Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4D8

HECTD4, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HECTD4, humanhuman

Predictions only

Length 3,996 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HECTD4Q9Y4D8 AC006986.1-201ENST00000612764 241 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
HECTD4Q9Y4D8 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
HECTD4Q9Y4D8 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
HECTD4Q9Y4D8 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
HECTD4Q9Y4D8 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.58□□□□□ -0.88
HECTD4Q9Y4D8 IL1F10-202ENST00000393197 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
HECTD4Q9Y4D8 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC9.58□□□□□ -0.88
HECTD4Q9Y4D8 MARK2P16-201ENST00000605714 1723 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
HECTD4Q9Y4D8 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
HECTD4Q9Y4D8 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
HECTD4Q9Y4D8 KHSRPP1-201ENST00000427983 1768 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
HECTD4Q9Y4D8 AL121757.1-201ENST00000430097 1836 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
HECTD4Q9Y4D8 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
HECTD4Q9Y4D8 PDGFRL-201ENST00000251630 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
HECTD4Q9Y4D8 NOP14-AS1-201ENST00000503709 1616 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
HECTD4Q9Y4D8 MRPL33-201ENST00000296102 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
HECTD4Q9Y4D8 RNF212-201ENST00000333673 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.58□□□□□ -0.88
HECTD4Q9Y4D8 MRPL33-202ENST00000379666 404 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
HECTD4Q9Y4D8 IGLC1-201ENST00000390321 460 ntAPPRIS P1 BASIC9.58□□□□□ -0.88
HECTD4Q9Y4D8 COPS7B-205ENST00000409295 1009 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
HECTD4Q9Y4D8 FRMD4A-204ENST00000475141 1233 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
HECTD4Q9Y4D8 IGHV1-12-201ENST00000518307 205 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
HECTD4Q9Y4D8 DUXAP9-201ENST00000547220 665 ntTSL 3 BASIC9.58□□□□□ -0.88
HECTD4Q9Y4D8 APOPT1-215ENST00000556253 783 ntTSL 3 BASIC9.58□□□□□ -0.88
HECTD4Q9Y4D8 PRMT1P1-201ENST00000604252 1009 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
HECTD4Q9Y4D8 AC242426.4-201ENST00000606856 573 ntTSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
HECTD4Q9Y4D8 RPL13A-213ENST00000621674 1098 ntTSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
HECTD4Q9Y4D8 COQ3-201ENST00000254759 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
HECTD4Q9Y4D8 AL513315.1-201ENST00000640756 1370 ntTSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
HECTD4Q9Y4D8 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
HECTD4Q9Y4D8 BTBD8-201ENST00000342818 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
HECTD4Q9Y4D8 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.58□□□□□ -0.88
HECTD4Q9Y4D8 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
HECTD4Q9Y4D8 AP000552.1-203ENST00000416615 1930 ntTSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
HECTD4Q9Y4D8 ECSIT-201ENST00000252440 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
HECTD4Q9Y4D8 PHB-210ENST00000511832 1509 ntTSL 2 BASIC9.58□□□□□ -0.88
HECTD4Q9Y4D8 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
HECTD4Q9Y4D8 AC006504.5-208ENST00000588784 2401 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
HECTD4Q9Y4D8 OXA1L-212ENST00000604262 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
HECTD4Q9Y4D8 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
HECTD4Q9Y4D8 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
HECTD4Q9Y4D8 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
HECTD4Q9Y4D8 COX8C-201ENST00000342144 533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
HECTD4Q9Y4D8 AL935212.1-201ENST00000377548 906 ntTSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
HECTD4Q9Y4D8 LRRC75A-AS1-213ENST00000484836 821 ntTSL 2 BASIC9.58□□□□□ -0.88
HECTD4Q9Y4D8 CALCA-205ENST00000486207 851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
HECTD4Q9Y4D8 AC090152.1-203ENST00000517898 1106 ntTSL 2 BASIC9.58□□□□□ -0.88
HECTD4Q9Y4D8 AL132709.1-203ENST00000555103 569 ntTSL 4 BASIC9.58□□□□□ -0.88
HECTD4Q9Y4D8 DIO3OS-211ENST00000557532 712 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
HECTD4Q9Y4D8 MT2A-202ENST00000561491 581 ntTSL 2 BASIC9.58□□□□□ -0.88
HECTD4Q9Y4D8 AC139099.2-201ENST00000572343 641 ntTSL 3 BASIC9.58□□□□□ -0.88
HECTD4Q9Y4D8 SELENOW-212ENST00000601048 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
HECTD4Q9Y4D8 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.58□□□□□ -0.88
HECTD4Q9Y4D8 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.58□□□□□ -0.88
HECTD4Q9Y4D8 USP17L2-201ENST00000333796 1910 ntAPPRIS P1 BASIC9.58□□□□□ -0.88
HECTD4Q9Y4D8 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC9.58□□□□□ -0.88
HECTD4Q9Y4D8 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
HECTD4Q9Y4D8 TMCO5B-204ENST00000529696 1568 ntTSL 2 BASIC9.58□□□□□ -0.88
HECTD4Q9Y4D8 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
HECTD4Q9Y4D8 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
HECTD4Q9Y4D8 ZNF846-201ENST00000397902 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
HECTD4Q9Y4D8 PPIA-201ENST00000355968 818 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
HECTD4Q9Y4D8 ZNRD1-203ENST00000376782 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.57□□□□□ -0.88
HECTD4Q9Y4D8 ANG-202ENST00000397990 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
HECTD4Q9Y4D8 THAP4-202ENST00000402136 785 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
HECTD4Q9Y4D8 SOD2-205ENST00000444946 917 ntTSL 2 BASIC9.57□□□□□ -0.88
HECTD4Q9Y4D8 GH2-203ENST00000449787 753 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
HECTD4Q9Y4D8 PPIA-208ENST00000489459 907 ntTSL 2 BASIC9.57□□□□□ -0.88
HECTD4Q9Y4D8 TRAPPC2L-212ENST00000567312 499 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
HECTD4Q9Y4D8 CADM1-221ENST00000612235 1042 ntTSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
HECTD4Q9Y4D8 PPIA-210ENST00000620047 827 ntTSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
HECTD4Q9Y4D8 FXYD3-208ENST00000604404 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
HECTD4Q9Y4D8 INTS11-248ENST00000545578 2263 ntTSL 2 BASIC9.57□□□□□ -0.88
HECTD4Q9Y4D8 PAIP2-201ENST00000265192 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
HECTD4Q9Y4D8 F10-201ENST00000375551 1509 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
HECTD4Q9Y4D8 SNRPN-203ENST00000400097 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
HECTD4Q9Y4D8 HHEX-202ENST00000472590 1605 ntTSL 2 BASIC9.57□□□□□ -0.88
HECTD4Q9Y4D8 FAM168A-202ENST00000356467 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
HECTD4Q9Y4D8 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC9.57□□□□□ -0.88
HECTD4Q9Y4D8 HSPB7-202ENST00000375718 2415 ntTSL 2 BASIC9.57□□□□□ -0.88
HECTD4Q9Y4D8 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC9.57□□□□□ -0.88
HECTD4Q9Y4D8 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
HECTD4Q9Y4D8 CCL19-201ENST00000311925 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
HECTD4Q9Y4D8 ZNF614-202ENST00000356322 1293 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
HECTD4Q9Y4D8 RPL35P9-201ENST00000446059 350 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
HECTD4Q9Y4D8 AC106047.1-202ENST00000467484 482 ntTSL 2 BASIC9.57□□□□□ -0.88
HECTD4Q9Y4D8 DMKN-229ENST00000467637 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
HECTD4Q9Y4D8 AC136601.1-201ENST00000521803 666 ntTSL 3 BASIC9.57□□□□□ -0.88
HECTD4Q9Y4D8 F11R-204ENST00000537746 1245 ntTSL 2 BASIC9.57□□□□□ -0.88
HECTD4Q9Y4D8 AC010186.1-201ENST00000546259 532 ntTSL 2 BASIC9.57□□□□□ -0.88
HECTD4Q9Y4D8 AC010976.2-201ENST00000609697 852 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
HECTD4Q9Y4D8 MAD2L1BP-201ENST00000372171 1301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
HECTD4Q9Y4D8 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
HECTD4Q9Y4D8 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
HECTD4Q9Y4D8 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
HECTD4Q9Y4D8 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC9.57□□□□□ -0.88
HECTD4Q9Y4D8 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
HECTD4Q9Y4D8 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.57□□□□□ -0.88
HECTD4Q9Y4D8 CIT-219ENST00000612548 1799 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
HECTD4Q9Y4D8 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.8 ms