Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2M1

LRP2BP, LRP2-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 347 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRP2BPQ9P2M1 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
LRP2BPQ9P2M1 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
LRP2BPQ9P2M1 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
LRP2BPQ9P2M1 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
LRP2BPQ9P2M1 CCNE1-202ENST00000357943 1641 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
LRP2BPQ9P2M1 LINC00327-203ENST00000576696 1308 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
LRP2BPQ9P2M1 SYT13-201ENST00000020926 5144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
LRP2BPQ9P2M1 RMND1-202ENST00000367303 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
LRP2BPQ9P2M1 VCX3B-201ENST00000381029 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
LRP2BPQ9P2M1 TLE1P1-201ENST00000422965 589 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
LRP2BPQ9P2M1 AL354877.1-201ENST00000424412 413 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
LRP2BPQ9P2M1 AL355994.3-201ENST00000437156 466 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
LRP2BPQ9P2M1 MRPS25-203ENST00000444840 1281 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
LRP2BPQ9P2M1 PDP1-203ENST00000517764 2140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
LRP2BPQ9P2M1 TPD52L1-208ENST00000528193 789 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
LRP2BPQ9P2M1 IRF3-223ENST00000599223 1055 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
LRP2BPQ9P2M1 RBM8A-206ENST00000632555 751 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
LRP2BPQ9P2M1 AL590644.3-201ENST00000635428 1228 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
LRP2BPQ9P2M1 KDM3A-203ENST00000409556 4928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
LRP2BPQ9P2M1 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
LRP2BPQ9P2M1 STX1A-201ENST00000222812 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
LRP2BPQ9P2M1 STX1A-204ENST00000395156 2050 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
LRP2BPQ9P2M1 BMP1-203ENST00000354870 3989 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
LRP2BPQ9P2M1 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
LRP2BPQ9P2M1 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
LRP2BPQ9P2M1 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
LRP2BPQ9P2M1 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
LRP2BPQ9P2M1 ABCC1-201ENST00000399408 6594 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
LRP2BPQ9P2M1 ABCC1-202ENST00000399410 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
LRP2BPQ9P2M1 SLC25A19-202ENST00000375261 1486 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
LRP2BPQ9P2M1 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
LRP2BPQ9P2M1 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
LRP2BPQ9P2M1 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
LRP2BPQ9P2M1 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
LRP2BPQ9P2M1 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
LRP2BPQ9P2M1 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
LRP2BPQ9P2M1 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
LRP2BPQ9P2M1 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
LRP2BPQ9P2M1 SELENOS-201ENST00000398226 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
LRP2BPQ9P2M1 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
LRP2BPQ9P2M1 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
LRP2BPQ9P2M1 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
LRP2BPQ9P2M1 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
LRP2BPQ9P2M1 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
LRP2BPQ9P2M1 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
LRP2BPQ9P2M1 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
LRP2BPQ9P2M1 PHLDB1-223ENST00000600882 5479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
LRP2BPQ9P2M1 IGHA2-202ENST00000497872 1320 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
LRP2BPQ9P2M1 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
LRP2BPQ9P2M1 MAP3K1-201ENST00000399503 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
LRP2BPQ9P2M1 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
LRP2BPQ9P2M1 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
LRP2BPQ9P2M1 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
LRP2BPQ9P2M1 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
LRP2BPQ9P2M1 C8orf74-201ENST00000304519 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
LRP2BPQ9P2M1 PAX4-201ENST00000338516 1085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
LRP2BPQ9P2M1 AGER-203ENST00000375065 665 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
LRP2BPQ9P2M1 MAPK15-203ENST00000395108 765 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
LRP2BPQ9P2M1 AC053503.1-201ENST00000429882 519 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
LRP2BPQ9P2M1 GTF2H2-204ENST00000517900 659 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
LRP2BPQ9P2M1 AC005730.2-201ENST00000564549 1184 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
LRP2BPQ9P2M1 AC093525.1-201ENST00000569317 596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
LRP2BPQ9P2M1 NAT9-222ENST00000583476 583 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
LRP2BPQ9P2M1 IFT20-214ENST00000585089 1071 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
LRP2BPQ9P2M1 DIO1-215ENST00000610607 796 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
LRP2BPQ9P2M1 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
LRP2BPQ9P2M1 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
LRP2BPQ9P2M1 PCDHA3-202ENST00000532566 4594 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
LRP2BPQ9P2M1 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
LRP2BPQ9P2M1 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
LRP2BPQ9P2M1 USP47-207ENST00000527733 4525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
LRP2BPQ9P2M1 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
LRP2BPQ9P2M1 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
LRP2BPQ9P2M1 GCNT7-201ENST00000243913 2064 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
LRP2BPQ9P2M1 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
LRP2BPQ9P2M1 COBL-203ENST00000395542 5339 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
LRP2BPQ9P2M1 KIF21A-202ENST00000361961 6601 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
LRP2BPQ9P2M1 CAMK2B-206ENST00000353625 1624 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
LRP2BPQ9P2M1 ZFPM2-206ENST00000520492 3960 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
LRP2BPQ9P2M1 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
LRP2BPQ9P2M1 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
LRP2BPQ9P2M1 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
LRP2BPQ9P2M1 AC010547.4-201ENST00000561754 1378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
LRP2BPQ9P2M1 ARHGEF28-202ENST00000296799 4424 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
LRP2BPQ9P2M1 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LRP2BPQ9P2M1 NFIX-208ENST00000587260 1537 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LRP2BPQ9P2M1 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
LRP2BPQ9P2M1 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LRP2BPQ9P2M1 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
LRP2BPQ9P2M1 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
LRP2BPQ9P2M1 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LRP2BPQ9P2M1 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LRP2BPQ9P2M1 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
LRP2BPQ9P2M1 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
LRP2BPQ9P2M1 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LRP2BPQ9P2M1 RDH5-201ENST00000257895 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LRP2BPQ9P2M1 SRP14-201ENST00000267884 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LRP2BPQ9P2M1 HNRNPA1P32-201ENST00000396326 963 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
LRP2BPQ9P2M1 ERBB3-202ENST00000411731 1027 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LRP2BPQ9P2M1 AL157935.2-201ENST00000476274 1071 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms