Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIW0

VAX2, Ventral anterior homeobox 2, humanhuman

Predictions only

Length 290 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAX2Q9UIW0 SLCO2B1-203ENST00000428359 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
VAX2Q9UIW0 EML4-203ENST00000402711 3568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
VAX2Q9UIW0 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
VAX2Q9UIW0 MAP7D3-201ENST00000316077 4567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
VAX2Q9UIW0 ARAP1-202ENST00000359373 5767 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
VAX2Q9UIW0 TCF3-201ENST00000262965 4451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
VAX2Q9UIW0 MKS1-201ENST00000313863 2091 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
VAX2Q9UIW0 UGP2-207ENST00000467648 2057 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
VAX2Q9UIW0 CNTN2-201ENST00000331830 7999 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
VAX2Q9UIW0 REV3L-207ENST00000435970 10943 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
VAX2Q9UIW0 MIR497HG-202ENST00000572453 3838 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
VAX2Q9UIW0 TRIB2-201ENST00000155926 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
VAX2Q9UIW0 ZNF536-201ENST00000355537 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
VAX2Q9UIW0 RAB18-208ENST00000611151 4931 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
VAX2Q9UIW0 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
VAX2Q9UIW0 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
VAX2Q9UIW0 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
VAX2Q9UIW0 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
VAX2Q9UIW0 GMIP-201ENST00000203556 3538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
VAX2Q9UIW0 CLCN4-201ENST00000380829 2418 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
VAX2Q9UIW0 IGF2BP1-201ENST00000290341 8274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
VAX2Q9UIW0 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
VAX2Q9UIW0 SPHK2-206ENST00000598088 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
VAX2Q9UIW0 MED14-201ENST00000324817 7984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
VAX2Q9UIW0 ITPR2-202ENST00000381340 11405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
VAX2Q9UIW0 TRIM11-204ENST00000493030 5774 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
VAX2Q9UIW0 APBB1-203ENST00000389906 2684 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
VAX2Q9UIW0 SUSD6-201ENST00000342745 5388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
VAX2Q9UIW0 AP1B1-201ENST00000317368 3903 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
VAX2Q9UIW0 CYP26B1-201ENST00000001146 4732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
VAX2Q9UIW0 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
VAX2Q9UIW0 RPARP-AS1-202ENST00000492465 1556 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
VAX2Q9UIW0 OLFML2A-203ENST00000373580 6425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
VAX2Q9UIW0 GIPR-205ENST00000590918 3289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
VAX2Q9UIW0 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
VAX2Q9UIW0 UCN2-201ENST00000273610 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
VAX2Q9UIW0 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
VAX2Q9UIW0 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
VAX2Q9UIW0 PCDHGA3-201ENST00000253812 4771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
VAX2Q9UIW0 JUN-201ENST00000371222 3540 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
VAX2Q9UIW0 CPNE5-201ENST00000244751 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
VAX2Q9UIW0 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
VAX2Q9UIW0 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
VAX2Q9UIW0 GSTCD-206ENST00000507281 2091 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
VAX2Q9UIW0 ELAC2-201ENST00000338034 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
VAX2Q9UIW0 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
VAX2Q9UIW0 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
VAX2Q9UIW0 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
VAX2Q9UIW0 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
VAX2Q9UIW0 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
VAX2Q9UIW0 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
VAX2Q9UIW0 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
VAX2Q9UIW0 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC11.84□□□□□ -0.51
VAX2Q9UIW0 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
VAX2Q9UIW0 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
VAX2Q9UIW0 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
VAX2Q9UIW0 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
VAX2Q9UIW0 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
VAX2Q9UIW0 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
VAX2Q9UIW0 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
VAX2Q9UIW0 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
VAX2Q9UIW0 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
VAX2Q9UIW0 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
VAX2Q9UIW0 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
VAX2Q9UIW0 KCNJ9-201ENST00000368088 4170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
VAX2Q9UIW0 CACNA1G-233ENST00000515765 6981 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
VAX2Q9UIW0 ADD2-202ENST00000355733 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
VAX2Q9UIW0 IFITM10-201ENST00000340134 3706 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
VAX2Q9UIW0 COL6A1-207ENST00000612273 3251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
VAX2Q9UIW0 LRSAM1-203ENST00000373322 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
VAX2Q9UIW0 GOPC-202ENST00000368498 4450 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
VAX2Q9UIW0 RRAGD-201ENST00000359203 4042 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
VAX2Q9UIW0 NTNG1-204ENST00000370067 4628 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
VAX2Q9UIW0 ANKMY1-208ENST00000405002 3304 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
VAX2Q9UIW0 AC012349.1-201ENST00000518662 2643 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
VAX2Q9UIW0 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
VAX2Q9UIW0 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
VAX2Q9UIW0 ABCB9-203ENST00000346530 3399 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
VAX2Q9UIW0 TMEM201-201ENST00000340305 3851 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
VAX2Q9UIW0 SFRP1-202ENST00000379845 3873 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
VAX2Q9UIW0 CREB3L4-204ENST00000368603 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
VAX2Q9UIW0 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
VAX2Q9UIW0 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
VAX2Q9UIW0 TIPARP-201ENST00000295924 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
VAX2Q9UIW0 NSD2-203ENST00000382888 2666 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
VAX2Q9UIW0 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.51
VAX2Q9UIW0 TMUB2-211ENST00000589184 1837 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.51
VAX2Q9UIW0 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
VAX2Q9UIW0 TRMT2B-203ENST00000372939 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
VAX2Q9UIW0 RMDN1-201ENST00000406452 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
VAX2Q9UIW0 TSN-212ENST00000536142 3328 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
VAX2Q9UIW0 TMPRSS12-202ENST00000551456 3336 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
VAX2Q9UIW0 PIGT-203ENST00000372689 1971 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
VAX2Q9UIW0 TGFBR3-201ENST00000212355 6465 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
VAX2Q9UIW0 CXCL12-201ENST00000343575 1857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
VAX2Q9UIW0 NUP160-201ENST00000378460 5376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
VAX2Q9UIW0 ZHX1-202ENST00000395571 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
VAX2Q9UIW0 CNGA3-204ENST00000409937 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
VAX2Q9UIW0 COG6-202ENST00000416691 5257 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
VAX2Q9UIW0 UHMK1-203ENST00000538489 8446 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.8 ms