Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXC9

BBS2, Bardet-Biedl syndrome 2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 721 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BBS2Q9BXC9 AL160290.2-201ENST00000448347 831 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
BBS2Q9BXC9 ZNF789-204ENST00000448667 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
BBS2Q9BXC9 AL450003.2-201ENST00000450445 428 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
BBS2Q9BXC9 APOA2-204ENST00000464492 530 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
BBS2Q9BXC9 FBXL8-208ENST00000521920 574 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
BBS2Q9BXC9 NCK2-206ENST00000522586 490 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
BBS2Q9BXC9 RNF41-210ENST00000552244 716 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
BBS2Q9BXC9 LINC00479-204ENST00000589300 718 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
BBS2Q9BXC9 AC011495.3-201ENST00000596472 427 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
BBS2Q9BXC9 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
BBS2Q9BXC9 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
BBS2Q9BXC9 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
BBS2Q9BXC9 PPP1R26-204ENST00000604351 4640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
BBS2Q9BXC9 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
BBS2Q9BXC9 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
BBS2Q9BXC9 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
BBS2Q9BXC9 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
BBS2Q9BXC9 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
BBS2Q9BXC9 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
BBS2Q9BXC9 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BBS2Q9BXC9 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BBS2Q9BXC9 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
BBS2Q9BXC9 CRISPLD2-203ENST00000564567 1651 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BBS2Q9BXC9 KIF22-208ENST00000569382 2020 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
BBS2Q9BXC9 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
BBS2Q9BXC9 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BBS2Q9BXC9 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BBS2Q9BXC9 SBF1P1-201ENST00000444527 5631 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
BBS2Q9BXC9 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
BBS2Q9BXC9 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
BBS2Q9BXC9 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
BBS2Q9BXC9 AL022323.1-201ENST00000366110 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BBS2Q9BXC9 BUD31-202ENST00000403633 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BBS2Q9BXC9 AL136309.1-201ENST00000403917 691 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
BBS2Q9BXC9 AL589986.1-201ENST00000429230 789 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
BBS2Q9BXC9 PTPA-218ENST00000435132 618 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
BBS2Q9BXC9 AC010745.3-201ENST00000439745 415 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
BBS2Q9BXC9 HIST2H2BB-201ENST00000449108 381 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
BBS2Q9BXC9 AC004898.1-201ENST00000451057 766 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
BBS2Q9BXC9 CHMP2B-205ENST00000494980 1175 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
BBS2Q9BXC9 BTNL8-205ENST00000505126 1294 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
BBS2Q9BXC9 PAX5-211ENST00000522003 1019 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BBS2Q9BXC9 AL163636.1-201ENST00000554286 915 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
BBS2Q9BXC9 RPL28-208ENST00000559463 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BBS2Q9BXC9 NAT9-222ENST00000583476 583 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
BBS2Q9BXC9 AC021594.1-201ENST00000587174 636 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
BBS2Q9BXC9 IRF3-223ENST00000599223 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BBS2Q9BXC9 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BBS2Q9BXC9 GOPC-203ENST00000535237 4460 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BBS2Q9BXC9 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
BBS2Q9BXC9 CAP2-206ENST00000489374 1430 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
BBS2Q9BXC9 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
BBS2Q9BXC9 C5orf30-202ENST00000510890 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
BBS2Q9BXC9 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BBS2Q9BXC9 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BBS2Q9BXC9 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BBS2Q9BXC9 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BBS2Q9BXC9 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BBS2Q9BXC9 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
BBS2Q9BXC9 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
BBS2Q9BXC9 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BBS2Q9BXC9 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BBS2Q9BXC9 EXT1-201ENST00000378204 8270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BBS2Q9BXC9 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
BBS2Q9BXC9 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
BBS2Q9BXC9 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
BBS2Q9BXC9 AC239800.3-201ENST00000424684 5243 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
BBS2Q9BXC9 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BBS2Q9BXC9 RUNX1T1-246ENST00000523629 7537 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
BBS2Q9BXC9 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BBS2Q9BXC9 PER2-201ENST00000254657 6385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BBS2Q9BXC9 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BBS2Q9BXC9 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BBS2Q9BXC9 PITPNM3-201ENST00000262483 7086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BBS2Q9BXC9 C9orf24-201ENST00000297623 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BBS2Q9BXC9 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BBS2Q9BXC9 CLRN1-203ENST00000328863 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BBS2Q9BXC9 HIST1H2AJ-201ENST00000333151 387 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
BBS2Q9BXC9 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BBS2Q9BXC9 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BBS2Q9BXC9 C9orf24-205ENST00000379133 712 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BBS2Q9BXC9 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
BBS2Q9BXC9 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BBS2Q9BXC9 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
BBS2Q9BXC9 AC053503.1-201ENST00000429882 519 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
BBS2Q9BXC9 POM121L10P-201ENST00000436994 1285 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
BBS2Q9BXC9 C14orf178-202ENST00000439131 632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BBS2Q9BXC9 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BBS2Q9BXC9 APOPT1-207ENST00000477116 906 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
BBS2Q9BXC9 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
BBS2Q9BXC9 C12orf49-204ENST00000548356 923 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
BBS2Q9BXC9 DHRS7C-202ENST00000571134 984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BBS2Q9BXC9 AC110285.3-201ENST00000574472 665 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
BBS2Q9BXC9 LINC00621-201ENST00000577004 1177 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
BBS2Q9BXC9 RPS15-202ENST00000585665 467 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
BBS2Q9BXC9 SEPT9-233ENST00000590917 541 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
BBS2Q9BXC9 AC008537.4-201ENST00000595728 1103 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
BBS2Q9BXC9 AC245123.1-202ENST00000612422 1719 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
BBS2Q9BXC9 AP001002.3-201ENST00000623482 206 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
BBS2Q9BXC9 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms