNM8 AC099552.2-201ENST00000418523 456 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TTLL13PA6NNM8 FAM21FP-201ENST00000426241 1131 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
TTLL13PA6NNM8 ADAMTSL1-210ENST00000431052 824 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TTLL13PA6NNM8 C14orf178-202ENST00000439131 632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TTLL13PA6NNM8 YBX1P6-201ENST00000442962 1002 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
TTLL13PA6NNM8 TMEM212-IT1-201ENST00000456146 470 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TTLL13PA6NNM8 GUSBP2-202ENST00000479900 1203 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TTLL13PA6NNM8 IL12A-205ENST00000480787 863 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TTLL13PA6NNM8 SNHG12-210ENST00000483436 682 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TTLL13PA6NNM8 AC092658.1-201ENST00000505836 891 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
TTLL13PA6NNM8 AP001790.1-201ENST00000511947 570 ntTSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TTLL13PA6NNM8 AC092436.2-201ENST00000515188 411 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TTLL13PA6NNM8 EMC4-203ENST00000557879 1009 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TTLL13PA6NNM8 AC106820.3-201ENST00000561653 397 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
TTLL13PA6NNM8 SMIM24-203ENST00000587847 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TTLL13PA6NNM8 COPS9-205ENST00000607357 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TTLL13PA6NNM8 AL160412.1-202ENST00000616819 663 ntTSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TTLL13PA6NNM8 ZMYND15-201ENST00000269289 2448 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TTLL13PA6NNM8 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TTLL13PA6NNM8 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TTLL13PA6NNM8 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TTLL13PA6NNM8 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TTLL13PA6NNM8 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
TTLL13PA6NNM8 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
TTLL13PA6NNM8 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
TTLL13PA6NNM8 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
TTLL13PA6NNM8 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
TTLL13PA6NNM8 FANCA-213ENST00000563673 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
TTLL13PA6NNM8 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
TTLL13PA6NNM8 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
TTLL13PA6NNM8 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
TTLL13PA6NNM8 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
TTLL13PA6NNM8 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
TTLL13PA6NNM8 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
TTLL13PA6NNM8 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
TTLL13PA6NNM8 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
TTLL13PA6NNM8 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TTLL13PA6NNM8 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.7 ms