Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2L5

TRAPPC8, Trafficking protein particle complex subunit 8, humanhuman

Predictions only

Length 1,435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC8Q9Y2L5 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TRAPPC8Q9Y2L5 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TRAPPC8Q9Y2L5 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TRAPPC8Q9Y2L5 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TRAPPC8Q9Y2L5 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TRAPPC8Q9Y2L5 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TRAPPC8Q9Y2L5 RCC1-201ENST00000373831 1577 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TRAPPC8Q9Y2L5 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TRAPPC8Q9Y2L5 CHTF8-202ENST00000398235 1073 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TRAPPC8Q9Y2L5 RBM14-204ENST00000409738 372 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TRAPPC8Q9Y2L5 AC097059.1-201ENST00000413103 885 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TRAPPC8Q9Y2L5 FAM92A-202ENST00000423990 914 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TRAPPC8Q9Y2L5 RPL35P9-201ENST00000446059 350 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
TRAPPC8Q9Y2L5 OR5BD1P-201ENST00000532527 817 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
TRAPPC8Q9Y2L5 PIGT-208ENST00000545755 1158 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TRAPPC8Q9Y2L5 AC134312.2-201ENST00000563521 608 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TRAPPC8Q9Y2L5 AL356417.2-202ENST00000608986 532 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TRAPPC8Q9Y2L5 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TRAPPC8Q9Y2L5 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TRAPPC8Q9Y2L5 LILRA2-203ENST00000391737 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TRAPPC8Q9Y2L5 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TRAPPC8Q9Y2L5 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TRAPPC8Q9Y2L5 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TRAPPC8Q9Y2L5 ATF4-202ENST00000396680 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TRAPPC8Q9Y2L5 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TRAPPC8Q9Y2L5 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TRAPPC8Q9Y2L5 ENAH-203ENST00000366843 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TRAPPC8Q9Y2L5 IL1F10-202ENST00000393197 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TRAPPC8Q9Y2L5 AL672207.1-201ENST00000328462 1570 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
TRAPPC8Q9Y2L5 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TRAPPC8Q9Y2L5 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TRAPPC8Q9Y2L5 KCTD6-202ENST00000404589 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TRAPPC8Q9Y2L5 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TRAPPC8Q9Y2L5 SLC22A7-202ENST00000372585 2555 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TRAPPC8Q9Y2L5 MMP7-201ENST00000260227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TRAPPC8Q9Y2L5 CRYGC-201ENST00000282141 629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TRAPPC8Q9Y2L5 MYMK-201ENST00000339996 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TRAPPC8Q9Y2L5 LCMT1-202ENST00000380966 989 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TRAPPC8Q9Y2L5 AC112721.1-201ENST00000409162 588 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TRAPPC8Q9Y2L5 ACTG2-204ENST00000409918 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TRAPPC8Q9Y2L5 CXorf40A-205ENST00000423540 1208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TRAPPC8Q9Y2L5 AC011247.2-201ENST00000457097 233 ntTSL 4 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TRAPPC8Q9Y2L5 TRMT10B-207ENST00000537911 2108 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TRAPPC8Q9Y2L5 IGHV3OR16-12-201ENST00000570121 353 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TRAPPC8Q9Y2L5 DRG2-220ENST00000583355 891 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TRAPPC8Q9Y2L5 AL136040.2-201ENST00000618431 1130 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TRAPPC8Q9Y2L5 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TRAPPC8Q9Y2L5 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TRAPPC8Q9Y2L5 AL358216.1-201ENST00000451601 1657 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TRAPPC8Q9Y2L5 GOLGA8R-201ENST00000327271 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TRAPPC8Q9Y2L5 LINC02076-201ENST00000577684 1871 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TRAPPC8Q9Y2L5 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TRAPPC8Q9Y2L5 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TRAPPC8Q9Y2L5 MRM2-201ENST00000242257 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TRAPPC8Q9Y2L5 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TRAPPC8Q9Y2L5 GDI2-203ENST00000380191 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TRAPPC8Q9Y2L5 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TRAPPC8Q9Y2L5 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TRAPPC8Q9Y2L5 AC021683.1-201ENST00000585798 1767 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TRAPPC8Q9Y2L5 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
TRAPPC8Q9Y2L5 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRAPPC8Q9Y2L5 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRAPPC8Q9Y2L5 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRAPPC8Q9Y2L5 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRAPPC8Q9Y2L5 CDK5RAP3-201ENST00000338399 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRAPPC8Q9Y2L5 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRAPPC8Q9Y2L5 OPRM1-201ENST00000229768 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRAPPC8Q9Y2L5 OPRM1-207ENST00000428397 1481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRAPPC8Q9Y2L5 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
TRAPPC8Q9Y2L5 LMNA-213ENST00000473598 2015 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRAPPC8Q9Y2L5 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRAPPC8Q9Y2L5 CRYBB3-201ENST00000215855 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRAPPC8Q9Y2L5 LIMS1-201ENST00000332345 1235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRAPPC8Q9Y2L5 MBD3L4-201ENST00000381394 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRAPPC8Q9Y2L5 ACYP2-204ENST00000422521 1115 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRAPPC8Q9Y2L5 PRR7-AS1-204ENST00000514846 543 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRAPPC8Q9Y2L5 HTATIP2-205ENST00000530266 713 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRAPPC8Q9Y2L5 NAA40-205ENST00000539656 577 ntTSL 4 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRAPPC8Q9Y2L5 SNHG25-202ENST00000582965 278 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRAPPC8Q9Y2L5 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
TRAPPC8Q9Y2L5 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRAPPC8Q9Y2L5 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
TRAPPC8Q9Y2L5 TXNDC9-201ENST00000264255 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRAPPC8Q9Y2L5 SGCA-201ENST00000262018 1432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRAPPC8Q9Y2L5 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRAPPC8Q9Y2L5 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRAPPC8Q9Y2L5 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRAPPC8Q9Y2L5 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRAPPC8Q9Y2L5 PGAP2-227ENST00000496834 1530 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRAPPC8Q9Y2L5 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRAPPC8Q9Y2L5 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRAPPC8Q9Y2L5 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TRAPPC8Q9Y2L5 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TRAPPC8Q9Y2L5 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TRAPPC8Q9Y2L5 ZNF174-201ENST00000268655 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TRAPPC8Q9Y2L5 LAIR1-209ENST00000434277 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TRAPPC8Q9Y2L5 ALDH4A1-205ENST00000538309 1940 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TRAPPC8Q9Y2L5 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TRAPPC8Q9Y2L5 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TRAPPC8Q9Y2L5 CCDC43-203ENST00000588210 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms