Protein–RNA interactions for Protein: Q9H4D5

NXF3, Nuclear RNA export factor 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NXF3Q9H4D5 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NXF3Q9H4D5 SLC38A5-213ENST00000620913 1993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NXF3Q9H4D5 ACTA1-202ENST00000366684 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NXF3Q9H4D5 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NXF3Q9H4D5 GLT1D1-201ENST00000281703 2725 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NXF3Q9H4D5 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NXF3Q9H4D5 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NXF3Q9H4D5 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NXF3Q9H4D5 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NXF3Q9H4D5 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NXF3Q9H4D5 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NXF3Q9H4D5 ASB3-202ENST00000394717 1734 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NXF3Q9H4D5 AC004899.1-201ENST00000424687 1714 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
NXF3Q9H4D5 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NXF3Q9H4D5 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NXF3Q9H4D5 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NXF3Q9H4D5 MVB12B-206ENST00000489637 2666 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NXF3Q9H4D5 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NXF3Q9H4D5 ACOT7-203ENST00000377845 1432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NXF3Q9H4D5 CHAT-212ENST00000640822 1412 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NXF3Q9H4D5 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NXF3Q9H4D5 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NXF3Q9H4D5 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NXF3Q9H4D5 PDZK1IP1-201ENST00000294338 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NXF3Q9H4D5 RBM38-204ENST00000371219 760 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NXF3Q9H4D5 DEF8-202ENST00000418391 852 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NXF3Q9H4D5 KLF2P1-201ENST00000447438 1042 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
NXF3Q9H4D5 SEPT7P2-209ENST00000450436 601 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NXF3Q9H4D5 IGHJ2P-201ENST00000454480 60 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
NXF3Q9H4D5 MACROD2-AS1-202ENST00000455291 663 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NXF3Q9H4D5 AC005740.2-201ENST00000511085 419 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
NXF3Q9H4D5 RCE1-204ENST00000525356 1270 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NXF3Q9H4D5 AP003065.1-201ENST00000540912 562 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NXF3Q9H4D5 ZNF385A-213ENST00000551771 1111 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NXF3Q9H4D5 NRN1L-202ENST00000576147 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NXF3Q9H4D5 AC145343.1-201ENST00000579629 650 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NXF3Q9H4D5 LGALS3BP-202ENST00000585407 936 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NXF3Q9H4D5 FBXL12-204ENST00000586469 544 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NXF3Q9H4D5 PCBP2-OT1-201ENST00000634357 590 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
NXF3Q9H4D5 LINC00665-203ENST00000438368 1863 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NXF3Q9H4D5 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NXF3Q9H4D5 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NXF3Q9H4D5 CPSF7-205ENST00000439958 3524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NXF3Q9H4D5 RUBCNL-212ENST00000631139 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NXF3Q9H4D5 RBFOX2-201ENST00000262829 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NXF3Q9H4D5 RABEPK-201ENST00000259460 1313 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NXF3Q9H4D5 RHD-204ENST00000417538 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NXF3Q9H4D5 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NXF3Q9H4D5 SERPING1-204ENST00000378324 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NXF3Q9H4D5 CALCR-203ENST00000394441 1774 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NXF3Q9H4D5 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NXF3Q9H4D5 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NXF3Q9H4D5 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NXF3Q9H4D5 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NXF3Q9H4D5 TOM1L2-205ENST00000478943 2098 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NXF3Q9H4D5 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NXF3Q9H4D5 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NXF3Q9H4D5 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NXF3Q9H4D5 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NXF3Q9H4D5 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
NXF3Q9H4D5 AC244394.1-201ENST00000435000 1665 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
NXF3Q9H4D5 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NXF3Q9H4D5 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NXF3Q9H4D5 TMBIM1-201ENST00000258412 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NXF3Q9H4D5 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NXF3Q9H4D5 TPRKB-202ENST00000318190 819 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NXF3Q9H4D5 DPM3-202ENST00000368399 517 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
NXF3Q9H4D5 HIST2H2AA3-201ENST00000369159 549 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NXF3Q9H4D5 LINC02158-201ENST00000432377 897 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NXF3Q9H4D5 TUBB8P8-201ENST00000458717 1058 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
NXF3Q9H4D5 PRSS30P-202ENST00000475030 752 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NXF3Q9H4D5 ALG3P1-201ENST00000508806 1114 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
NXF3Q9H4D5 ADM-202ENST00000524948 584 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NXF3Q9H4D5 NAPSB-201ENST00000525179 678 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NXF3Q9H4D5 AC125603.3-201ENST00000550742 486 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NXF3Q9H4D5 AL445483.1-201ENST00000568695 736 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NXF3Q9H4D5 NDUFV2P1-201ENST00000596415 907 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
NXF3Q9H4D5 RPS5-209ENST00000601521 1203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NXF3Q9H4D5 HIST2H2AA4-201ENST00000607355 564 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NXF3Q9H4D5 AL021578.1-201ENST00000613646 709 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
NXF3Q9H4D5 MEF2C-227ENST00000626391 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NXF3Q9H4D5 MEF2C-231ENST00000628656 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NXF3Q9H4D5 LINC00854-216ENST00000636331 718 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NXF3Q9H4D5 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NXF3Q9H4D5 ECSIT-201ENST00000252440 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NXF3Q9H4D5 EHF-212ENST00000533754 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NXF3Q9H4D5 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NXF3Q9H4D5 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NXF3Q9H4D5 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NXF3Q9H4D5 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NXF3Q9H4D5 RSPO1-202ENST00000401068 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NXF3Q9H4D5 FAM83A-201ENST00000276699 1858 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NXF3Q9H4D5 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NXF3Q9H4D5 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NXF3Q9H4D5 CALD1-206ENST00000424922 2124 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NXF3Q9H4D5 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NXF3Q9H4D5 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NXF3Q9H4D5 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NXF3Q9H4D5 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NXF3Q9H4D5 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.9 ms