Protein–RNA interactions for Protein: Q9NT22

EMILIN3, EMILIN-3, humanhuman

Predictions only

Length 766 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EMILIN3Q9NT22 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
EMILIN3Q9NT22 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
EMILIN3Q9NT22 THOC6-201ENST00000253952 1246 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
EMILIN3Q9NT22 HMGN3-201ENST00000275036 831 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
EMILIN3Q9NT22 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
EMILIN3Q9NT22 HMGN3-202ENST00000344726 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
EMILIN3Q9NT22 AL357558.1-201ENST00000416646 456 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
EMILIN3Q9NT22 HINT2P1-201ENST00000419438 481 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
EMILIN3Q9NT22 DLGAP4-AS1-202ENST00000433238 593 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
EMILIN3Q9NT22 PTPA-217ENST00000434095 870 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
EMILIN3Q9NT22 KLF2P1-201ENST00000447438 1042 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
EMILIN3Q9NT22 LY6G6C-202ENST00000495859 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
EMILIN3Q9NT22 NUP210P1-202ENST00000504322 710 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
EMILIN3Q9NT22 AC093831.1-201ENST00000509166 434 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
EMILIN3Q9NT22 TP53AIP1-205ENST00000531399 806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
EMILIN3Q9NT22 FAM86B1-218ENST00000534520 808 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
EMILIN3Q9NT22 AP007216.2-201ENST00000562094 299 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
EMILIN3Q9NT22 AC011447.3-201ENST00000590606 722 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
EMILIN3Q9NT22 AC243964.2-201ENST00000590796 829 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
EMILIN3Q9NT22 AL133499.1-201ENST00000596207 608 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
EMILIN3Q9NT22 AC079336.7-201ENST00000623428 1078 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
EMILIN3Q9NT22 LINC01669-205ENST00000624561 713 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
EMILIN3Q9NT22 MBD3L2B-202ENST00000637800 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
EMILIN3Q9NT22 AL805961.1-203ENST00000641078 1258 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
EMILIN3Q9NT22 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
EMILIN3Q9NT22 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
EMILIN3Q9NT22 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
EMILIN3Q9NT22 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
EMILIN3Q9NT22 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
EMILIN3Q9NT22 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
EMILIN3Q9NT22 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
EMILIN3Q9NT22 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
EMILIN3Q9NT22 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
EMILIN3Q9NT22 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
EMILIN3Q9NT22 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
EMILIN3Q9NT22 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
EMILIN3Q9NT22 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
EMILIN3Q9NT22 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
EMILIN3Q9NT22 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
EMILIN3Q9NT22 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
EMILIN3Q9NT22 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
EMILIN3Q9NT22 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
EMILIN3Q9NT22 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
EMILIN3Q9NT22 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
EMILIN3Q9NT22 TMEM170A-207ENST00000569540 2331 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
EMILIN3Q9NT22 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
EMILIN3Q9NT22 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
EMILIN3Q9NT22 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
EMILIN3Q9NT22 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
EMILIN3Q9NT22 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
EMILIN3Q9NT22 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
EMILIN3Q9NT22 HNRNPR-212ENST00000606561 1837 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
EMILIN3Q9NT22 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
EMILIN3Q9NT22 CAMKMT-203ENST00000403853 1114 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
EMILIN3Q9NT22 LINC01118-202ENST00000409912 1023 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
EMILIN3Q9NT22 TMEM243-202ENST00000423734 601 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
EMILIN3Q9NT22 PUDPP3-201ENST00000445368 636 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
EMILIN3Q9NT22 AC012618.1-201ENST00000461223 412 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
EMILIN3Q9NT22 AC018680.1-202ENST00000500324 525 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
EMILIN3Q9NT22 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
EMILIN3Q9NT22 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
EMILIN3Q9NT22 AC006518.1-201ENST00000541449 943 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
EMILIN3Q9NT22 AL160314.3-201ENST00000556041 767 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
EMILIN3Q9NT22 AC015660.1-201ENST00000560103 395 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
EMILIN3Q9NT22 SYT17-208ENST00000568433 812 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
EMILIN3Q9NT22 SNORD3B-2-202ENST00000571722 791 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
EMILIN3Q9NT22 ZNF586-206ENST00000599802 581 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
EMILIN3Q9NT22 IGHV1OR21-1-201ENST00000622028 353 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
EMILIN3Q9NT22 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
EMILIN3Q9NT22 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
EMILIN3Q9NT22 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
EMILIN3Q9NT22 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
EMILIN3Q9NT22 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
EMILIN3Q9NT22 CD27-201ENST00000266557 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
EMILIN3Q9NT22 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
EMILIN3Q9NT22 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
EMILIN3Q9NT22 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
EMILIN3Q9NT22 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
EMILIN3Q9NT22 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
EMILIN3Q9NT22 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
EMILIN3Q9NT22 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
EMILIN3Q9NT22 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
EMILIN3Q9NT22 WASH3P-204ENST00000558784 1644 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
EMILIN3Q9NT22 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
EMILIN3Q9NT22 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
EMILIN3Q9NT22 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC17.39■□□□□ 0.38
EMILIN3Q9NT22 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
EMILIN3Q9NT22 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.38
EMILIN3Q9NT22 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.38
EMILIN3Q9NT22 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
EMILIN3Q9NT22 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
EMILIN3Q9NT22 SEPT12-201ENST00000268231 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
EMILIN3Q9NT22 DDX19A-202ENST00000417604 1703 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
EMILIN3Q9NT22 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
EMILIN3Q9NT22 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
EMILIN3Q9NT22 TMEM9-204ENST00000367334 1529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
EMILIN3Q9NT22 WASHC3-201ENST00000240079 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
EMILIN3Q9NT22 SYCE2-201ENST00000293695 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
EMILIN3Q9NT22 CD8A-204ENST00000409781 597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
EMILIN3Q9NT22 MIR663AHG-201ENST00000427348 1213 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.2 ms