Protein–RNA interactions for Protein: A6NKT7

RGPD3, RanBP2-like and GRIP domain-containing protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,758 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGPD3A6NKT7 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
RGPD3A6NKT7 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC18.27■□□□□ 0.52
RGPD3A6NKT7 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RGPD3A6NKT7 PDXDC2P-206ENST00000534700 1315 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
RGPD3A6NKT7 AC020931.1-201ENST00000589622 1346 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
RGPD3A6NKT7 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RGPD3A6NKT7 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
RGPD3A6NKT7 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
RGPD3A6NKT7 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
RGPD3A6NKT7 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
RGPD3A6NKT7 CAMP-201ENST00000296435 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
RGPD3A6NKT7 TRBV7-3-201ENST00000390361 397 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.51
RGPD3A6NKT7 MPV17-207ENST00000403262 665 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
RGPD3A6NKT7 AC092573.1-201ENST00000433054 884 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
RGPD3A6NKT7 STK24P1-201ENST00000455035 1291 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
RGPD3A6NKT7 AC009487.3-201ENST00000505579 560 ntTSL 4 BASIC18.27■□□□□ 0.51
RGPD3A6NKT7 TGFBI-207ENST00000508076 1034 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
RGPD3A6NKT7 AC005740.1-201ENST00000515639 522 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
RGPD3A6NKT7 C1orf198-207ENST00000523410 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
RGPD3A6NKT7 BLOC1S1-202ENST00000548556 525 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
RGPD3A6NKT7 NPAS3-209ENST00000551008 1002 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
RGPD3A6NKT7 AC007656.1-201ENST00000552238 573 ntTSL 4 BASIC18.27■□□□□ 0.51
RGPD3A6NKT7 Metazoa_SRP.156-201ENST00000622344 262 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
RGPD3A6NKT7 AC009975.2-202ENST00000634539 854 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
RGPD3A6NKT7 IZUMO1-201ENST00000332955 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
RGPD3A6NKT7 KRT8P18-201ENST00000413425 1445 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
RGPD3A6NKT7 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
RGPD3A6NKT7 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RGPD3A6NKT7 PRL-201ENST00000306482 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RGPD3A6NKT7 CXCL12-201ENST00000343575 1857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RGPD3A6NKT7 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RGPD3A6NKT7 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RGPD3A6NKT7 SUOX-204ENST00000394115 2394 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RGPD3A6NKT7 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RGPD3A6NKT7 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RGPD3A6NKT7 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RGPD3A6NKT7 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RGPD3A6NKT7 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RGPD3A6NKT7 GDI2-203ENST00000380191 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RGPD3A6NKT7 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RGPD3A6NKT7 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RGPD3A6NKT7 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
RGPD3A6NKT7 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RGPD3A6NKT7 C11orf53-201ENST00000280325 1208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RGPD3A6NKT7 AL137244.1-201ENST00000422931 865 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
RGPD3A6NKT7 AL365500.1-201ENST00000442783 868 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RGPD3A6NKT7 AL121787.1-202ENST00000445838 876 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RGPD3A6NKT7 CDK4P1-201ENST00000454213 828 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
RGPD3A6NKT7 RN7SL173P-201ENST00000461853 292 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
RGPD3A6NKT7 RN7SL578P-201ENST00000477781 283 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
RGPD3A6NKT7 AAMDC-210ENST00000532481 690 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RGPD3A6NKT7 RNASEK-204ENST00000552039 591 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RGPD3A6NKT7 AC087741.1-204ENST00000573935 646 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RGPD3A6NKT7 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RGPD3A6NKT7 GOLGA8K-202ENST00000512626 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RGPD3A6NKT7 GOLGA8T-202ENST00000569052 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RGPD3A6NKT7 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RGPD3A6NKT7 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RGPD3A6NKT7 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RGPD3A6NKT7 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RGPD3A6NKT7 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RGPD3A6NKT7 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RGPD3A6NKT7 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RGPD3A6NKT7 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RGPD3A6NKT7 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
RGPD3A6NKT7 AC010255.3-203ENST00000509403 1727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RGPD3A6NKT7 UBL7-206ENST00000565335 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RGPD3A6NKT7 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RGPD3A6NKT7 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RGPD3A6NKT7 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RGPD3A6NKT7 CST5-201ENST00000304710 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RGPD3A6NKT7 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RGPD3A6NKT7 AHCYP3-201ENST00000420053 1279 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
RGPD3A6NKT7 TTTY18-201ENST00000438677 221 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RGPD3A6NKT7 RPS27L-203ENST00000439025 970 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RGPD3A6NKT7 NBPF3-205ENST00000454000 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RGPD3A6NKT7 TREX1-203ENST00000456089 629 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RGPD3A6NKT7 TIMMDC1-207ENST00000493694 710 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RGPD3A6NKT7 EEF1GP8-201ENST00000506566 1154 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
RGPD3A6NKT7 AC093300.1-201ENST00000510368 1201 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
RGPD3A6NKT7 ZNF724-202ENST00000597037 780 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RGPD3A6NKT7 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RGPD3A6NKT7 IL18BP-201ENST00000260049 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RGPD3A6NKT7 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RGPD3A6NKT7 FGGY-203ENST00000371212 1640 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RGPD3A6NKT7 MAGEA2-203ENST00000611557 2024 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RGPD3A6NKT7 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RGPD3A6NKT7 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RGPD3A6NKT7 RABL2B-202ENST00000395590 2380 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RGPD3A6NKT7 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RGPD3A6NKT7 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RGPD3A6NKT7 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RGPD3A6NKT7 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RGPD3A6NKT7 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RGPD3A6NKT7 AC082651.3-201ENST00000474667 1947 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RGPD3A6NKT7 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RGPD3A6NKT7 TOMM5-203ENST00000401811 789 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RGPD3A6NKT7 PYM1-203ENST00000408946 1226 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RGPD3A6NKT7 AL591242.1-201ENST00000422284 343 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RGPD3A6NKT7 AL137026.2-201ENST00000437014 841 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms