Protein–RNA interactions for Protein: A5PLN7

FAM149A, Protein FAM149A, humanhuman

Predictions only

Length 773 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM149AA5PLN7 ACIN1-203ENST00000357481 2563 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
FAM149AA5PLN7 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
FAM149AA5PLN7 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
FAM149AA5PLN7 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
FAM149AA5PLN7 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
FAM149AA5PLN7 CCNA1-204ENST00000630422 1751 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
FAM149AA5PLN7 E2F6-212ENST00000546212 3191 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
FAM149AA5PLN7 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
FAM149AA5PLN7 ZNF485-201ENST00000361807 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
FAM149AA5PLN7 GGA1-206ENST00000406772 3205 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
FAM149AA5PLN7 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
FAM149AA5PLN7 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
FAM149AA5PLN7 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
FAM149AA5PLN7 HEBP1-201ENST00000014930 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
FAM149AA5PLN7 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
FAM149AA5PLN7 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
FAM149AA5PLN7 CSH1-201ENST00000316193 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
FAM149AA5PLN7 TMEM52-203ENST00000378602 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
FAM149AA5PLN7 C9orf24-203ENST00000379126 496 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
FAM149AA5PLN7 Z93015.1-201ENST00000451718 390 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
FAM149AA5PLN7 PFN2-215ENST00000497148 743 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
FAM149AA5PLN7 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
FAM149AA5PLN7 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
FAM149AA5PLN7 CATSPERZ-203ENST00000539943 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
FAM149AA5PLN7 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
FAM149AA5PLN7 FP565260.5-201ENST00000623188 479 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
FAM149AA5PLN7 GCLM-204ENST00000615724 3008 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
FAM149AA5PLN7 AATBC-203ENST00000448247 1889 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
FAM149AA5PLN7 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
FAM149AA5PLN7 ENO3-206ENST00000519584 1322 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
FAM149AA5PLN7 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
FAM149AA5PLN7 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
FAM149AA5PLN7 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
FAM149AA5PLN7 PRPH-201ENST00000257860 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
FAM149AA5PLN7 FAM186B-201ENST00000257894 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
FAM149AA5PLN7 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
FAM149AA5PLN7 DBR1-201ENST00000260803 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
FAM149AA5PLN7 KIAA1683-209ENST00000612316 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
FAM149AA5PLN7 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
FAM149AA5PLN7 SEPT7-201ENST00000350320 4350 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
FAM149AA5PLN7 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
FAM149AA5PLN7 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
FAM149AA5PLN7 CTBP1-AS2-205ENST00000578730 2757 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
FAM149AA5PLN7 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
FAM149AA5PLN7 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
FAM149AA5PLN7 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
FAM149AA5PLN7 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
FAM149AA5PLN7 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0.01
FAM149AA5PLN7 DDHD2-205ENST00000520272 4532 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
FAM149AA5PLN7 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
FAM149AA5PLN7 ANKRD46-205ENST00000520311 3270 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
FAM149AA5PLN7 GREM1-202ENST00000560830 2648 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
FAM149AA5PLN7 PML-208ENST00000436891 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
FAM149AA5PLN7 ZNF248-202ENST00000374648 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
FAM149AA5PLN7 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
FAM149AA5PLN7 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
FAM149AA5PLN7 AHRR-211ENST00000515206 462 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
FAM149AA5PLN7 CNGA4-202ENST00000533426 936 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
FAM149AA5PLN7 AC125603.2-201ENST00000546835 876 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
FAM149AA5PLN7 AC016629.1-201ENST00000596579 586 ntBASIC15.08■□□□□ 0
FAM149AA5PLN7 IFITM3-204ENST00000602735 713 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
FAM149AA5PLN7 MIR6727-201ENST00000620702 65 ntBASIC15.08■□□□□ 0
FAM149AA5PLN7 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
FAM149AA5PLN7 NBEA-201ENST00000310336 10794 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
FAM149AA5PLN7 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
FAM149AA5PLN7 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
FAM149AA5PLN7 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
FAM149AA5PLN7 RUNX3-201ENST00000308873 3861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
FAM149AA5PLN7 MAP3K12-201ENST00000267079 4319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
FAM149AA5PLN7 LINC01010-201ENST00000431422 2069 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
FAM149AA5PLN7 IL6R-201ENST00000344086 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
FAM149AA5PLN7 OPA1-208ENST00000392438 6340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
FAM149AA5PLN7 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
FAM149AA5PLN7 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
FAM149AA5PLN7 ARC-201ENST00000356613 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
FAM149AA5PLN7 CLDND1-215ENST00000507874 1380 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
FAM149AA5PLN7 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
FAM149AA5PLN7 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
FAM149AA5PLN7 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
FAM149AA5PLN7 CALD1-222ENST00000495522 2199 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
FAM149AA5PLN7 RIOX2-202ENST00000360258 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
FAM149AA5PLN7 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
FAM149AA5PLN7 GPAT2-202ENST00000434632 3061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
FAM149AA5PLN7 RAB37-206ENST00000392615 2655 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
FAM149AA5PLN7 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
FAM149AA5PLN7 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
FAM149AA5PLN7 CYP4F3-203ENST00000586182 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
FAM149AA5PLN7 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
FAM149AA5PLN7 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC15.07■□□□□ 0
FAM149AA5PLN7 AP004608.1-203ENST00000528482 3679 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
FAM149AA5PLN7 PPP2R1B-203ENST00000393055 1525 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
FAM149AA5PLN7 GRB7-203ENST00000394209 1955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
FAM149AA5PLN7 ABCB8-201ENST00000297504 2487 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
FAM149AA5PLN7 GTF2A1L-203ENST00000430487 1575 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
FAM149AA5PLN7 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
FAM149AA5PLN7 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC15.07■□□□□ 0
FAM149AA5PLN7 LINC01184-204ENST00000501702 2977 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
FAM149AA5PLN7 PEX26-205ENST00000610387 3924 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
FAM149AA5PLN7 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
FAM149AA5PLN7 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.4 ms