Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULD4

BRPF3, Bromodomain and PHD finger-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRPF3Q9ULD4 MST1P2-201ENST00000457982 2291 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
BRPF3Q9ULD4 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
BRPF3Q9ULD4 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
BRPF3Q9ULD4 LDLR-202ENST00000455727 2333 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
BRPF3Q9ULD4 GPRC5C-202ENST00000392627 2988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
BRPF3Q9ULD4 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
BRPF3Q9ULD4 TCOF1-201ENST00000323668 4832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
BRPF3Q9ULD4 NEAT1-201ENST00000499732 1811 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
BRPF3Q9ULD4 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
BRPF3Q9ULD4 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
BRPF3Q9ULD4 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
BRPF3Q9ULD4 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
BRPF3Q9ULD4 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC18.38■□□□□ 0.53
BRPF3Q9ULD4 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
BRPF3Q9ULD4 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
BRPF3Q9ULD4 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
BRPF3Q9ULD4 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
BRPF3Q9ULD4 CLK4-201ENST00000316308 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
BRPF3Q9ULD4 KRT4-204ENST00000551956 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
BRPF3Q9ULD4 FLOT2-210ENST00000585169 2585 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
BRPF3Q9ULD4 ACSM1-201ENST00000307493 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
BRPF3Q9ULD4 CPT1C-202ENST00000323446 2783 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
BRPF3Q9ULD4 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
BRPF3Q9ULD4 CCR7-201ENST00000246657 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
BRPF3Q9ULD4 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
BRPF3Q9ULD4 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
BRPF3Q9ULD4 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
BRPF3Q9ULD4 XKRX-202ENST00000468904 2249 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
BRPF3Q9ULD4 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
BRPF3Q9ULD4 MICB-202ENST00000399150 2346 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
BRPF3Q9ULD4 CAP1-203ENST00000372797 3105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
BRPF3Q9ULD4 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
BRPF3Q9ULD4 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
BRPF3Q9ULD4 MYO15B-237ENST00000642007 4893 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
BRPF3Q9ULD4 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
BRPF3Q9ULD4 CALN1-201ENST00000329008 9243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
BRPF3Q9ULD4 ZNF655-201ENST00000252713 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
BRPF3Q9ULD4 CLCNKA-202ENST00000375692 2581 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
BRPF3Q9ULD4 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
BRPF3Q9ULD4 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
BRPF3Q9ULD4 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
BRPF3Q9ULD4 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
BRPF3Q9ULD4 AC002407.1-201ENST00000636668 3863 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
BRPF3Q9ULD4 AC011474.4-201ENST00000623523 2076 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
BRPF3Q9ULD4 ALAS1-204ENST00000469224 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
BRPF3Q9ULD4 WDR97-201ENST00000323662 6916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
BRPF3Q9ULD4 TSPEAR-AS2-202ENST00000354333 2422 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
BRPF3Q9ULD4 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
BRPF3Q9ULD4 CES3-202ENST00000394037 3817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
BRPF3Q9ULD4 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
BRPF3Q9ULD4 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
BRPF3Q9ULD4 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
BRPF3Q9ULD4 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
BRPF3Q9ULD4 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
BRPF3Q9ULD4 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
BRPF3Q9ULD4 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
BRPF3Q9ULD4 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
BRPF3Q9ULD4 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
BRPF3Q9ULD4 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
BRPF3Q9ULD4 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
BRPF3Q9ULD4 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
BRPF3Q9ULD4 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
BRPF3Q9ULD4 SPHK2-201ENST00000245222 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
BRPF3Q9ULD4 ENDOD1-201ENST00000278505 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
BRPF3Q9ULD4 SLC9B2-202ENST00000394785 3126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
BRPF3Q9ULD4 SLC22A20-202ENST00000525437 3196 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
BRPF3Q9ULD4 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
BRPF3Q9ULD4 CDHR5-203ENST00000397542 3489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
BRPF3Q9ULD4 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
BRPF3Q9ULD4 CPA5-205ENST00000466363 2099 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
BRPF3Q9ULD4 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
BRPF3Q9ULD4 AL590132.1-202ENST00000638983 4184 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
BRPF3Q9ULD4 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
BRPF3Q9ULD4 LINC01138-206ENST00000622328 2212 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
BRPF3Q9ULD4 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
BRPF3Q9ULD4 ZFY-201ENST00000155093 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
BRPF3Q9ULD4 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
BRPF3Q9ULD4 TRIB2-202ENST00000381465 2778 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
BRPF3Q9ULD4 MFSD2B-201ENST00000338315 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
BRPF3Q9ULD4 SCNN1A-215ENST00000540037 3040 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
BRPF3Q9ULD4 PITPNM2-202ENST00000320201 6736 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
BRPF3Q9ULD4 GAK-201ENST00000314167 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
BRPF3Q9ULD4 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
BRPF3Q9ULD4 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
BRPF3Q9ULD4 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
BRPF3Q9ULD4 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
BRPF3Q9ULD4 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
BRPF3Q9ULD4 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
BRPF3Q9ULD4 CD34-203ENST00000367036 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
BRPF3Q9ULD4 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
BRPF3Q9ULD4 CCDC57-203ENST00000392343 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
BRPF3Q9ULD4 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
BRPF3Q9ULD4 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
BRPF3Q9ULD4 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
BRPF3Q9ULD4 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
BRPF3Q9ULD4 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
BRPF3Q9ULD4 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
BRPF3Q9ULD4 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
BRPF3Q9ULD4 LILRB5-203ENST00000449561 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
BRPF3Q9ULD4 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.5 ms