Protein–RNA interactions for Protein: A0AVK6

E2F8, Transcription factor E2F8, humanhuman

Predictions only

Length 867 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F8A0AVK6 SAFB2-201ENST00000252542 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
E2F8A0AVK6 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
E2F8A0AVK6 CALN1-201ENST00000329008 9243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
E2F8A0AVK6 SYT17-201ENST00000355377 3081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
E2F8A0AVK6 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
E2F8A0AVK6 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
E2F8A0AVK6 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
E2F8A0AVK6 STXBP6-201ENST00000323944 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
E2F8A0AVK6 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
E2F8A0AVK6 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
E2F8A0AVK6 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
E2F8A0AVK6 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
E2F8A0AVK6 MB-205ENST00000406324 582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
E2F8A0AVK6 AC126768.2-201ENST00000511693 718 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
E2F8A0AVK6 SNHG9-201ENST00000531523 275 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
E2F8A0AVK6 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
E2F8A0AVK6 RAB40B-202ENST00000538809 704 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
E2F8A0AVK6 DERL2-202ENST00000570848 657 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
E2F8A0AVK6 CCL5-202ENST00000605140 1244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
E2F8A0AVK6 CRHR2-208ENST00000506074 3109 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
E2F8A0AVK6 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
E2F8A0AVK6 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
E2F8A0AVK6 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
E2F8A0AVK6 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
E2F8A0AVK6 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
E2F8A0AVK6 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
E2F8A0AVK6 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
E2F8A0AVK6 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
E2F8A0AVK6 PPL-201ENST00000345988 6238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
E2F8A0AVK6 COG3-201ENST00000349995 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
E2F8A0AVK6 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
E2F8A0AVK6 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
E2F8A0AVK6 CCDC51-204ENST00000442740 1554 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
E2F8A0AVK6 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
E2F8A0AVK6 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
E2F8A0AVK6 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
E2F8A0AVK6 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
E2F8A0AVK6 LEF1-216ENST00000510624 1472 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
E2F8A0AVK6 FOXRED2-201ENST00000216187 3933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
E2F8A0AVK6 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
E2F8A0AVK6 AC007326.2-201ENST00000624224 7579 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
E2F8A0AVK6 NRG2-209ENST00000541337 3723 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
E2F8A0AVK6 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
E2F8A0AVK6 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
E2F8A0AVK6 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
E2F8A0AVK6 AC138517.2-201ENST00000637503 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
E2F8A0AVK6 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
E2F8A0AVK6 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
E2F8A0AVK6 LAMA4-203ENST00000368638 1061 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
E2F8A0AVK6 CDRT15-201ENST00000420162 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
E2F8A0AVK6 AC233976.1-201ENST00000425150 451 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
E2F8A0AVK6 CDRT15-202ENST00000431716 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
E2F8A0AVK6 OLR1-203ENST00000432556 950 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
E2F8A0AVK6 PFN2-215ENST00000497148 743 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
E2F8A0AVK6 AC020659.2-202ENST00000512295 513 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
E2F8A0AVK6 FAM8A2P-201ENST00000528813 1142 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
E2F8A0AVK6 AGER-214ENST00000538695 487 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
E2F8A0AVK6 AL583722.2-201ENST00000557223 663 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
E2F8A0AVK6 AC123786.1-201ENST00000581626 661 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
E2F8A0AVK6 AC005597.1-201ENST00000588092 420 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
E2F8A0AVK6 STXBP2-221ENST00000602355 716 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
E2F8A0AVK6 ECM1P1-201ENST00000604092 1279 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
E2F8A0AVK6 AGER-215ENST00000620802 737 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
E2F8A0AVK6 AC093326.2-201ENST00000640770 729 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
E2F8A0AVK6 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
E2F8A0AVK6 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
E2F8A0AVK6 FER1L4-213ENST00000621044 2778 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
E2F8A0AVK6 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
E2F8A0AVK6 ZNF30-202ENST00000439785 2651 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
E2F8A0AVK6 FADS1-201ENST00000350997 4525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
E2F8A0AVK6 IMPDH1-203ENST00000354269 2580 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
E2F8A0AVK6 BCL2L11-219ENST00000619294 5132 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
E2F8A0AVK6 ZNF219-203ENST00000451119 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
E2F8A0AVK6 PIK3CD-206ENST00000536656 5483 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
E2F8A0AVK6 PIK3CD-208ENST00000628140 5483 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
E2F8A0AVK6 KIF26B-202ENST00000407071 7287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
E2F8A0AVK6 PARD3B-204ENST00000406610 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
E2F8A0AVK6 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
E2F8A0AVK6 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
E2F8A0AVK6 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
E2F8A0AVK6 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
E2F8A0AVK6 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
E2F8A0AVK6 CTXND1-201ENST00000560778 6890 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
E2F8A0AVK6 GRIN3A-201ENST00000361820 7770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
E2F8A0AVK6 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
E2F8A0AVK6 RBM46-204ENST00000514866 2315 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
E2F8A0AVK6 BPTF-202ENST00000321892 11292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
E2F8A0AVK6 ZNF70-201ENST00000341976 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
E2F8A0AVK6 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
E2F8A0AVK6 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
E2F8A0AVK6 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
E2F8A0AVK6 PITPNM1-216ENST00000534749 4189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
E2F8A0AVK6 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
E2F8A0AVK6 ZNF711-201ENST00000276123 2887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
E2F8A0AVK6 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
E2F8A0AVK6 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
E2F8A0AVK6 NPPC-201ENST00000295440 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
E2F8A0AVK6 ZNF138-201ENST00000307355 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
E2F8A0AVK6 DBNDD2-201ENST00000357275 1036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
E2F8A0AVK6 TCEAL1-203ENST00000372626 721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms