Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHC6

CNTNAP2, Contactin-associated protein-like 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTNAP2Q9UHC6 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CNTNAP2Q9UHC6 AC020910.5-201ENST00000623668 1865 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CNTNAP2Q9UHC6 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CNTNAP2Q9UHC6 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CNTNAP2Q9UHC6 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CNTNAP2Q9UHC6 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CNTNAP2Q9UHC6 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CNTNAP2Q9UHC6 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CNTNAP2Q9UHC6 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CNTNAP2Q9UHC6 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CNTNAP2Q9UHC6 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CNTNAP2Q9UHC6 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CNTNAP2Q9UHC6 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CNTNAP2Q9UHC6 HIST1H2AD-201ENST00000341023 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CNTNAP2Q9UHC6 AL022323.1-201ENST00000366110 957 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CNTNAP2Q9UHC6 TANGO2-205ENST00000401886 1559 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CNTNAP2Q9UHC6 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CNTNAP2Q9UHC6 LIMS4-201ENST00000413601 1215 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CNTNAP2Q9UHC6 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CNTNAP2Q9UHC6 AL162742.1-201ENST00000434792 954 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CNTNAP2Q9UHC6 PRSS30P-204ENST00000489864 650 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CNTNAP2Q9UHC6 CALD1-222ENST00000495522 2199 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CNTNAP2Q9UHC6 GDNF-AS1-201ENST00000503382 604 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CNTNAP2Q9UHC6 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CNTNAP2Q9UHC6 AC026495.1-203ENST00000557528 906 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CNTNAP2Q9UHC6 AC021594.1-201ENST00000587174 636 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CNTNAP2Q9UHC6 AC008537.4-201ENST00000595728 1103 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CNTNAP2Q9UHC6 KLK11-210ENST00000600362 759 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CNTNAP2Q9UHC6 AL358472.3-201ENST00000608147 415 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CNTNAP2Q9UHC6 AP000229.1-202ENST00000609365 559 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CNTNAP2Q9UHC6 PAX4-207ENST00000611453 1235 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CNTNAP2Q9UHC6 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CNTNAP2Q9UHC6 LINC01667-202ENST00000623919 1422 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CNTNAP2Q9UHC6 PRRC2B-210ENST00000638390 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CNTNAP2Q9UHC6 AC002472.3-201ENST00000640124 621 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CNTNAP2Q9UHC6 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CNTNAP2Q9UHC6 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CNTNAP2Q9UHC6 CSGALNACT1-211ENST00000522854 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CNTNAP2Q9UHC6 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CNTNAP2Q9UHC6 KRT17-201ENST00000311208 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CNTNAP2Q9UHC6 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CNTNAP2Q9UHC6 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CNTNAP2Q9UHC6 COL9A1-204ENST00000370496 1372 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CNTNAP2Q9UHC6 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CNTNAP2Q9UHC6 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CNTNAP2Q9UHC6 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CNTNAP2Q9UHC6 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CNTNAP2Q9UHC6 ABCB8-212ENST00000477719 1625 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CNTNAP2Q9UHC6 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CNTNAP2Q9UHC6 ZC3H14-204ENST00000336693 2007 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CNTNAP2Q9UHC6 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CNTNAP2Q9UHC6 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CNTNAP2Q9UHC6 PCED1B-201ENST00000432328 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CNTNAP2Q9UHC6 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CNTNAP2Q9UHC6 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CNTNAP2Q9UHC6 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CNTNAP2Q9UHC6 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CNTNAP2Q9UHC6 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CNTNAP2Q9UHC6 NCR3-201ENST00000340027 1042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CNTNAP2Q9UHC6 VCX3B-201ENST00000381029 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CNTNAP2Q9UHC6 MAPK15-203ENST00000395108 765 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CNTNAP2Q9UHC6 ALG1L2-201ENST00000425059 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CNTNAP2Q9UHC6 APOPT1-207ENST00000477116 906 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CNTNAP2Q9UHC6 AC108134.4-201ENST00000570700 302 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CNTNAP2Q9UHC6 SEPT9-233ENST00000590917 541 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CNTNAP2Q9UHC6 KC6-205ENST00000599934 556 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CNTNAP2Q9UHC6 SNX12-206ENST00000622259 661 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CNTNAP2Q9UHC6 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CNTNAP2Q9UHC6 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CNTNAP2Q9UHC6 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CNTNAP2Q9UHC6 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CNTNAP2Q9UHC6 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CNTNAP2Q9UHC6 SF1-209ENST00000433274 2317 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CNTNAP2Q9UHC6 CTCFL-210ENST00000481655 1512 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CNTNAP2Q9UHC6 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CNTNAP2Q9UHC6 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CNTNAP2Q9UHC6 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CNTNAP2Q9UHC6 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CNTNAP2Q9UHC6 EXOC7-213ENST00000467929 2260 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CNTNAP2Q9UHC6 ADPRHL1-201ENST00000356501 1877 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CNTNAP2Q9UHC6 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CNTNAP2Q9UHC6 PDP1-203ENST00000517764 2140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CNTNAP2Q9UHC6 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CNTNAP2Q9UHC6 AC245123.1-202ENST00000612422 1719 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CNTNAP2Q9UHC6 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CNTNAP2Q9UHC6 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CNTNAP2Q9UHC6 LDHAL6B-201ENST00000307144 1693 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CNTNAP2Q9UHC6 SELENOS-201ENST00000398226 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CNTNAP2Q9UHC6 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CNTNAP2Q9UHC6 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CNTNAP2Q9UHC6 TMEM184C-204ENST00000508208 1528 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CNTNAP2Q9UHC6 ENDOU-203ENST00000545824 1513 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CNTNAP2Q9UHC6 FIS1-201ENST00000223136 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CNTNAP2Q9UHC6 CSH2-201ENST00000336844 1173 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CNTNAP2Q9UHC6 CSH2-202ENST00000345366 598 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CNTNAP2Q9UHC6 MRPL23-204ENST00000397297 613 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CNTNAP2Q9UHC6 CALR4P-201ENST00000431943 946 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
CNTNAP2Q9UHC6 FGF13-204ENST00000436198 1165 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CNTNAP2Q9UHC6 AL157935.2-201ENST00000476274 1071 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CNTNAP2Q9UHC6 LILRA5-204ENST00000486742 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms