Protein–RNA interactions for Protein: A6NCL1

GMNC, Geminin coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GMNCA6NCL1 KIAA0319-201ENST00000378214 6802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GMNCA6NCL1 CLCN4-201ENST00000380829 2418 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
GMNCA6NCL1 STIM1-201ENST00000300737 4038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GMNCA6NCL1 RBM6-211ENST00000443081 4010 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
GMNCA6NCL1 INTS5-201ENST00000330574 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GMNCA6NCL1 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GMNCA6NCL1 GNAI2-201ENST00000266027 2169 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
GMNCA6NCL1 MEST-206ENST00000416162 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GMNCA6NCL1 HAGLR-202ENST00000416928 4235 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GMNCA6NCL1 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
GMNCA6NCL1 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GMNCA6NCL1 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
GMNCA6NCL1 TRAF1-201ENST00000373887 6324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GMNCA6NCL1 ACTR2-202ENST00000377982 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GMNCA6NCL1 SLC4A8-205ENST00000535225 2262 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
GMNCA6NCL1 IL20RA-203ENST00000367748 3522 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GMNCA6NCL1 SPATA7-217ENST00000556553 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GMNCA6NCL1 MROH2A-201ENST00000389758 5355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
GMNCA6NCL1 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
GMNCA6NCL1 PCDHGA11-201ENST00000398587 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GMNCA6NCL1 AC131212.3-201ENST00000624087 4219 ntBASIC15.07■□□□□ 0
GMNCA6NCL1 H6PD-203ENST00000602477 5590 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GMNCA6NCL1 KDELR1-201ENST00000330720 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GMNCA6NCL1 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
GMNCA6NCL1 DDC-207ENST00000444124 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GMNCA6NCL1 RSBN1-204ENST00000612242 6592 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
GMNCA6NCL1 RREB1-210ENST00000611109 3563 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
GMNCA6NCL1 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GMNCA6NCL1 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
GMNCA6NCL1 MCF2L-204ENST00000375608 3648 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
GMNCA6NCL1 PCDHB18P-202ENST00000526308 3197 ntBASIC15.07■□□□□ 0
GMNCA6NCL1 MECP2-217ENST00000628176 1712 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
GMNCA6NCL1 MBP-204ENST00000382582 2281 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GMNCA6NCL1 BRPF1-205ENST00000433861 4304 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
GMNCA6NCL1 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GMNCA6NCL1 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GMNCA6NCL1 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GMNCA6NCL1 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
GMNCA6NCL1 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GMNCA6NCL1 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GMNCA6NCL1 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GMNCA6NCL1 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
GMNCA6NCL1 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
GMNCA6NCL1 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
GMNCA6NCL1 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
GMNCA6NCL1 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
GMNCA6NCL1 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
GMNCA6NCL1 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GMNCA6NCL1 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
GMNCA6NCL1 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
GMNCA6NCL1 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
GMNCA6NCL1 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC15.07■□□□□ 0
GMNCA6NCL1 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC15.07■□□□□ 0
GMNCA6NCL1 LRRFIP2-202ENST00000354379 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GMNCA6NCL1 CLEC18B-204ENST00000617101 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GMNCA6NCL1 DDC-213ENST00000617822 1809 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
GMNCA6NCL1 KIF6-201ENST00000229913 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GMNCA6NCL1 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
GMNCA6NCL1 AC097374.1-201ENST00000568768 6624 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GMNCA6NCL1 CCDC86-201ENST00000227520 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GMNCA6NCL1 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
GMNCA6NCL1 STRC-205ENST00000450892 5680 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
GMNCA6NCL1 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GMNCA6NCL1 TARS2-203ENST00000369054 1998 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
GMNCA6NCL1 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
GMNCA6NCL1 KIF17-203ENST00000400463 3731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GMNCA6NCL1 KHNYN-201ENST00000251343 6725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GMNCA6NCL1 GABRB3-219ENST00000636466 4509 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
GMNCA6NCL1 TSPEAR-AS1-202ENST00000451035 2108 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
GMNCA6NCL1 VRK3-217ENST00000599538 2126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GMNCA6NCL1 EPHA5-204ENST00000511294 5176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GMNCA6NCL1 WARS2-201ENST00000235521 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GMNCA6NCL1 SF1-205ENST00000377394 2854 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GMNCA6NCL1 MAP7-201ENST00000354570 4152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GMNCA6NCL1 GRM7-215ENST00000486284 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
GMNCA6NCL1 ZNF135-205ENST00000511556 2253 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
GMNCA6NCL1 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
GMNCA6NCL1 TNN-202ENST00000621086 4234 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
GMNCA6NCL1 ARID3B-206ENST00000622429 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GMNCA6NCL1 PPP4R3B-205ENST00000616288 4310 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GMNCA6NCL1 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GMNCA6NCL1 NOB1-201ENST00000268802 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GMNCA6NCL1 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
GMNCA6NCL1 SORCS1-201ENST00000263054 7272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GMNCA6NCL1 RN7SL832P-201ENST00000607781 1756 ntBASIC15.06■□□□□ 0
GMNCA6NCL1 CBLB-204ENST00000405772 3237 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
GMNCA6NCL1 PRSS54-201ENST00000219301 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
GMNCA6NCL1 AC068075.1-201ENST00000519714 1832 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GMNCA6NCL1 RRAGD-201ENST00000359203 4042 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
GMNCA6NCL1 S100PBP-203ENST00000373476 3320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
GMNCA6NCL1 WIZ-202ENST00000389282 4067 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GMNCA6NCL1 RUFY1-204ENST00000437570 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
GMNCA6NCL1 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GMNCA6NCL1 CELF2-206ENST00000608830 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GMNCA6NCL1 JADE2-203ENST00000395003 6465 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GMNCA6NCL1 MAPK4-206ENST00000592595 4330 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GMNCA6NCL1 AC090643.2-201ENST00000623442 2029 ntBASIC15.06■□□□□ 0
GMNCA6NCL1 LINC00324-201ENST00000315707 2082 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GMNCA6NCL1 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
GMNCA6NCL1 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57 ms