Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBK2

PPARGC1A, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma coactivator 1-alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPARGC1AQ9UBK2 TAF5-201ENST00000369839 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PPARGC1AQ9UBK2 TCP10-210ENST00000617120 2182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PPARGC1AQ9UBK2 IRF2BP2-201ENST00000366609 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PPARGC1AQ9UBK2 TMEM201-202ENST00000340381 3776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PPARGC1AQ9UBK2 DBF4-201ENST00000265728 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PPARGC1AQ9UBK2 ELP6-201ENST00000296149 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PPARGC1AQ9UBK2 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PPARGC1AQ9UBK2 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PPARGC1AQ9UBK2 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PPARGC1AQ9UBK2 PUS1-202ENST00000376649 4094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PPARGC1AQ9UBK2 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PPARGC1AQ9UBK2 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PPARGC1AQ9UBK2 UBR5-212ENST00000521922 9008 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PPARGC1AQ9UBK2 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PPARGC1AQ9UBK2 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PPARGC1AQ9UBK2 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PPARGC1AQ9UBK2 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PPARGC1AQ9UBK2 TSPAN11-201ENST00000261177 5505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PPARGC1AQ9UBK2 ENOSF1-209ENST00000580982 1397 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PPARGC1AQ9UBK2 TAF6-201ENST00000344095 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PPARGC1AQ9UBK2 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
PPARGC1AQ9UBK2 WASHC2A-202ENST00000314664 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PPARGC1AQ9UBK2 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PPARGC1AQ9UBK2 AC134312.5-201ENST00000568031 1313 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
PPARGC1AQ9UBK2 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PPARGC1AQ9UBK2 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PPARGC1AQ9UBK2 CDKN2AIP-201ENST00000302350 2646 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PPARGC1AQ9UBK2 SIDT1-201ENST00000264852 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PPARGC1AQ9UBK2 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PPARGC1AQ9UBK2 TRMT2B-201ENST00000372935 2921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PPARGC1AQ9UBK2 ALDH1B1-201ENST00000377698 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PPARGC1AQ9UBK2 TC2N-206ENST00000556018 1770 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PPARGC1AQ9UBK2 BLVRA-202ENST00000402924 1161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PPARGC1AQ9UBK2 TPM1-207ENST00000403994 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PPARGC1AQ9UBK2 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PPARGC1AQ9UBK2 SNHG11-212ENST00000449351 954 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PPARGC1AQ9UBK2 USP32P1-208ENST00000506594 1164 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
PPARGC1AQ9UBK2 LCN10-206ENST00000527229 615 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PPARGC1AQ9UBK2 AC243562.3-201ENST00000559866 1212 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PPARGC1AQ9UBK2 TMEM170A-203ENST00000566980 547 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PPARGC1AQ9UBK2 AC007611.1-201ENST00000568150 826 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PPARGC1AQ9UBK2 TUBB6-213ENST00000591909 1017 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PPARGC1AQ9UBK2 AC008735.3-201ENST00000596646 500 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
PPARGC1AQ9UBK2 AC073389.2-202ENST00000607450 441 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PPARGC1AQ9UBK2 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PPARGC1AQ9UBK2 C6orf120-201ENST00000332290 2667 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PPARGC1AQ9UBK2 MUM1-201ENST00000415183 2837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PPARGC1AQ9UBK2 C3orf62-201ENST00000343010 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PPARGC1AQ9UBK2 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PPARGC1AQ9UBK2 CYP4F3-203ENST00000586182 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PPARGC1AQ9UBK2 WDR20-203ENST00000335263 2616 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PPARGC1AQ9UBK2 ACTN2-206ENST00000542672 4906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PPARGC1AQ9UBK2 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PPARGC1AQ9UBK2 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PPARGC1AQ9UBK2 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PPARGC1AQ9UBK2 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PPARGC1AQ9UBK2 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PPARGC1AQ9UBK2 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PPARGC1AQ9UBK2 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PPARGC1AQ9UBK2 KATNBL1-201ENST00000256544 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PPARGC1AQ9UBK2 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PPARGC1AQ9UBK2 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PPARGC1AQ9UBK2 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
PPARGC1AQ9UBK2 GPR17-201ENST00000272644 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PPARGC1AQ9UBK2 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PPARGC1AQ9UBK2 NEU3-206ENST00000532963 1643 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PPARGC1AQ9UBK2 ITSN2-203ENST00000406921 4563 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PPARGC1AQ9UBK2 SLC25A36-201ENST00000324194 1301 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PPARGC1AQ9UBK2 ENO3-206ENST00000519584 1322 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PPARGC1AQ9UBK2 TAF4B-203ENST00000578121 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PPARGC1AQ9UBK2 FAM214B-202ENST00000378557 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PPARGC1AQ9UBK2 FER1L4-213ENST00000621044 2778 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PPARGC1AQ9UBK2 ESRP2-202ENST00000473183 3793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PPARGC1AQ9UBK2 AL390755.1-201ENST00000623716 2027 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
PPARGC1AQ9UBK2 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PPARGC1AQ9UBK2 KRTAP10-7-201ENST00000609664 1578 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PPARGC1AQ9UBK2 NOTCH4-201ENST00000375023 6745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PPARGC1AQ9UBK2 ARFGAP1-203ENST00000370283 3281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PPARGC1AQ9UBK2 NAT8-201ENST00000272425 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PPARGC1AQ9UBK2 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PPARGC1AQ9UBK2 MBP-203ENST00000359645 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PPARGC1AQ9UBK2 MGST3-203ENST00000367885 680 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PPARGC1AQ9UBK2 C1orf43-205ENST00000368519 1163 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PPARGC1AQ9UBK2 C10orf62-201ENST00000370640 1208 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PPARGC1AQ9UBK2 APOA1-204ENST00000375323 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PPARGC1AQ9UBK2 AC005229.1-201ENST00000392885 409 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
PPARGC1AQ9UBK2 AC005034.1-201ENST00000426657 489 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
PPARGC1AQ9UBK2 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PPARGC1AQ9UBK2 GS1-24F4.2-201ENST00000500823 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PPARGC1AQ9UBK2 AC095060.1-201ENST00000502455 549 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PPARGC1AQ9UBK2 AP001889.1-201ENST00000525414 633 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
PPARGC1AQ9UBK2 SLC25A47P1-201ENST00000531577 414 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
PPARGC1AQ9UBK2 CD4-210ENST00000541982 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PPARGC1AQ9UBK2 GCHFR-206ENST00000561160 572 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PPARGC1AQ9UBK2 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PPARGC1AQ9UBK2 C17orf62-239ENST00000585080 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PPARGC1AQ9UBK2 SLC25A39-207ENST00000586016 1156 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PPARGC1AQ9UBK2 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PPARGC1AQ9UBK2 ZSCAN30-208ENST00000592278 731 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PPARGC1AQ9UBK2 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms