Protein–RNA interactions for Protein: A6NFT4

CFAP73, Cilia- and flagella-associated protein 73, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP73A6NFT4 GULP1-207ENST00000409843 2643 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CFAP73A6NFT4 ATL3-203ENST00000538786 1920 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CFAP73A6NFT4 ARHGEF10-207ENST00000520359 5472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CFAP73A6NFT4 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CFAP73A6NFT4 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CFAP73A6NFT4 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CFAP73A6NFT4 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CFAP73A6NFT4 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CFAP73A6NFT4 PRDM16-206ENST00000511072 4282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CFAP73A6NFT4 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
CFAP73A6NFT4 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CFAP73A6NFT4 AL731571.1-201ENST00000617058 5428 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
CFAP73A6NFT4 LIMD2-201ENST00000259006 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CFAP73A6NFT4 TMEM63B-202ENST00000323267 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CFAP73A6NFT4 CCHCR1-203ENST00000396268 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CFAP73A6NFT4 MAN2C1-216ENST00000563622 2961 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CFAP73A6NFT4 TNS2-202ENST00000314276 4944 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CFAP73A6NFT4 CRELD1-202ENST00000383811 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CFAP73A6NFT4 PPP4R3B-205ENST00000616288 4310 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CFAP73A6NFT4 AC040174.1-201ENST00000563003 2571 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CFAP73A6NFT4 TMEM25-204ENST00000359862 2395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CFAP73A6NFT4 SCML4-203ENST00000369022 2377 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CFAP73A6NFT4 AGAP5-201ENST00000374094 2394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CFAP73A6NFT4 NYNRIN-201ENST00000382554 7857 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CFAP73A6NFT4 BICDL2-204ENST00000573514 3519 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CFAP73A6NFT4 RUBCNL-201ENST00000378781 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CFAP73A6NFT4 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CFAP73A6NFT4 POMT1-201ENST00000341012 2912 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CFAP73A6NFT4 RIC8B-202ENST00000392837 5135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CFAP73A6NFT4 GPT2-201ENST00000340124 3984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CFAP73A6NFT4 HNRNPLL-205ENST00000409636 3980 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CFAP73A6NFT4 CICP16-201ENST00000502609 2813 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
CFAP73A6NFT4 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CFAP73A6NFT4 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CFAP73A6NFT4 FP565260.2-201ENST00000623476 1599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CFAP73A6NFT4 PCDHGA11-201ENST00000398587 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CFAP73A6NFT4 ZFP64-203ENST00000361387 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CFAP73A6NFT4 CD99L2-205ENST00000437787 3493 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CFAP73A6NFT4 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CFAP73A6NFT4 SDC1-202ENST00000381150 3291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CFAP73A6NFT4 SPATA7-217ENST00000556553 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CFAP73A6NFT4 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CFAP73A6NFT4 ACAN-209ENST00000617301 8669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CFAP73A6NFT4 SUV39H2-201ENST00000313519 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CFAP73A6NFT4 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CFAP73A6NFT4 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CFAP73A6NFT4 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CFAP73A6NFT4 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CFAP73A6NFT4 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CFAP73A6NFT4 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
CFAP73A6NFT4 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CFAP73A6NFT4 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CFAP73A6NFT4 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CFAP73A6NFT4 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CFAP73A6NFT4 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CFAP73A6NFT4 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CFAP73A6NFT4 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CFAP73A6NFT4 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CFAP73A6NFT4 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CFAP73A6NFT4 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CFAP73A6NFT4 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CFAP73A6NFT4 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CFAP73A6NFT4 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CFAP73A6NFT4 MLLT6-211ENST00000621332 7578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CFAP73A6NFT4 AC097374.1-201ENST00000568768 6624 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CFAP73A6NFT4 PDK2-203ENST00000503176 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CFAP73A6NFT4 HSD17B4-215ENST00000510025 2589 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CFAP73A6NFT4 HCG27-201ENST00000383331 1720 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CFAP73A6NFT4 CAPN3-207ENST00000397200 1643 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CFAP73A6NFT4 LRSAM1-203ENST00000373322 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CFAP73A6NFT4 ABCB9-203ENST00000346530 3399 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CFAP73A6NFT4 PSIP1-203ENST00000380733 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CFAP73A6NFT4 LINC00863-201ENST00000439559 3287 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CFAP73A6NFT4 GNG12-AS1-201ENST00000413628 2058 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CFAP73A6NFT4 ISY1-203ENST00000393295 3842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CFAP73A6NFT4 MST1-202ENST00000449682 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CFAP73A6NFT4 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CFAP73A6NFT4 KIF21B-201ENST00000332129 9897 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CFAP73A6NFT4 BBS1-202ENST00000393994 1790 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CFAP73A6NFT4 IGF2BP2-202ENST00000382199 3688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CFAP73A6NFT4 ACTR2-202ENST00000377982 2685 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CFAP73A6NFT4 GPR88-201ENST00000315033 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CFAP73A6NFT4 PIK3R5-219ENST00000616147 4377 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CFAP73A6NFT4 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CFAP73A6NFT4 ZNF541-202ENST00000314121 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CFAP73A6NFT4 INTS14-201ENST00000313182 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CFAP73A6NFT4 SUOX-208ENST00000548274 2352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CFAP73A6NFT4 AL118506.1-201ENST00000601296 3082 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
CFAP73A6NFT4 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CFAP73A6NFT4 CELF1-201ENST00000310513 4583 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CFAP73A6NFT4 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CFAP73A6NFT4 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CFAP73A6NFT4 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CFAP73A6NFT4 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
CFAP73A6NFT4 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CFAP73A6NFT4 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CFAP73A6NFT4 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
CFAP73A6NFT4 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CFAP73A6NFT4 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
CFAP73A6NFT4 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.6 ms