Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRR5

UBQLN4, Ubiquilin-4, humanhuman

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Length 601 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBQLN4Q9NRR5 AIFM1-209ENST00000535724 2468 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
UBQLN4Q9NRR5 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
UBQLN4Q9NRR5 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
UBQLN4Q9NRR5 RGPD5-202ENST00000272454 2907 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
UBQLN4Q9NRR5 SLC25A36-201ENST00000324194 1301 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
UBQLN4Q9NRR5 SNRNP27-202ENST00000409116 1339 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
UBQLN4Q9NRR5 FAM32A-201ENST00000263384 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
UBQLN4Q9NRR5 CAMK2B-206ENST00000353625 1624 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
UBQLN4Q9NRR5 AC023632.2-201ENST00000523011 1789 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
UBQLN4Q9NRR5 EGFR-206ENST00000454757 5464 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
UBQLN4Q9NRR5 DNAH14-204ENST00000366849 2215 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
UBQLN4Q9NRR5 AGAP4-208ENST00000618171 2387 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
UBQLN4Q9NRR5 ENDOD1-201ENST00000278505 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
UBQLN4Q9NRR5 MAGED2-201ENST00000218439 1958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
UBQLN4Q9NRR5 PPP2R1B-203ENST00000393055 1525 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
UBQLN4Q9NRR5 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
UBQLN4Q9NRR5 CEP63-212ENST00000513612 2903 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
UBQLN4Q9NRR5 CHD4-201ENST00000357008 6496 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
UBQLN4Q9NRR5 PPP2R5C-204ENST00000422945 4481 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
UBQLN4Q9NRR5 PKN2-201ENST00000316005 2632 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
UBQLN4Q9NRR5 STRA6-207ENST00000535552 2631 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
UBQLN4Q9NRR5 TMEM170A-207ENST00000569540 2331 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
UBQLN4Q9NRR5 ADAMTS14-202ENST00000373208 5269 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
UBQLN4Q9NRR5 MLLT3-210ENST00000630269 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
UBQLN4Q9NRR5 SPIRE1-201ENST00000309836 1877 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
UBQLN4Q9NRR5 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
UBQLN4Q9NRR5 SULT2B1-202ENST00000323090 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
UBQLN4Q9NRR5 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
UBQLN4Q9NRR5 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
UBQLN4Q9NRR5 NAT8-201ENST00000272425 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
UBQLN4Q9NRR5 NCR1-201ENST00000291890 1155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
UBQLN4Q9NRR5 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
UBQLN4Q9NRR5 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
UBQLN4Q9NRR5 NCR1-202ENST00000338835 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
UBQLN4Q9NRR5 NCR1-203ENST00000350790 739 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
UBQLN4Q9NRR5 EIF1AX-201ENST00000379593 765 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
UBQLN4Q9NRR5 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
UBQLN4Q9NRR5 AL513303.2-201ENST00000413339 536 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
UBQLN4Q9NRR5 AC105940.2-201ENST00000421055 380 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
UBQLN4Q9NRR5 TLE1P1-201ENST00000422965 589 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
UBQLN4Q9NRR5 NME2P1-201ENST00000426182 414 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
UBQLN4Q9NRR5 SIRPB2-203ENST00000444444 884 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
UBQLN4Q9NRR5 SEPT7P9-202ENST00000489259 743 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
UBQLN4Q9NRR5 AC084864.1-201ENST00000496217 305 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
UBQLN4Q9NRR5 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
UBQLN4Q9NRR5 AP001889.1-201ENST00000525414 633 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
UBQLN4Q9NRR5 SLC25A47P1-201ENST00000531577 414 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
UBQLN4Q9NRR5 SNAI3-AS1-206ENST00000569786 588 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
UBQLN4Q9NRR5 AIPL1-204ENST00000570466 1196 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
UBQLN4Q9NRR5 RN7SL48P-201ENST00000579283 293 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
UBQLN4Q9NRR5 PRCD-204ENST00000586148 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
UBQLN4Q9NRR5 AC010641.1-201ENST00000591757 529 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
UBQLN4Q9NRR5 ZSCAN30-208ENST00000592278 731 ntTSL 4 BASIC13.85□□□□□ -0.19
UBQLN4Q9NRR5 AC239798.4-201ENST00000609879 700 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
UBQLN4Q9NRR5 AC244517.11-204ENST00000624424 760 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
UBQLN4Q9NRR5 AL160035.1-201ENST00000637583 576 ntTSL 4 BASIC13.85□□□□□ -0.19
UBQLN4Q9NRR5 AC105233.6-201ENST00000642093 218 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
UBQLN4Q9NRR5 ITGAV-201ENST00000261023 7030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
UBQLN4Q9NRR5 MAP3K4-201ENST00000348824 5295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
UBQLN4Q9NRR5 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
UBQLN4Q9NRR5 TDRD10-201ENST00000368480 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
UBQLN4Q9NRR5 LANCL2-201ENST00000254770 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
UBQLN4Q9NRR5 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
UBQLN4Q9NRR5 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
UBQLN4Q9NRR5 REEP3-201ENST00000373758 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
UBQLN4Q9NRR5 SNX2-201ENST00000379516 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
UBQLN4Q9NRR5 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
UBQLN4Q9NRR5 CAVIN1-201ENST00000357037 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
UBQLN4Q9NRR5 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
UBQLN4Q9NRR5 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
UBQLN4Q9NRR5 BCAR1-202ENST00000393420 2667 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
UBQLN4Q9NRR5 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
UBQLN4Q9NRR5 SCAMP4-202ENST00000409472 2394 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
UBQLN4Q9NRR5 TMEM201-202ENST00000340381 3776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
UBQLN4Q9NRR5 FBLN7-203ENST00000409450 1394 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
UBQLN4Q9NRR5 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
UBQLN4Q9NRR5 CRHR2-208ENST00000506074 3109 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
UBQLN4Q9NRR5 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
UBQLN4Q9NRR5 CNN3-207ENST00000545882 1902 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
UBQLN4Q9NRR5 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
UBQLN4Q9NRR5 DCUN1D3-201ENST00000324344 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
UBQLN4Q9NRR5 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
UBQLN4Q9NRR5 IRF8-201ENST00000268638 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
UBQLN4Q9NRR5 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
UBQLN4Q9NRR5 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
UBQLN4Q9NRR5 ATP6AP2-211ENST00000636196 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
UBQLN4Q9NRR5 GSN-203ENST00000373808 2664 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
UBQLN4Q9NRR5 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
UBQLN4Q9NRR5 C20orf202-201ENST00000400633 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
UBQLN4Q9NRR5 ABCB8-212ENST00000477719 1625 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
UBQLN4Q9NRR5 TIFA-201ENST00000361717 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
UBQLN4Q9NRR5 NINJ2-201ENST00000305108 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
UBQLN4Q9NRR5 C1QB-201ENST00000314933 1044 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
UBQLN4Q9NRR5 S100A16-201ENST00000368703 946 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
UBQLN4Q9NRR5 GABARAPL2-201ENST00000037243 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
UBQLN4Q9NRR5 GRAP-202ENST00000395635 834 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
UBQLN4Q9NRR5 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
UBQLN4Q9NRR5 LINC01759-201ENST00000412639 985 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
UBQLN4Q9NRR5 COX5BP8-201ENST00000416911 349 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
UBQLN4Q9NRR5 AC099552.2-201ENST00000418523 456 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
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