Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2K6

USP20, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 20, humanhuman

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Length 914 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP20Q9Y2K6 TOM1L2-205ENST00000478943 2098 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
USP20Q9Y2K6 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
USP20Q9Y2K6 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
USP20Q9Y2K6 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
USP20Q9Y2K6 AGTPBP1-208ENST00000628899 4222 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
USP20Q9Y2K6 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
USP20Q9Y2K6 SLC35A3-209ENST00000638338 2890 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
USP20Q9Y2K6 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
USP20Q9Y2K6 MCHR2-201ENST00000281806 2368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
USP20Q9Y2K6 GAL-201ENST00000265643 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
USP20Q9Y2K6 GPR148-201ENST00000309926 1267 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
USP20Q9Y2K6 SH3BGR-201ENST00000333634 1251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
USP20Q9Y2K6 CIDEC-201ENST00000336832 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
USP20Q9Y2K6 WDR54-201ENST00000348227 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
USP20Q9Y2K6 RN7SKP230-201ENST00000365642 335 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
USP20Q9Y2K6 RPF1-202ENST00000370656 724 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
USP20Q9Y2K6 CD8B2-202ENST00000417670 633 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
USP20Q9Y2K6 CIDEC-203ENST00000423850 1036 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
USP20Q9Y2K6 AL139158.2-202ENST00000428151 573 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
USP20Q9Y2K6 AP000350.4-201ENST00000433835 788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
USP20Q9Y2K6 MACROD2-AS1-201ENST00000439451 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
USP20Q9Y2K6 GOLGA2P4-201ENST00000441462 777 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
USP20Q9Y2K6 VGLL4-214ENST00000451674 938 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
USP20Q9Y2K6 CIDEC-206ENST00000455015 1123 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
USP20Q9Y2K6 CENPM-208ENST00000472374 541 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
USP20Q9Y2K6 MESTP3-201ENST00000503460 968 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
USP20Q9Y2K6 C1RL-212ENST00000545337 813 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
USP20Q9Y2K6 DPF3-210ENST00000556509 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
USP20Q9Y2K6 MAP1LC3B2-202ENST00000556529 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
USP20Q9Y2K6 AC123786.1-201ENST00000581626 661 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
USP20Q9Y2K6 PRCD-204ENST00000586148 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
USP20Q9Y2K6 SMIM24-203ENST00000587847 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
USP20Q9Y2K6 TNNT1-212ENST00000588981 1163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
USP20Q9Y2K6 A1BG-AS1-204ENST00000595302 2130 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
USP20Q9Y2K6 STXBP2-221ENST00000602355 716 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
USP20Q9Y2K6 AP000229.1-202ENST00000609365 559 ntTSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
USP20Q9Y2K6 C19orf57-201ENST00000346736 2489 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
USP20Q9Y2K6 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
USP20Q9Y2K6 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
USP20Q9Y2K6 RPP40-202ENST00000380051 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
USP20Q9Y2K6 NR1H3-203ENST00000405853 1480 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
USP20Q9Y2K6 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
USP20Q9Y2K6 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
USP20Q9Y2K6 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
USP20Q9Y2K6 HEY1-202ENST00000354724 2293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
USP20Q9Y2K6 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
USP20Q9Y2K6 EID1-201ENST00000530028 2298 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
USP20Q9Y2K6 ALG3-207ENST00000455059 1697 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
USP20Q9Y2K6 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
USP20Q9Y2K6 LDLRAD4-205ENST00000585931 2118 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
USP20Q9Y2K6 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
USP20Q9Y2K6 SIGLEC12-203ENST00000598614 1434 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
USP20Q9Y2K6 KNSTRN-202ENST00000416151 1899 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
USP20Q9Y2K6 SNRPN-202ENST00000390687 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
USP20Q9Y2K6 RABL2A-206ENST00000409842 1979 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
USP20Q9Y2K6 ANKRD30BP2-201ENST00000435744 1610 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
USP20Q9Y2K6 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
USP20Q9Y2K6 GLIPR1L2-204ENST00000550916 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
USP20Q9Y2K6 COL25A1-203ENST00000399132 2724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
USP20Q9Y2K6 ACSF2-202ENST00000427954 2251 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
USP20Q9Y2K6 API5-203ENST00000455725 2257 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
USP20Q9Y2K6 NPPC-201ENST00000295440 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
USP20Q9Y2K6 MCFD2-204ENST00000409207 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
USP20Q9Y2K6 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
USP20Q9Y2K6 RPARP-AS1-201ENST00000473970 1297 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
USP20Q9Y2K6 SNHG12-210ENST00000483436 682 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
USP20Q9Y2K6 AC092944.1-202ENST00000487238 483 ntTSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
USP20Q9Y2K6 PRSS30P-204ENST00000489864 650 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
USP20Q9Y2K6 AC108725.1-201ENST00000495472 409 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
USP20Q9Y2K6 ANAPC13-205ENST00000511751 896 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
USP20Q9Y2K6 NME2-206ENST00000513177 692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
USP20Q9Y2K6 RNF41-210ENST00000552244 716 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
USP20Q9Y2K6 AL122035.1-201ENST00000556640 550 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
USP20Q9Y2K6 AL583722.2-201ENST00000557223 663 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
USP20Q9Y2K6 DUX4L45-201ENST00000566406 1057 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
USP20Q9Y2K6 CYBA-208ENST00000567174 1085 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
USP20Q9Y2K6 PPY2P-201ENST00000582808 702 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
USP20Q9Y2K6 PPY2P-202ENST00000583761 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
USP20Q9Y2K6 SEPT9-228ENST00000590294 2816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
USP20Q9Y2K6 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
USP20Q9Y2K6 CNN3-207ENST00000545882 1902 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
USP20Q9Y2K6 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
USP20Q9Y2K6 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
USP20Q9Y2K6 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
USP20Q9Y2K6 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
USP20Q9Y2K6 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
USP20Q9Y2K6 HSPB7-202ENST00000375718 2415 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
USP20Q9Y2K6 USP35-204ENST00000530267 2419 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
USP20Q9Y2K6 ALDOA-228ENST00000627059 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
USP20Q9Y2K6 PCED1B-201ENST00000432328 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.22
USP20Q9Y2K6 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
USP20Q9Y2K6 E2F6-211ENST00000542100 3450 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
USP20Q9Y2K6 AC007686.3-201ENST00000619017 3487 ntBASIC16.46■□□□□ 0.22
USP20Q9Y2K6 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
USP20Q9Y2K6 TEX264-205ENST00000416589 1313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
USP20Q9Y2K6 GPC3-202ENST00000394299 2379 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
USP20Q9Y2K6 RNF145-212ENST00000611185 3624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
USP20Q9Y2K6 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
USP20Q9Y2K6 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
USP20Q9Y2K6 ST7L-207ENST00000369669 1743 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
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