Protein–RNA interactions for Protein: Q9HD26

GOPC, Golgi-associated PDZ and coiled-coil motif-containing protein, humanhuman

Predictions only

Length 462 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOPCQ9HD26 YIPF3-202ENST00000372422 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
GOPCQ9HD26 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
GOPCQ9HD26 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
GOPCQ9HD26 WDR45-224ENST00000485908 1301 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
GOPCQ9HD26 ECSIT-209ENST00000591104 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
GOPCQ9HD26 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
GOPCQ9HD26 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
GOPCQ9HD26 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
GOPCQ9HD26 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
GOPCQ9HD26 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
GOPCQ9HD26 SLC2A13-201ENST00000280871 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
GOPCQ9HD26 CAMKK2-203ENST00000347034 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
GOPCQ9HD26 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
GOPCQ9HD26 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
GOPCQ9HD26 CEP170B-204ENST00000556508 6683 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
GOPCQ9HD26 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
GOPCQ9HD26 TSPO-201ENST00000329563 955 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
GOPCQ9HD26 FAM24B-202ENST00000368898 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
GOPCQ9HD26 SMS-201ENST00000379404 1174 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
GOPCQ9HD26 AC007952.1-202ENST00000399083 1173 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
GOPCQ9HD26 AL021707.3-201ENST00000418803 527 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
GOPCQ9HD26 AL450469.2-201ENST00000427132 499 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
GOPCQ9HD26 FNTAP2-201ENST00000430308 634 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
GOPCQ9HD26 MACROD2-AS1-202ENST00000455291 663 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
GOPCQ9HD26 TSPO-206ENST00000583777 636 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
GOPCQ9HD26 AL445288.1-201ENST00000610846 654 ntTSL 4 BASIC17.48■□□□□ 0.39
GOPCQ9HD26 STPG3-204ENST00000611378 1015 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
GOPCQ9HD26 AL023803.2-201ENST00000620080 638 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
GOPCQ9HD26 AC106017.2-201ENST00000631194 1173 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
GOPCQ9HD26 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
GOPCQ9HD26 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
GOPCQ9HD26 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
GOPCQ9HD26 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
GOPCQ9HD26 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
GOPCQ9HD26 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
GOPCQ9HD26 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
GOPCQ9HD26 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
GOPCQ9HD26 CNTNAP3-202ENST00000358144 4885 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
GOPCQ9HD26 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
GOPCQ9HD26 INE2-201ENST00000630399 1874 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
GOPCQ9HD26 NR4A3-201ENST00000330847 4982 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
GOPCQ9HD26 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
GOPCQ9HD26 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
GOPCQ9HD26 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
GOPCQ9HD26 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
GOPCQ9HD26 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
GOPCQ9HD26 RNASEH2B-202ENST00000422660 4830 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
GOPCQ9HD26 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GOPCQ9HD26 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
GOPCQ9HD26 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
GOPCQ9HD26 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GOPCQ9HD26 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
GOPCQ9HD26 PIK3CD-206ENST00000536656 5483 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
GOPCQ9HD26 PIK3CD-208ENST00000628140 5483 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
GOPCQ9HD26 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GOPCQ9HD26 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
GOPCQ9HD26 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
GOPCQ9HD26 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
GOPCQ9HD26 ALPL-207ENST00000540617 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
GOPCQ9HD26 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GOPCQ9HD26 GDF11-201ENST00000257868 8657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GOPCQ9HD26 C18orf25-206ENST00000619301 5264 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GOPCQ9HD26 SERF2-209ENST00000409646 559 ntTSL 4 BASIC17.47■□□□□ 0.39
GOPCQ9HD26 AC022903.1-201ENST00000579327 469 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
GOPCQ9HD26 AL590644.3-201ENST00000635428 1228 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
GOPCQ9HD26 KRT8P29-201ENST00000420409 1371 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
GOPCQ9HD26 OSCP1-204ENST00000433045 1381 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
GOPCQ9HD26 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
GOPCQ9HD26 MRFAP1-202ENST00000382581 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GOPCQ9HD26 PSMD13-215ENST00000621534 1572 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
GOPCQ9HD26 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
GOPCQ9HD26 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GOPCQ9HD26 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GOPCQ9HD26 EXOC7-213ENST00000467929 2260 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
GOPCQ9HD26 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GOPCQ9HD26 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GOPCQ9HD26 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GOPCQ9HD26 PAK4-208ENST00000599386 5735 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GOPCQ9HD26 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GOPCQ9HD26 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
GOPCQ9HD26 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GOPCQ9HD26 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
GOPCQ9HD26 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
GOPCQ9HD26 KRT17-201ENST00000311208 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GOPCQ9HD26 METTL6-201ENST00000383789 1413 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
GOPCQ9HD26 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
GOPCQ9HD26 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GOPCQ9HD26 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
GOPCQ9HD26 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
GOPCQ9HD26 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
GOPCQ9HD26 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
GOPCQ9HD26 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
GOPCQ9HD26 ELFN2-201ENST00000402918 8361 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.46■□□□□ 0.39
GOPCQ9HD26 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
GOPCQ9HD26 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
GOPCQ9HD26 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
GOPCQ9HD26 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
GOPCQ9HD26 FAM83A-201ENST00000276699 1858 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
GOPCQ9HD26 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
GOPCQ9HD26 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
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