Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJ41

RABGEF1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, humanhuman

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Length 708 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1Q9UJ41 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RABGEF1Q9UJ41 TKT-201ENST00000296289 1931 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RABGEF1Q9UJ41 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RABGEF1Q9UJ41 EIF4G1-206ENST00000392537 5229 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RABGEF1Q9UJ41 ELFN2-201ENST00000402918 8361 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RABGEF1Q9UJ41 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
RABGEF1Q9UJ41 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RABGEF1Q9UJ41 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RABGEF1Q9UJ41 ASTN2-206ENST00000361477 4001 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RABGEF1Q9UJ41 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RABGEF1Q9UJ41 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RABGEF1Q9UJ41 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RABGEF1Q9UJ41 WDR38-201ENST00000373574 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RABGEF1Q9UJ41 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RABGEF1Q9UJ41 SYNGR1-205ENST00000406293 564 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RABGEF1Q9UJ41 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RABGEF1Q9UJ41 AL157832.1-201ENST00000428273 495 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RABGEF1Q9UJ41 EIF2S2P3-201ENST00000428356 999 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
RABGEF1Q9UJ41 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RABGEF1Q9UJ41 GPR53P-205ENST00000457298 1084 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
RABGEF1Q9UJ41 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RABGEF1Q9UJ41 IL20RB-AS1-201ENST00000462176 562 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RABGEF1Q9UJ41 RN7SL837P-201ENST00000463010 287 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
RABGEF1Q9UJ41 DNAJC19-208ENST00000486355 828 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RABGEF1Q9UJ41 DNAJC19-209ENST00000491873 769 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RABGEF1Q9UJ41 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RABGEF1Q9UJ41 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
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RABGEF1Q9UJ41 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RABGEF1Q9UJ41 AC123567.1-201ENST00000548294 1261 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
RABGEF1Q9UJ41 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RABGEF1Q9UJ41 AC068631.1-255ENST00000608173 588 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RABGEF1Q9UJ41 BIRC2-214ENST00000621637 3331 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RABGEF1Q9UJ41 NMUR1-201ENST00000305141 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RABGEF1Q9UJ41 AC104581.4-201ENST00000623126 3052 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
RABGEF1Q9UJ41 C21orf58-202ENST00000397679 2900 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RABGEF1Q9UJ41 UBE3A-207ENST00000614096 8741 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RABGEF1Q9UJ41 NXF1-213ENST00000532297 2795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RABGEF1Q9UJ41 COL25A1-203ENST00000399132 2724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RABGEF1Q9UJ41 GRM5-205ENST00000455756 7927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RABGEF1Q9UJ41 SMARCA2-203ENST00000349721 5761 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RABGEF1Q9UJ41 POLL-206ENST00000370172 2308 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RABGEF1Q9UJ41 FGD5-AS1-202ENST00000424349 3792 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RABGEF1Q9UJ41 SNX2-201ENST00000379516 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RABGEF1Q9UJ41 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RABGEF1Q9UJ41 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
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RABGEF1Q9UJ41 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RABGEF1Q9UJ41 PPP4R4-201ENST00000304338 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RABGEF1Q9UJ41 LRRN1-201ENST00000319331 3823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
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RABGEF1Q9UJ41 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RABGEF1Q9UJ41 CEP131-208ENST00000575907 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
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RABGEF1Q9UJ41 C18orf25-206ENST00000619301 5264 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
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RABGEF1Q9UJ41 IFT20-203ENST00000395418 825 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
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RABGEF1Q9UJ41 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RABGEF1Q9UJ41 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RABGEF1Q9UJ41 ANKRD35-201ENST00000355594 3342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RABGEF1Q9UJ41 NELFA-202ENST00000382882 3343 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RABGEF1Q9UJ41 KCNC3-202ENST00000474951 3347 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RABGEF1Q9UJ41 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RABGEF1Q9UJ41 MEOX2-201ENST00000262041 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
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RABGEF1Q9UJ41 TMPRSS6-204ENST00000406856 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
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RABGEF1Q9UJ41 GPD1L-201ENST00000282541 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RABGEF1Q9UJ41 FAM8A1-201ENST00000259963 4677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
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