Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUN5

LMBRD1, Probable lysosomal cobalamin transporter, humanhuman

Predictions only

Length 540 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMBRD1Q9NUN5 MAP2K4-201ENST00000353533 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
LMBRD1Q9NUN5 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
LMBRD1Q9NUN5 WASH3P-204ENST00000558784 1644 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
LMBRD1Q9NUN5 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
LMBRD1Q9NUN5 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
LMBRD1Q9NUN5 MLF1-217ENST00000619577 2290 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
LMBRD1Q9NUN5 TGFBR3-204ENST00000465892 2908 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
LMBRD1Q9NUN5 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
LMBRD1Q9NUN5 IL3RA-201ENST00000331035 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
LMBRD1Q9NUN5 KRT36-202ENST00000393986 1707 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
LMBRD1Q9NUN5 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
LMBRD1Q9NUN5 KIAA0895L-201ENST00000290881 3550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
LMBRD1Q9NUN5 SLC22A20-202ENST00000525437 3196 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
LMBRD1Q9NUN5 AGAP5-201ENST00000374094 2394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
LMBRD1Q9NUN5 IL1RL2-201ENST00000264257 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
LMBRD1Q9NUN5 AC012349.1-201ENST00000518662 2643 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
LMBRD1Q9NUN5 CHFR-205ENST00000450056 3250 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
LMBRD1Q9NUN5 HSPA8P5-201ENST00000456928 2069 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
LMBRD1Q9NUN5 SNAP29-201ENST00000215730 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
LMBRD1Q9NUN5 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
LMBRD1Q9NUN5 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
LMBRD1Q9NUN5 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
LMBRD1Q9NUN5 LINC01864-201ENST00000587218 1661 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
LMBRD1Q9NUN5 BCAR1-208ENST00000542031 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
LMBRD1Q9NUN5 PTENP1-202ENST00000532280 3996 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
LMBRD1Q9NUN5 RMDN1-201ENST00000406452 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
LMBRD1Q9NUN5 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
LMBRD1Q9NUN5 LMO4-201ENST00000370542 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
LMBRD1Q9NUN5 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
LMBRD1Q9NUN5 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
LMBRD1Q9NUN5 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
LMBRD1Q9NUN5 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
LMBRD1Q9NUN5 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
LMBRD1Q9NUN5 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
LMBRD1Q9NUN5 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
LMBRD1Q9NUN5 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
LMBRD1Q9NUN5 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
LMBRD1Q9NUN5 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
LMBRD1Q9NUN5 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
LMBRD1Q9NUN5 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
LMBRD1Q9NUN5 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
LMBRD1Q9NUN5 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
LMBRD1Q9NUN5 KIRREL2-203ENST00000360202 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
LMBRD1Q9NUN5 AAMP-202ENST00000420660 1761 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
LMBRD1Q9NUN5 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
LMBRD1Q9NUN5 SDR16C5-202ENST00000396721 2399 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
LMBRD1Q9NUN5 NAA60-203ENST00000414063 2619 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
LMBRD1Q9NUN5 CSNK1A1P1-201ENST00000430593 2147 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
LMBRD1Q9NUN5 KIAA0513-207ENST00000567328 1873 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
LMBRD1Q9NUN5 E2F3-201ENST00000346618 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
LMBRD1Q9NUN5 LRRC8D-201ENST00000337338 3950 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
LMBRD1Q9NUN5 ACSL1-208ENST00000507295 2490 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
LMBRD1Q9NUN5 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
LMBRD1Q9NUN5 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
LMBRD1Q9NUN5 AC114271.1-201ENST00000612689 2813 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
LMBRD1Q9NUN5 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
LMBRD1Q9NUN5 TMEM63B-202ENST00000323267 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
LMBRD1Q9NUN5 ANXA9-201ENST00000368947 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
LMBRD1Q9NUN5 POTEM-201ENST00000547889 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
LMBRD1Q9NUN5 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
LMBRD1Q9NUN5 ZNF782-205ENST00000481138 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
LMBRD1Q9NUN5 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
LMBRD1Q9NUN5 MBP-204ENST00000382582 2281 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
LMBRD1Q9NUN5 CALCOCO1-218ENST00000550804 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
LMBRD1Q9NUN5 CPN2-202ENST00000429275 2008 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
LMBRD1Q9NUN5 VASH2-202ENST00000366964 2960 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
LMBRD1Q9NUN5 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
LMBRD1Q9NUN5 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
LMBRD1Q9NUN5 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
LMBRD1Q9NUN5 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
LMBRD1Q9NUN5 CFAP157-206ENST00000614677 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
LMBRD1Q9NUN5 PLCB1-218ENST00000629992 3095 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
LMBRD1Q9NUN5 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
LMBRD1Q9NUN5 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
LMBRD1Q9NUN5 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
LMBRD1Q9NUN5 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
LMBRD1Q9NUN5 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
LMBRD1Q9NUN5 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC17.23■□□□□ 0.35
LMBRD1Q9NUN5 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC17.23■□□□□ 0.35
LMBRD1Q9NUN5 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
LMBRD1Q9NUN5 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
LMBRD1Q9NUN5 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC17.23■□□□□ 0.35
LMBRD1Q9NUN5 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.23■□□□□ 0.35
LMBRD1Q9NUN5 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
LMBRD1Q9NUN5 EGR1-201ENST00000239938 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
LMBRD1Q9NUN5 PLTP-203ENST00000372431 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
LMBRD1Q9NUN5 LDHAL6A-201ENST00000280706 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
LMBRD1Q9NUN5 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
LMBRD1Q9NUN5 ACADM-202ENST00000370841 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
LMBRD1Q9NUN5 PIK3CD-206ENST00000536656 5483 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
LMBRD1Q9NUN5 PIK3CD-208ENST00000628140 5483 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
LMBRD1Q9NUN5 ZBED1-202ENST00000381222 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
LMBRD1Q9NUN5 RTEL1-205ENST00000370018 4955 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
LMBRD1Q9NUN5 ZC3H14-204ENST00000336693 2007 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
LMBRD1Q9NUN5 AC011298.1-201ENST00000407635 3398 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
LMBRD1Q9NUN5 RPS6KA1-213ENST00000526792 2596 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
LMBRD1Q9NUN5 HORMAD1-201ENST00000322343 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
LMBRD1Q9NUN5 AL662899.1-201ENST00000461287 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
LMBRD1Q9NUN5 LINC02396-202ENST00000550636 2324 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
LMBRD1Q9NUN5 NRAS-201ENST00000369535 4449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42 ms